CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : CodonNum = 1206 & Codon = tTg

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp31206S1206LS2024LnonsyntCgtTg663966350.9993986335-6337

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg66356639All0.001269
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg16241624B.1.1.70.001454
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg874874AY.40.00136
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg395395AY.430.00175
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg316318B.1.20.002782
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg234234P.1.140.011185
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg215215B.1.617.20.00081
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg199199AY.30.001979
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg172172AY.250.001035
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg154154B.1.10.002794
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg153153AY.390.003781
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg136136P.10.002143
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg131131AY.440.000797
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg123123B.1.1770.00162
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg119119B.1.1600.003711
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg114114AY.470.003546
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg8080AY.1030.000497
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg7878B.1.5260.001833
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg7171B.10.00065
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg5656B.1.1.2220.011424
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg5050AY.1180.003132
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg4646B.1.177.810.008709
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg4343B.1.177.170.035304
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg4040B.1.1.5190.001588
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg4040B.1.4290.000941
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg3737B.1.2210.002628
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg3535B.1.3510.00104
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg3232B.1.416.10.05
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg3131AY.1190.001095
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg2727AY.260.000764
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg2626AY.1000.001196
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg2525B.1.4270.001262
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg2222AY.1020.000583
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg2222AY.290.000347
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg2222AY.420.000885
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg2222B.1.2430.001531
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg2121AY.1200.000781
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg2121B.1.1.1450.777778
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg2121B.1.1.3160.019426
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg1818AY.230.001255
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg1818AY.3.10.001535
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg1818AY.360.002668
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg1818AY.50.000372
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg1818B.1.1810.352941
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg1818B.1.6210.001593
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg1818C.370.002089
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg1717AY.330.001135
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg1515AY.1170.001268
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg1515AY.4.20.000325
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg1414AY.46.60.001011
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg1313AD.20.002847
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg1313B.1.2380.19403
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg1313Q.30.001885
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg1212B.1.1.280.003735
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg1212B.1.1.3170.00494
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg1212B.1.3770.054795
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg1212B.1.5640.005111
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg1111AY.39.10.000436
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg1111AY.670.005107
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg1111AY.98.10.000533
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg1010AY.4.2.10.00149
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg1010AY.790.012107
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg1010B.1.1.1760.004394
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg99AY.610.000943
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg99AY.9.20.000331
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg99B.1.2400.00194
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg99B.1.5960.000784
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg88B.1.177.210.000612
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg88B.1.6280.002819
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg77AY.200.000272
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg77AY.750.000392
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg77AY.99.20.000645
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg77B.1.177.330.011513
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg77B.1.3780.047945
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg77B.1.5250.000792
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg77B.1.6200.006623
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg66AY.1060.002009
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg66B.1.1.2140.000333
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg66B.1.466.20.002347
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg66R.10.00054
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg55AE.80.002445
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg45AY.1210.000541
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg55AY.140.00044
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg55AY.450.000608
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg55AY.5.40.001384
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg55AY.980.000395
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg55B.1.1.370.000964
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg55B.1.1.390.002548
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg55B.1.177.650.003327
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg55B.1.214.20.002998
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg55B.1.6370.000365
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg55P.1.120.00242
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg55Q.10.000632
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg44AY.120.001264
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg44AY.60.000165
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg44AY.75.10.000721
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg44AY.950.003044
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg44B0.000511
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg44B.1.1.5000.08
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg44B.1.177.400.020619
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg44B.1.2060.003263
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg44B.1.3690.001141
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg44B.1.3960.002823
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg33AY.130.000483
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg33AY.46.50.000595
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg33AY.480.001395
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg33AY.560.004815
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg33AY.640.001786
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg33AY.90.000203
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg33AY.9.10.000251
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg33B.1.1.1740.010135
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg33B.1.1.2550.009091
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg33B.1.1.2840.000322
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg33B.1.1.4870.01676
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg33B.1.177.860.00055
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg33B.1.2340.000396
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg33B.1.2580.0002
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg33B.1.3110.000824
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg33B.1.4970.000944
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg33B.1.5900.013636
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg33D.20.000225
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg33P.1.60.005837
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg33P.1.70.000958
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg33P.20.00056
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22A.2.5.10.009615
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22A.210.00554
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22AY.1080.002205
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22AY.240.000862
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22AY.270.000129
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22AY.29.10.000441
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22AY.340.000194
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22AY.34.10.00102
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22AY.370.000632
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22AY.4.50.000215
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22AY.460.000208
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22AY.590.001059
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22AY.740.000231
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22AY.840.000875
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22AY.900.001369
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22AY.920.000575
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22B.1.1.2040.006079
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22B.1.1.2160.001781
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22B.1.1.3620.011236
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22B.1.1.4190.014815
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22B.1.1.4200.002012
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22B.1.177.520.003515
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22B.1.177.600.000437
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22B.1.177.830.002963
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22B.1.258.170.000208
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22B.1.351.20.000605
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22B.1.36.190.018519
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22B.1.36.290.001035
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22B.1.36.70.008
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22B.1.4080.00738
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22B.1.4360.002058
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22B.1.4560.006536
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22B.1.4660.046512
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22B.1.4890.086957
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22B.1.617.10.000258
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22B.1.6270.00404
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22C.130.051282
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22P.1.10.000635
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22P.1.170.000324
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22P.1.80.009569
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22P.70.008734
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg22Q.40.00091
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11A.2.50.000499
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11A.270.001656
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11AJ.10.045455
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11AU.10.001266
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11AY.10.000396
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11AY.1090.00074
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11AY.1140.000231
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11AY.120.10.000321
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11AY.320.000532
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11AY.4.40.000409
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11AY.500.000799
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11AY.540.000095
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11AY.620.000436
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11AY.70.000196
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11AY.7.20.000559
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11AY.700.000209
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11AY.710.000475
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11AY.730.000665
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11AY.760.004831
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11AY.910.00073
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11AZ.10.000867
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11B.1.1.100.001115
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11B.1.1.1690.018182
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11B.1.1.1980.001468
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11B.1.1.2070.001182
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11B.1.1.2170.003636
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11B.1.1.2630.001558
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11B.1.1.2990.012195
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11B.1.1.3000.010753
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11B.1.1.3080.011765
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11B.1.1.3100.015152
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11B.1.1.3510.002793
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11B.1.1.3720.000689
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11B.1.1.3740.002375
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11B.1.1.3760.005952
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11B.1.1.3970.002252
ORF1ab/nsp31206S1206LtCgtTg11B.1.1.4090.002833
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