CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : CodonNum = 106 & Codon = CtT

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3106F106LF924LnonsynTtCCtT1241110.8951613035-3037

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3106F106LTtCCtT111124All0.000021
ORF1ab/nsp3106F106LTtCCtT5454B.1.1.70.000048
ORF1ab/nsp3106F106LTtCCtT2121AY.1180.001316
ORF1ab/nsp3106F106LTtCCtT27P.10.000032
ORF1ab/nsp3106F106LTtCCtT44B.10.000037
ORF1ab/nsp3106F106LTtCCtT24B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp3106F106LTtCCtT33B.1.10.000054
ORF1ab/nsp3106F106LTtCCtT22AY.40.000003
ORF1ab/nsp3106F106LTtCCtT22AY.440.000012
ORF1ab/nsp3106F106LTtCCtT22AY.610.00021
ORF1ab/nsp3106F106LTtCCtT22B.1.1.700.000682
ORF1ab/nsp3106F106LTtCCtT12B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp3106F106LTtCCtT22D.20.00015
ORF1ab/nsp3106F106LTtCCtT22Q.40.00091
ORF1ab/nsp3106F106LTtCCtT11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp3106F106LTtCCtT11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp3106F106LTtCCtT11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp3106F106LTtCCtT11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp3106F106LTtCCtT11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp3106F106LTtCCtT11B.1.177.160.000664
ORF1ab/nsp3106F106LTtCCtT11B.1.177.180.00116
ORF1ab/nsp3106F106LTtCCtT11B.1.177.430.001477
ORF1ab/nsp3106F106LTtCCtT11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp3106F106LTtCCtT11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp3106F106LTtCCtT11B.1.4260.001009
ORF1ab/nsp3106F106LTtCCtT11P.1.140.000048