CoV-GLUEGenomeCountriesLineagesMutationsInsertionsDeletionsUpdated:

CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : Mut = S263F

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2263S263FS443FnonsyntCctTc19471194470.9987671592-1594
ORF1ab/nsp2263S263FS443FnonsyntCCtTT19471240.00123261592-1594

Details of the mutation S263F within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1944719471All0.003719
ORF1ab/nsp2263S263FtCCtTT2419471All0.000005
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc68006801AY.40.010584
ORF1ab/nsp2263S263FtCCtTT16801AY.40.000002
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc26092609AY.1020.069175
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc15451545AY.46.40.254154
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc12181235B.1.1.70.00109
ORF1ab/nsp2263S263FtCCtTT171235B.1.1.70.000015
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc934936B.1.617.20.003517
ORF1ab/nsp2263S263FtCCtTT2936B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc525525AY.420.021121
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc494494AY.440.003007
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc488488AY.730.324684
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc342342B.1.360.049898
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc339339AY.250.002039
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc264264AY.1030.001639
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc223223AY.30.002218
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc205206B.1.20.001805
ORF1ab/nsp2263S263FtCCtTT1206B.1.20.000009
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc175175B.1.3510.005202
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc148148B.1.4270.007474
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc145145B.10.001328
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc143143P.10.002253
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc140140AY.430.00062
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc137137B.1.4290.003223
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc111111B.1.5260.002609
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc106106AY.460.011032
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc9797B.1.5950.025313
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc9090B.1.3690.02567
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc8080B.1.1770.001053
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc7474B.1.1.3480.058917
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc7171AY.390.001755
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc6565B.1.5960.005664
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc6464AY.900.043806
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc6363AY.50.001301
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc5959B.1.177.210.004512
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc5757B.1.1600.001778
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc5253B.1.10.000943
ORF1ab/nsp2263S263FtCCtTT153B.1.10.000018
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc5252AY.290.00082
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc4545B.1.2430.003131
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc4141AY.980.003239
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc3838AY.700.007923
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc3636AY.3.10.003069
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc3535AY.340.003394
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc3434A.2.50.016966
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc3434AY.200.001321
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc3434AY.330.00227
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc3232AY.610.003353
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc3030AY.260.000849
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc2828AY.4.20.000607
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc2728B.1.2210.001918
ORF1ab/nsp2263S263FtCCtTT128B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc2626C.160.027572
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc2424AY.1200.000892
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc2424AY.34.10.012239
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc2222P.20.004106
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc2121AY.750.001176
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc2121B.1.438.10.002252
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1919AY.920.005458
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1818AY.1190.000636
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1818AY.75.10.003246
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1818B.1.1.10.00588
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1818C.300.031088
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1717AY.1170.001437
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1616AY.840.006999
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1616B.1.1.4240.727273
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1515AY.450.001825
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1515AY.890.073529
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1414AY.1160.004015
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1414AY.4.50.001505
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1313B.1.1.301
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1313B.1.36.160.018519
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1212AY.5.40.00332
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1212B.1.1.2160.010686
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1212B.1.177.860.002201
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1111AY.1000.000506
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1111B.1.1.1530.012048
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1111B.1.177.820.005251
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1111B.1.258.110.00436
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1111B.1.351.20.003328
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1010B.1.36.80.01
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc1010B.1.4090.007812
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc99AY.1060.003014
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc99AY.230.000628
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc99P.1.70.002874
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc88AY.1180.000501
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc88AY.470.000249
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc88AY.5.30.002699
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc88AY.7.20.004474
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc88AY.710.0038
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc88AY.98.10.000387
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc88B.1.1.390.004077
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc88B.1.258.170.000832
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc88B.1.6210.000708
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc88C.360.007286
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc88Q.80.001319
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc77AY.4.40.002864
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc77AY.9.20.000257
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc77B.1.1.2890.014583
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc77B.1.1.5190.000278
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc77B.1.177.70.001154
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc77B.1.221.30.005833
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc77B.1.36.270.005344
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc77B.1.5610.002779
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc77D.20.000525
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc66AB.10.04918
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc66AY.1140.001387
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc66AY.1210.000812
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc66AY.320.003195
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc66AY.410.001764
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc66AY.46.60.000433
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc66AY.530.001725
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc66AY.630.002321
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc66B.1.2400.001293
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc66B.1.617.10.000774
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc66B.1.6370.000438
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc66P.1.150.001394
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc55AY.1110.000916
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc55AY.370.00158
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc55AY.39.10.000198
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc55AY.46.20.003177
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc55B.1.1.330.002104
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc55B.1.1260.006378
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc55B.1.36.10.005701
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc55B.1.36.100.023923
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc55B.1.36.220.006039
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc55B.1.36.290.002587
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc55B.1.4210.037313
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc55P.1.170.000809
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc44AY.1130.00057
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc44AY.350.000932
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc44AY.580.00363
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc34AY.60.000123
ORF1ab/nsp2263S263FtCCtTT14AY.60.000041
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc44AY.640.002381
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc44AY.650.002132
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc44AY.740.000463
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc44AY.850.001709
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc44AY.880.003537
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc44AY.90.00027
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc44B.1.1.2180.030769
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc44B.1.2580.000266
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc44B.1.4280.004082
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc44B.1.621.10.002023
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc44C.36.30.002269
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33AW.10.009146
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33AY.1100.000338
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33AY.116.10.000934
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33AY.140.000264
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33AY.16.10.00141
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33AY.190.003421
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33AY.480.001395
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33AY.540.000286
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33AY.550.002752
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33AY.990.003148
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33AY.99.20.000276
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B0.000383
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B.1.1.2980.002586
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B.1.1.3170.001235
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B.1.177.350.002073
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B.1.177.440.001557
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B.1.177.560.002003
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B.1.177.690.004451
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B.1.177.720.010169
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B.1.177.770.002179
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B.1.214.20.001799
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B.1.36.170.001482
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B.1.4560.009804
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B.1.4970.000944
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B.1.5680.003333
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B.1.595.20.12
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33B.1.6230.001609
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33C.10.007177
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33C.370.000348
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33P.1.10.000953
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc33P.1.140.000143
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc220.111111
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22A.20.001324
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22AY.1080.002205
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22AY.360.000296
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22AY.380.000999
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22AY.46.10.002053
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22AY.46.30.001867
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22AY.46.50.000397
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22AY.510.001818
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22AY.560.00321
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22AY.7.10.000225
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22AY.780.003082
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22AY.820.002714
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22AZ.50.007018
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.1.1410.004024
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.1.1700.002494
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.1.1900.1
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.1.2070.002364
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.1.2200.003717
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.1.280.000622
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.1.2910.001485
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.1.3110.000716
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.1.3490.020619
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.1.4340.000697
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.1.5260.007092
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.177.110.003396
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.177.330.003289
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.2060.001631
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.3110.000549
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.3210.068966
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.3490.00143
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.351.50.001199
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.36.180.00084
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.3850.021277
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.4040.002604
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.4590.008163
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.466.20.000782
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.1.6090.000959
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.30.001661
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22B.400.000729
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22P.1.120.000968
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc22Q.10.000253
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11A.10.000282
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11A.50.001923
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AE.30.032258
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AE.80.000489
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AK.10.012658
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AP.10.001502
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AU.10.001266
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AU.30.00211
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.10.000396
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.1050.000643
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.120.000316
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.120.10.000321
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.130.000161
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.160.00038
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.170.008197
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.23.10.000417
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.270.000065
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.4.30.000842
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.400.000964
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.500.000799
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.570.000656
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.590.00053
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.670.000464
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.760.004831
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.770.001127
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.860.00083
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.870.000833
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.910.00073
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11AY.930.000273
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.100.001115
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.1570.000913
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.1600.02381
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.1860.003436
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.2310.003096
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.2770.000759
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.2800.003086
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.2940.001266
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.3640.066667
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.3720.000689
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.3740.002375
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.500.000679
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1.830.00271
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1100.004525
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1110.001175
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.1390.000733
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.160.200.008929
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.160.80.001289
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.177.120.000152
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.177.160.000664
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.177.320.00135
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.177.450.000381
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.177.60.000977
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.177.600.000218
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.177.870.000728
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.2320.000537
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.2410.000812
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.264.10.047619
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.3010.005917
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.3240.001605
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.3460.001311
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.3560.001727
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.36.360.000602
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.3660.004878
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.3800.006623
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.4000.000429
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.4080.00369
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.4160.001269
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.4620.007246
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.4700.001404
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.4780.011765
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.499.10.111111
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.5170.000427
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.5240.001406
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.5600.00463
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.5880.00091
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.5990.00365
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.6280.000352
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.6340.003425
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11B.1.930.000934
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11C.350.000774
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11N.40.004255
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11P.1.100.000269
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11P.30.001595
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11Q.70.001111
ORF1ab/nsp2263S263FtCctTc11R.10.00009

CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk

CoV-GLUE uses sequence data from GISAID. GISAID data provided via this web application is subject to GISAID's Terms and Conditions.