CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : Mut = R370C

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2370R370CR550CnonsynCgcTgc3759375911913-1915

Details of the mutation R370C within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc37593759All0.000719
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc19351935B.1.2790.993837
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc359359B.1.1.70.000321
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc211211AY.40.000328
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc134134AY.250.000806
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc8888B.1.617.20.000331
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc8484P.10.001323
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc6060AY.440.000365
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc5757AY.430.000253
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc4545AY.1030.000279
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc4545B.1.20.000396
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc3939B.1.5250.004413
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc3333B.1.438.10.00354
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc3131AY.7.10.003494
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc3131B.10.000284
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc3131B.1.4290.000729
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc3030AY.4.20.000651
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc3030C.36.3.10.081522
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc2121Q.30.003046
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc1919AY.420.000764
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc1919B.1.36.90.061093
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc1616B.1.5680.017778
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc1515AY.1020.000398
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc1515AY.950.011416
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc1414AY.260.000396
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc1414B.1.1.5190.000556
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc1111AY.30.000109
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc1111AY.330.000735
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc1111AY.50.000227
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc1111B0.001406
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc1111B.1.5260.000259
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc1010AY.98.10.000484
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc1010B.1.1.3370.035971
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc99B.1.177.860.001651
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc88AY.290.000126
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc88AY.60.000329
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc88B.1.1770.000105
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc88B.1.6210.000708
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc77AY.1190.000247
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc77AY.390.000173
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc77AY.540.000667
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc77AY.840.003062
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc77B.1.2410.005682
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc66B.1.10.000109
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc66B.1.1600.000187
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc66B.1.6310.020202
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc55AE.80.002445
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc55B.1.360.00073
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc55P.1.140.000239
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc44AY.190.004561
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc44AY.460.000416
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc44AY.980.000316
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc44B.1.1.3160.0037
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc44B.1.1.700.001364
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc44B.1.177.80.00301
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc44B.1.258.170.000416
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc44B.1.3510.000119
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc44B.1.4270.000202
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc44B.1.6370.000292
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc33AY.1000.000138
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc33AY.120.000948
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc33AY.470.000093
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc33AY.590.001589
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc33AY.640.001786
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc33AY.700.000626
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc33AY.740.000347
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc33B.1.1.2840.000322
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc33B.1.1.2940.003797
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc33B.1.36.80.003
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc33C.370.000348
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc33P.20.00056
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc22AY.1170.000169
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc22AY.1180.000125
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc22AY.120.20.002571
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc22AY.340.000194
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc22AY.360.000296
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc22AY.4.2.10.000298
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc22AY.610.00021
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc22AY.750.000112
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc22AY.850.000854
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc22AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc22B.1.1.280.000622
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc22B.1.1.3060.000877
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc22B.1.1.330.000842
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc22B.1.1.4190.014815
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc22B.1.1.4860.003155
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc22B.1.1490.006849
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc22B.1.177.320.002699
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc22B.1.2430.000139
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc22B.1.4160.002538
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc22B.1.5170.000854
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc22B.1.6090.000959
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc22B.6.60.001778
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11A.210.00277
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11A.23.10.000704
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11AY.1060.000335
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11AY.1090.00074
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11AY.140.000088
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11AY.200.000039
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11AY.230.00007
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11AY.350.000233
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11AY.370.000316
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11AY.380.000499
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11AY.520.000814
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11AY.550.000917
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11AY.560.001605
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11AY.570.000656
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11AY.690.000187
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11AY.860.00083
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11AY.920.000287
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11AY.940.000443
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.1.1920.002309
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.1.3850.004464
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.1.4350.034483
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.1.500.000679
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.1.5240.020833
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.1.740.00431
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.1120.005181
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.177.800.001912
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.177.820.000477
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.2140.003663
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.2270.047619
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.2320.000537
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.2370.004975
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.258.140.00098
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.2600.003344
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.30.002618
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.36.100.004785
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.36.160.001425
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.3620.001541
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.3960.000706
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.3970.004854
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.4130.004255
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.5200.021739
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.5380.008065
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.5410.004425
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.5490.007194
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.5510.00129
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.564.10.001577
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.6280.000352
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.6340.003425
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.1.9.50.005682
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.280.003279
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11B.4.10.018868
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11C.160.00106
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11C.36.30.000567
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11P.1.10.000318
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11P.1.10.10.00813
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11P.1.120.000484
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11P.1.150.000232
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11P.1.80.004785
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11Q.10.000126
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc11Q.80.000165