CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : Mut = P624S

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2624P624SP804SnonsynCctTct483748340.999382675-2677
ORF1ab/nsp2624P624SP804SnonsynCcTTcA483720.0004134792675-2677
ORF1ab/nsp2624P624SP804SnonsynCCtAGt483710.000206742675-2677

Details of the mutation P624S within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct48344837All0.000925
ORF1ab/nsp2624P624SCcTTcA24837All0
ORF1ab/nsp2624P624SCCtAGt14837All0
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct12491249AY.40.001944
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11251125AY.430.004984
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct513514B.1.1.70.000459
ORF1ab/nsp2624P624SCCtAGt1514B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct193193B.1.20.001699
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct149149AY.1030.000925
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct149149B.1.617.20.000561
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct114114P.10.001796
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct102102B.1.4290.0024
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct6767AY.440.000408
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct6262AA.51
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct5454AY.980.004266
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct4949B.1.1770.000645
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct4444AY.39.10.001743
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct4444B.1.10.000798
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct4141B.1.4270.00207
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct4040AY.4.10.029499
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct3737B.1.1.5190.001469
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct3636B.1.2430.002505
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct3030AY.250.00018
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct3030B.1.1.5000.6
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct2929Q.10.003663
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct2626P.1.140.001243
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct2525B.10.000229
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct2525B.1.36.170.012352
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct2323AY.1020.00061
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct2222AY.30.000219
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct2222AY.750.001232
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct2121B.1.5260.000494
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct1919AY.900.013005
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct1919B.1.1.2770.014416
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct1717AY.390.00042
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct1515B.1.36.10.017104
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct1313AY.230.000907
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct1212AY.1100.001352
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct1212AY.420.000483
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct1212B.1.160.260.029056
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct1111AY.260.000311
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct1111B.1.3510.000327
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct1010AY.290.000158
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct1010B.1.36.180.004202
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct99AY.170.07377
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct88B.1.1600.00025
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct88C.370.000929
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct77AY.1130.000997
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct77AY.50.000145
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct77AY.98.10.000339
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct77B.1.1.2040.021277
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct77B.1.2580.000466
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct66AY.1190.000212
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct66AY.4.50.000645
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct66AY.460.000624
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct66B.1.1.2430.02449
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct66B.1.1.280.001867
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct66B.1.360.000875
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct66B.1.6200.005676
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct55AY.46.60.000361
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct55AY.470.000156
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct55B.1.177.860.000917
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct55B.1.6120.013263
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct55P.40.019011
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct44A.10.001127
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct44AY.200.000155
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct44AY.330.000267
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct44AY.450.000487
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct44AY.610.000419
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct44B.1.2230.011111
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct44B.1.36.80.004
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct44B.1.5700.011765
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct44Q.80.00066
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct33AY.1210.000406
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct33AY.140.000264
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct33AY.46.20.001906
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct33AY.640.001786
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct33AY.7.20.001678
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct33AY.880.002653
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct33B.1.1.2140.000166
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct33B.1.177.40.000633
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct33B.1.2390.003663
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct33B.1.5510.003871
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct33B.1.6210.000266
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct33C.160.003181
ORF1ab/nsp2624P624SCcTTcA220.111111
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22A.2.50.000998
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22AY.1000.000092
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22AY.1040.003968
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22AY.350.000466
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22AY.360.000296
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22AY.4.20.000043
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22AY.4.40.000818
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22AY.5.30.000675
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22AY.60.000082
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22AY.730.001331
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22AY.840.000875
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22AY.90.000135
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22AY.910.001461
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22B.1.1.3060.000877
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22B.1.1.3080.023529
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22B.1.1.3110.000716
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22B.1.1.330.000842
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22B.1.1.500.001358
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22B.1.177.350.001382
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22B.1.177.420.001789
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22B.1.177.560.001335
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22B.1.2210.000142
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22B.1.2340.000264
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22B.1.3560.003454
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22B.1.36.290.001035
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22B.1.466.20.000782
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22B.1.5300.014286
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22B.1.5550.044444
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22B.1.5820.000981
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22B.1.5880.00182
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22B.1.5950.000522
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22B.1.5960.000174
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22B.40.004415
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct22P.20.000373
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11A.20.000662
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11A.270.001656
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AE.80.000489
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AM.40.003571
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AU.30.00211
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AY.10.000396
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AY.1060.000335
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AY.1080.001103
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AY.130.000161
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AY.240.000431
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AY.320.000532
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AY.340.000097
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AY.39.20.001541
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AY.410.000294
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AY.46.50.000198
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AY.520.000814
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AY.530.000288
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AY.550.000917
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AY.620.000436
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AY.670.000464
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AY.690.000187
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AY.710.000475
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AY.760.004831
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AY.850.000427
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AY.890.004902
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AY.950.000761
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AY.960.002075
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.1.1940.00495
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.1.2320.001815
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.1.2860.002899
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.1.3010.001179
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.1.3070.002532
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.1.3150.008475
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.1.340.013158
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.1.3970.002252
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.1.4320.001266
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.1.5230.001563
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.160.140.002119
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.177.120.000152
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.177.230.003236
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.177.530.002392
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.177.600.000218
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.177.80.000752
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.177.850.005435
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.351.30.000876
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.36.100.004785
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.36.250.002208
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.3900.010638
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.4080.00369
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.428.30.012821
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.4380.006536
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.4870.019608
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.4970.000315
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.4990.00105
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.5130.013889
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.5170.000427
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.5270.003704
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.5610.000397
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.5770.000687
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.596.10.009346
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.6100.003546
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11B.1.6280.000352
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11C.10.002392
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11D.20.000075
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11P.1.120.000484
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11P.1.150.000232
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11P.1.60.001946
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11P.1.80.004785
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11Q.40.000455
ORF1ab/nsp2624P624SCctTct11U.30.003861