CoV-GLUEGenomeCountriesLineagesMutationsInsertionsDeletionsUpdated:

CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : Mut = S263S

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2263S263SS443SsyntcCtcT16597162670.9801171592-1594
ORF1ab/nsp2263S263SS443SsyntcCtcA165973260.01964211592-1594
ORF1ab/nsp2263S263SS443SsyntcCtcG1659740.0002410071592-1594

Details of the mutation S263S within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1626716597All0.003111
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA32616597All0.000062
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcG416597All0.000001
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT38063844B.1.1.70.003407
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA383844B.1.1.70.000034
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT21212121AY.60.087234
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT14401524AY.4.20.031232
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA841524AY.4.20.001822
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT949964AY.40.001477
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA14964AY.40.000022
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcG1964AY.40.000002
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT858865AY.390.021202
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA7865AY.390.000173
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT763763AY.4.2.10.113677
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT758758B.1.220.998682
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT580644B.1.617.20.002184
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA64644B.1.617.20.000241
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT389392AY.250.00234
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA3392AY.250.000018
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT284293B.1.20.002501
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA8293B.1.20.00007
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcG1293B.1.20.000009
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT237240B.10.002171
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA3240B.10.000027
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT235239AY.430.001041
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA4239AY.430.000018
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT213217AY.1030.001323
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA4217AY.1030.000025
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT210214AY.440.001278
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA4214AY.440.000024
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT183184B.1.5260.004301
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA1184B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT165165B.1.1.3170.067929
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT110110B.1.3510.00327
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT107107AY.46.60.007726
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT104105B.1.10.001887
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA1105B.1.10.000018
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT103103B.1.6360.691275
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT96102P.10.001512
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA6102P.10.000095
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT8084B.1.1770.001053
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA484B.1.1770.000053
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT6872AY.30.000676
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA472AY.30.00004
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT7171B.1.5500.972603
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT4160AY.1020.001087
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA1960AY.1020.000504
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT5757P.1.150.013243
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT5555B.1.4290.001294
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT5050AY.200.001943
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT5050AY.50.001032
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT5050Q.80.008245
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT4344AY.290.000678
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA144AY.290.000016
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT4243AY.470.001306
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA143AY.470.000031
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT4343R.10.00387
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT4040B.1.160.80.051546
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT3737B.1.1.5190.001469
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT3737B.1.2430.002575
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT3636AY.750.002017
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT3636B.1.1.630.013889
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT3535B.1.5960.00305
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT3232B.1.22.11
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT3131AY.990.032529
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT3030B.1.5250.003395
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT3030B.1.6190.026132
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT2829AY.1180.001754
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA129AY.1180.000063
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT2829AY.260.000793
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA129AY.260.000028
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT2929B.1.1260.03699
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT2828AY.1130.003987
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT2728AY.330.001803
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA128AY.330.000067
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT2627AY.1190.000918
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA127AY.1190.000035
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT2727B.1.1.700.009209
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT2227B.1.2210.001563
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA427B.1.2210.000284
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcG127B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT2727B.1.2580.001797
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT2626AY.1140.006009
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT2526AY.420.001006
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA126AY.420.00004
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT2126B.1.1600.000655
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA526B.1.1600.000156
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT2525B.1.351.20.007564
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT2525Q.10.003158
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1824AY.1200.000669
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA624AY.1200.000223
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT2424B.1.1.1300.369231
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT2424B.1.258.170.002495
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT2222B.1.1.2770.016692
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT2121AY.1170.001775
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT2020AY.220.041841
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT2020B.1.438.10.002145
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1919AY.4.50.002042
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1919AZ.20.015599
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1919B.1.1.2220.003876
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1919B.1.1.4200.019115
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1818AY.360.002668
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA1618B.1.5950.004175
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT218B.1.5950.000522
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1717B.1.177.810.003218
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1717B.1.4270.000858
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1616AY.39.10.000634
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1616AY.460.001665
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1616B.1.6210.001416
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1515AY.230.001046
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1515AY.98.10.000726
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1414B.1.1.2140.000776
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1414B.1.177.520.024605
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1314B.1.466.20.005086
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA114B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1214C.370.001393
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA214C.370.000232
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT913AY.610.000943
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA413AY.610.000419
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1313AY.7.10.001465
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1313B.1.6370.00095
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1212AY.540.001144
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1212B.1.1.4320.01519
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1212B.1.177.70.001978
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1111AY.270.000712
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1111AY.9.20.000404
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1111B.1.3460.014417
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1111P.1.140.000526
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1010AY.1210.001353
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1010AY.840.004374
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1010B.1.160.70.02079
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1010B.1.360.001459
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT1010B.1.617.10.00129
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT99AY.1000.000414
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT99AY.29.10.001985
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT99AY.5.40.00249
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT99B.1.1.2800.027778
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT99B.1.177.600.001966
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT99B.1.2340.001187
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT99B.1.3960.006351
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT58AY.450.000608
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA38AY.450.000365
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT88AY.5.30.002699
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT88AY.890.039216
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT88AY.920.002298
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT88AY.980.000632
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT88B.1.6030.085106
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT88P.30.012759
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT77B.1.1.280.002179
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT67B.1.1.4340.002091
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA17B.1.1.4340.000349
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT77B.1.1.500.004752
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT77P.1.160.002619
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT66AP.10.009009
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT46AY.340.000388
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA26AY.340.000194
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT66AY.580.005445
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT66AY.680.001642
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT66AY.90.000406
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT66AY.900.004107
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT66AY.99.20.000553
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT66B.1.1.2070.007092
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT66B.1.1.2850.039216
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT66B.1.1.330.002525
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT66B.1.177.570.001686
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT66B.1.177.80.004515
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT45AY.1060.00134
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA15AY.1060.000335
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT55AY.130.000805
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT55AY.770.005637
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT55B.1.1.2160.004452
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT55B.1.1.250.002843
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT55B.1.2370.024876
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT55B.1.2400.001078
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT55B.1.36.360.00301
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT55B.1.619.10.003207
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT44A.2.50.001996
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT44A.2.5.20.006289
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT44A.280.010582
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT44AY.1070.001864
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT44AY.160.001519
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT44AY.3.10.000341
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT34AY.46.50.000595
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA14AY.46.50.000198
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT44AY.740.000463
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT44AY.80.002424
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT44B.1.1.1740.013514
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT44B.1.1.2530.010025
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT44B.1.1.3200.072727
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT44B.1.177.160.002658
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT44B.1.177.280.02963
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT44B.1.177.760.009975
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT44B.1.2320.002149
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT44B.1.3380.034483
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT44B.1.3820.035714
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT44B.1.4080.01476
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT44B.1.5820.001963
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT44B.1.6090.001918
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT44B.1.621.10.002023
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT44B.6.60.003556
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT44P.1.30.137931
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT230.111111
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcG130.055556
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT33AY.1050.001929
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT33AY.120.20.003856
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT33AY.120.2.10.001495
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT33AY.140.000264
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT33AY.300.001187
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT33AY.34.10.00153
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT33AY.46.40.000494
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT33AY.620.001307
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT33AY.75.10.000541
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT33AY.9.10.000251
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT33B0.000383
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT33B.1.1.10.00098
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT33B.1.1.2690.00406
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT33B.1.1.3060.001315
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT33B.1.1.3370.010791
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT33B.1.1.4130.02069
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT33B.1.1390.002199
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT33B.1.177.540.001819
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT33B.1.177.620.003576
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT33B.1.2390.003663
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT33B.1.36.80.003
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT33B.1.4160.003807
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT33B.1.5610.001191
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT33B.1.5710.029126
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT33D.20.000225
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT33P.20.00056
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22A0.000774
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22A.270.003311
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22AE.80.000978
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22AY.10.000791
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22AY.1090.001479
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22AY.1110.000366
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22AY.1160.000574
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22AY.116.10.000623
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22AY.16.10.00094
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22AY.190.002281
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22AY.280.003781
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22AY.39.1.10.001449
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22AY.46.10.002053
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22AY.46.20.001271
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22AY.480.00093
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22AY.530.000575
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22AY.550.001835
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22AY.590.001059
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22AY.730.001331
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22AY.850.000854
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22B.1.1.1410.004024
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA22B.1.1.1920.004619
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22B.1.1.2190.01
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22B.1.1.2400.00939
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22B.1.1.2650.006309
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22B.1.1.2820.023256
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22B.1.1.310.133333
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22B.1.1.3260.003521
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22B.1.1.3780.014599
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22B.1.1040.00738
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22B.1.110.30.001437
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22B.1.1110.00235
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22B.1.177.180.00232
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22B.1.177.200.003035
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22B.1.177.630.005405
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22B.1.177.870.001456
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22B.1.1870.066667
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22B.1.258.140.001961
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22B.1.36.170.000988
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22B.1.3620.003082
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22B.1.4200.020833
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22B.1.5450.028986
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22B.1.6000.011696
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22B.1.617.30.00597
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22B.400.000729
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22N.100.058824
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22P.1.10.000635
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT22P.1.170.000324
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11A.2.20.001689
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11A.23.10.000704
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11AA.10.007246
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA11AD.20.000219
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA11AY.120.10.000321
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11AY.20.000356
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11AY.210.001898
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11AY.240.000431
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11AY.380.000499
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11AY.4.40.000409
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11AY.520.000814
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11AY.670.000464
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11AY.690.000187
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11AY.70.000196
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11AY.710.000475
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11AY.720.001361
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11AY.790.001211
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11AY.860.00083
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11AY.870.000833
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11AY.880.000884
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11AY.930.000273
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11AY.99.10.001553
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11AZ.10.000867
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.1.1170.009709
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.1.1210.002427
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.1.1530.001095
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.1.1980.001468
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.1.2200.001859
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.1.2270.004348
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.1.3160.000925
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.1.3290.003846
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.1.3540.004386
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.1.3620.005618
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.1.4440.142857
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.1.4480.002033
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.1.990.02381
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.1280.000635
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.1430.021277
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.1460.004237
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.160.140.002119
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.160.280.002924
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.1690.014925
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.177.330.001645
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.177.410.0025
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.177.420.000894
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.177.50.001242
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.177.770.000726
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.177.860.000183
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.1890.004292
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.214.30.007143
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.221.40.004167
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.2230.002778
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.2510.021739
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.258.160.001637
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.258.40.003448
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.2790.000514
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.30.002618
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcA11B.1.3240.001605
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.351.30.000876
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.36.180.00042
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.36.260.002857
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.390.003906
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.4000.000429
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.4170.028571
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.4280.00102
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.4330.003195
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.4510.008197
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.4530.003236
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.4560.003268
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.5050.004386
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.5090.000866
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.5640.000426
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.5750.000303
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.5770.000687
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.5800.004065
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.6200.000946
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.6250.002353
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.6340.003425
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.6390.021739
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.1.910.002075
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.30.000831
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11B.40.002208
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11C.160.00106
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11C.300.001727
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11C.36.30.000567
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11N.50.001767
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11P.1.100.000269
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11P.1.130.000898
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11P.1.70.000319
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11P.1.90.004808
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11P.70.004367
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11Q.30.000145
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11Q.40.000455
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11Q.70.001111
ORF1ab/nsp2263S263StcCtcT11W.30.005263

CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk

CoV-GLUE uses sequence data from GISAID. GISAID data provided via this web application is subject to GISAID's Terms and Conditions.