CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : Mut = N9N

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp29N9NN189NsynaaCaaT800580051830-832

Details of the mutation N9N within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT80058005All0.001531
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11911191AY.870.991674
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT968968B.1.1.70.000867
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT648648AY.440.003944
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT595595AY.40.000926
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT573573C.300.989637
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT446446B.1.617.20.001679
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT413413AY.50.008528
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT409409B.1.2430.02846
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT147147C.30.10.986577
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT146146B.1.5640.062181
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT128128B.1.20.001127
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT124124B.1.5260.002915
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT122122P.10.001922
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT101101B.1.177.80.075997
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT9292B.1.177.440.047743
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT8888B.1.1770.001159
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT8383AY.430.000368
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT8080AY.250.000481
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT7777B.1.10.001397
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT6969B.10.000632
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT5959B.1.1600.00184
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT5858C.370.006732
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT5454B.1.5621
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT5050AY.1030.00031
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT4747B.1.6370.003434
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT4343AY.260.001217
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT4040B.1.1.2220.00816
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT4040B.1.4290.000941
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT3636AY.30.000358
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT3131B.1.177.810.005869
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT3131B.1.5750.009405
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT3030B.1.36.170.014822
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT2929B.1.4270.001464
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT2727B.1.1.5190.001072
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT2727B.1.177.670.206107
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT2727B.1.2580.001797
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT2727B.1.3510.000803
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT2626AY.750.001457
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT2525B.1.4070.892857
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT2323AY.200.000894
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT2323AY.99.20.00212
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT2222AY.1140.005084
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT2020AY.620.008715
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT1717B.1.5960.001481
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT1616Q.70.017778
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT1515P.1.150.003485
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT1515Q.10.001895
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT1515W.30.078947
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT1414B.1.438.10.001502
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT1313B.1.1490.044521
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT1313R.10.00117
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT1212A.10.003382
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT1212AY.290.000189
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT1212AY.46.40.001974
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT1212P.1.140.000574
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT1111AY.1190.000388
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT1111AY.39.10.000436
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT1111AY.420.000443
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT1111B.1.36.360.006623
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT1010A.270.016556
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT1010AY.370.003161
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT1010AY.75.10.001803
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT1010B.1.5410.044248
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT99B.1.1.330.003788
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT99B.1.1.3480.007166
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT99B.1.4000.003861
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT99B.1.617.10.001161
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT88AY.470.000249
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT88B.1.5250.000905
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT88P.1.10.002541
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT88P.1.20.009249
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT77AY.1180.000439
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT77AY.4.50.000752
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT77AY.690.001307
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT77B.1.6210.00062
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT77B.1.6300.036649
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT66A.2.50.002994
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT66AY.4.20.00013
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT66B.1.1.3060.00263
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT66B.1.360.000875
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT66C.360.005464
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT66D.40.4
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT66Q.30.00087
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT55AY.120.00158
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT55AY.1200.000186
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT55AY.270.000324
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT55AY.390.000124
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT55AY.46.60.000361
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT55AY.9.20.000184
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT55B.1.1.2140.000277
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT55B.1.1.3110.001791
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT55B.1.4990.005252
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT55D.20.000375
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT44AY.1160.001147
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT44AY.230.000279
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT44AY.29.10.000882
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT44AY.98.10.000194
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT44B.1.1.1760.001757
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT44B.1.1.2910.00297
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT44B.1.1.370.000771
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT44B.1.2060.003263
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT44B.1.2210.000284
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT44P.1.100.001078
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT44P.20.000747
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT33AY.1070.001398
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT33AY.360.000445
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT33AY.450.000365
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT33AY.5.40.00083
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT33AY.670.001393
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT33AY.840.001312
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT33AY.910.002191
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT33B.1.1.1740.010135
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT33B.1.1.2160.002671
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT33B.1.1.280.000934
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT33B.1.1110.003525
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT33B.1.177.520.005272
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT33B.1.177.860.00055
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT33B.1.2340.000396
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT33B.1.258.170.000312
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT33B.1.3110.000824
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT33B.1.3360.007317
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT33B.1.36.290.001552
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT33B.1.4230.030612
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT33B.1.5870.005693
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT33B.1.6200.002838
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT33P.1.120.001452
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT33Q.80.000495
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22AY.100.00106
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22AY.1010.000981
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22AY.1060.00067
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22AY.1170.000169
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22AY.240.000862
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22AY.3.10.000171
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22AY.300.000791
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22AY.330.000134
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22AY.350.000466
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22AY.4.30.001684
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22AY.46.20.001271
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22AY.60.000082
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22AY.90.000135
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22B.1.1.390.001019
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22B.1.1.4660.017391
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22B.1.160.260.004843
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22B.1.177.620.002384
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22B.1.177.730.001133
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22B.1.177.820.000955
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22B.1.2400.000431
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22B.1.2410.001623
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22B.1.3150.012121
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22B.1.36.80.002
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22B.1.3750.001639
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22B.1.4160.002538
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22B.1.466.20.000782
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22B.1.5760.001813
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22B.1.5770.001375
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22B.1.6000.011696
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22B.1.6090.000959
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22B.1.619.10.001283
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22B.1.6280.000705
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22B.60.00182
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22B.6.60.001778
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT22C.260.014706
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT110.055556
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11A.23.10.000704
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11AM.40.003571
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11AY.1090.00074
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11AY.116.10.000311
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11AY.160.00038
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11AY.340.000097
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11AY.39.20.001541
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11AY.540.000095
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11AY.580.000907
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11AY.590.00053
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11AY.630.000387
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11AY.650.000533
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11AY.740.000116
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11AY.900.000684
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11AY.920.000287
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11AY.980.000079
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.1.1070.032258
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.1.1480.008772
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.1.1770.019231
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.1.1860.003436
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.1.1940.00495
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.1.1980.001468
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.1.2070.001182
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.1.2610.008621
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.1.3040.002809
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.1.3540.004386
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.1.3560.008547
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.1.3720.000689
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.1.3740.002375
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.1.4340.000349
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.1.4640.001473
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.1.5150.02
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.177.160.000664
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.177.350.000691
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.177.690.001484
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.177.70.000165
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.2050.02381
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.2180.005155
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.220.001318
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.2360.002053
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.258.30.001675
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.2770.02381
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.2790.000514
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.36.380.001642
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.4030.003268
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.4090.000781
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.4280.00102
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.4370.020833
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.4690.00361
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.5010.007353
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.5240.001406
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.5610.000397
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.5710.009709
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.5810.009434
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.5910.010638
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.6180.004032
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.621.10.000506
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.6250.002353
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.1.6350.017544
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11B.400.000364
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11C.390.018868
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11K.30.006173
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11P.1.170.000162
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11P.30.001595
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11Q.40.000455
ORF1ab/nsp29N9NaaCaaT11W.10.008696