CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : Mut = Y316C

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2316Y316CY496CnonsyntAttGt211021080.9990521751-1753
ORF1ab/nsp2316Y316CY496CnonsyntATtGC211020.0009478671751-1753

Details of the mutation Y316C within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt21082110All0.000403
ORF1ab/nsp2316Y316CtATtGC22110All0
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt16301630Q.21
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt176176P.30.280702
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt8080B.1.1.70.000072
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt3535B.1.1.5190.00139
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt2121AY.1030.00013
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt1818AY.440.00011
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt1515AY.40.000023
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt1212P.1.170.001941
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt1111B.1.617.20.000041
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt99P.10.000142
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt77AY.250.000042
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt77B.1.20.000062
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt66P.20.00112
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt350.166667
ORF1ab/nsp2316Y316CtATtGC250.111111
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt55AY.430.000022
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt55AY.46.60.000361
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt44AY.390.000099
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt44B.1.10.000073
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt44B.1.2340.000528
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt44B.1.5260.000094
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt33AY.1000.000138
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt33AY.260.000085
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt33AY.270.000194
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt33AY.39.10.000119
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt33Q.40.001364
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt22AY.1110.000366
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt22AY.30.00002
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt22AY.450.000243
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt22AY.46.40.000329
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt22B.10.000018
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt22B.1.1.3180.000604
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt22B.1.5950.000522
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt11AY.1050.000643
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt11AY.200.000039
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt11AY.350.000233
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt11AY.370.000316
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt11AY.460.000104
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt11AY.470.000031
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt11AY.620.000436
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt11AY.7.10.000113
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt11B.1.1.440.00241
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt11P.1.10.000318
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt11Q.30.000145
ORF1ab/nsp2316Y316CtAttGt11R.10.00009