CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : Mut = S263F

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2263S263FS443FnonsyntCctTc19471194470.9987671592-1594
ORF1ab/nsp2263S263FS443FnonsyntCCtTT19471240.00123261592-1594

Details of the mutation S263F within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1944719471All0.003719
ORF1ab/nsp2263S263FtCCtTT2419471All0.000005
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc68006801AY.40.010584
ORF1ab/nsp2263S263FtCCtTT16801AY.40.000002
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc26092609AY.1020.069175
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc15451545AY.46.40.254154
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc12181235B.1.1.70.00109
ORF1ab/nsp2263S263FtCCtTT171235B.1.1.70.000015
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc934936B.1.617.20.003517
ORF1ab/nsp2263S263FtCCtTT2936B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc525525AY.420.021121
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc494494AY.440.003007
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc488488AY.730.324684
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc342342B.1.360.049898
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc339339AY.250.002039
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc264264AY.1030.001639
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc223223AY.30.002218
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc205206B.1.20.001805
ORF1ab/nsp2263S263FtCCtTT1206B.1.20.000009
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc175175B.1.3510.005202
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc148148B.1.4270.007474
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc145145B.10.001328
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc143143P.10.002253
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc140140AY.430.00062
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc137137B.1.4290.003223
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc111111B.1.5260.002609
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc106106AY.460.011032
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc9797B.1.5950.025313
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc9090B.1.3690.02567
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc8080B.1.1770.001053
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc7474B.1.1.3480.058917
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc7171AY.390.001755
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc6565B.1.5960.005664
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc6464AY.900.043806
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc6363AY.50.001301
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc5959B.1.177.210.004512
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc5757B.1.1600.001778
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc5253B.1.10.000943
ORF1ab/nsp2263S263FtCCtTT153B.1.10.000018
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc5252AY.290.00082
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc4545B.1.2430.003131
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc4141AY.980.003239
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc3838AY.700.007923
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc3636AY.3.10.003069
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc3535AY.340.003394
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc3434A.2.50.016966
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc3434AY.200.001321
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc3434AY.330.00227
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc3232AY.610.003353
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc3030AY.260.000849
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc2828AY.4.20.000607
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc2728B.1.2210.001918
ORF1ab/nsp2263S263FtCCtTT128B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc2626C.160.027572
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc2424AY.1200.000892
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc2424AY.34.10.012239
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc2222P.20.004106
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc2121AY.750.001176
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc2121B.1.438.10.002252
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1919AY.920.005458
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1818AY.1190.000636
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1818AY.75.10.003246
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1818B.1.1.10.00588
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1818C.300.031088
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1717AY.1170.001437
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1616AY.840.006999
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1616B.1.1.4240.727273
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1515AY.450.001825
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1515AY.890.073529
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1414AY.1160.004015
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1414AY.4.50.001505
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1313B.1.1.301
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1313B.1.36.160.018519
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1212AY.5.40.00332
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1212B.1.1.2160.010686
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1212B.1.177.860.002201
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1111AY.1000.000506
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1111B.1.1.1530.012048
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1111B.1.177.820.005251
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1111B.1.258.110.00436
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1111B.1.351.20.003328
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1010B.1.36.80.01
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1010B.1.4090.007812
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc99AY.1060.003014
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc99AY.230.000628
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc99P.1.70.002874
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc88AY.1180.000501
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc88AY.470.000249
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc88AY.5.30.002699
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc88AY.7.20.004474
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc88AY.710.0038
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc88AY.98.10.000387
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc88B.1.1.390.004077
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc88B.1.258.170.000832
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc88B.1.6210.000708
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc88C.360.007286
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc88Q.80.001319
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc77AY.4.40.002864
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc77AY.9.20.000257
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc77B.1.1.2890.014583
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc77B.1.1.5190.000278
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc77B.1.177.70.001154
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc77B.1.221.30.005833
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc77B.1.36.270.005344
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc77B.1.5610.002779
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc77D.20.000525
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc66AB.10.04918
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc66AY.1140.001387
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc66AY.1210.000812
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc66AY.320.003195
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc66AY.410.001764
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc66AY.46.60.000433
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc66AY.530.001725
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc66AY.630.002321
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc66B.1.2400.001293
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc66B.1.617.10.000774
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc66B.1.6370.000438
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc66P.1.150.001394
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc55AY.1110.000916
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc55AY.370.00158
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc55AY.39.10.000198
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc55AY.46.20.003177
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc55B.1.1.330.002104
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc55B.1.1260.006378
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc55B.1.36.10.005701
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc55B.1.36.100.023923
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc55B.1.36.220.006039
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc55B.1.36.290.002587
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc55B.1.4210.037313
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc55P.1.170.000809
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc44AY.1130.00057
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc44AY.350.000932
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc44AY.580.00363
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc34AY.60.000123
ORF1ab/nsp2263S263FtCCtTT14AY.60.000041
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc44AY.640.002381
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc44AY.650.002132
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc44AY.740.000463
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc44AY.850.001709
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc44AY.880.003537
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc44AY.90.00027
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc44B.1.1.2180.030769
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc44B.1.2580.000266
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc44B.1.4280.004082
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc44B.1.621.10.002023
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc44C.36.30.002269
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33AW.10.009146
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33AY.1100.000338
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33AY.116.10.000934
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33AY.140.000264
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33AY.16.10.00141
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33AY.190.003421
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33AY.480.001395
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33AY.540.000286
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33AY.550.002752
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33AY.990.003148
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33AY.99.20.000276
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B0.000383
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B.1.1.2980.002586
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B.1.1.3170.001235
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B.1.177.350.002073
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B.1.177.440.001557
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B.1.177.560.002003
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B.1.177.690.004451
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B.1.177.720.010169
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B.1.177.770.002179
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B.1.214.20.001799
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B.1.36.170.001482
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B.1.4560.009804
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B.1.4970.000944
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B.1.5680.003333
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B.1.595.20.12
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B.1.6230.001609
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33C.10.007177
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33C.370.000348
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33P.1.10.000953
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33P.1.140.000143
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc220.111111
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22A.20.001324
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22AY.1080.002205
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22AY.360.000296
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22AY.380.000999
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22AY.46.10.002053
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22AY.46.30.001867
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22AY.46.50.000397
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22AY.510.001818
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22AY.560.00321
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22AY.7.10.000225
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22AY.780.003082
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22AY.820.002714
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22AZ.50.007018
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.1.1410.004024
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.1.1700.002494
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.1.1900.1
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.1.2070.002364
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.1.2200.003717
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.1.280.000622
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.1.2910.001485
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.1.3110.000716
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.1.3490.020619
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.1.4340.000697
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.1.5260.007092
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.177.110.003396
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.177.330.003289
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.2060.001631
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.3110.000549
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.3210.068966
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.3490.00143
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.351.50.001199
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.36.180.00084
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.3850.021277
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.4040.002604
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.4590.008163
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.466.20.000782
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.6090.000959
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.30.001661
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.400.000729
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22P.1.120.000968
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22Q.10.000253
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11A.10.000282
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11A.50.001923
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AE.30.032258
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AE.80.000489
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AK.10.012658
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AP.10.001502
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AU.10.001266
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AU.30.00211
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.10.000396
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.1050.000643
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.120.000316
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.120.10.000321
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.130.000161
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.160.00038
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.170.008197
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.23.10.000417
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.270.000065
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.4.30.000842
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.400.000964
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.500.000799
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.570.000656
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.590.00053
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.670.000464
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.760.004831
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.770.001127
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.860.00083
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.870.000833
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.910.00073
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.930.000273
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.100.001115
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.1570.000913
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.1600.02381
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.1860.003436
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.2310.003096
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.2770.000759
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.2800.003086
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.2940.001266
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.3640.066667
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.3720.000689
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.3740.002375
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.500.000679
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.830.00271
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1100.004525
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1110.001175
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1390.000733
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.160.200.008929
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.160.80.001289
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.177.120.000152
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.177.160.000664
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.177.320.00135
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.177.450.000381
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.177.60.000977
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.177.600.000218
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.177.870.000728
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.2320.000537
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.2410.000812
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.264.10.047619
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.3010.005917
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.3240.001605
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.3460.001311
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.3560.001727
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.36.360.000602
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.3660.004878
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.3800.006623
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.4000.000429
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.4080.00369
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.4160.001269
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.4620.007246
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.4700.001404
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.4780.011765
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.499.10.111111
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.5170.000427
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.5240.001406
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.5600.00463
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.5880.00091
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.5990.00365
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.6280.000352
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.6340.003425
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.930.000934
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11C.350.000774
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11N.40.004255
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11P.1.100.000269
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11P.30.001595
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11Q.70.001111
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11R.10.00009