CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : Mut = M405V

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2405M405VM585VnonsynAtgGtg91391312018-2020

Details of the mutation M405V within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg913913All0.000175
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg511511AY.50.010552
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg133133B.1.3141
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg5050B.1.1.70.000045
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg2828B.1.6370.002046
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg2424AY.1030.000149
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg1818AY.260.00051
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg1616B.1.1770.000211
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg1515AY.150.033333
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg1414AY.40.000022
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg1414B.1.617.20.000053
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg88P.10.000126
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg66AY.440.000037
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg66B.1.20.000053
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg44AY.200.000155
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg44AY.430.000018
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg44B.10.000037
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg44B.1.5260.000094
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg33B.1.1600.000094
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg22AY.1020.000053
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg22AY.1200.000074
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg22AY.3.10.000171
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg22AY.90.000135
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg22B.1.1.2630.003115
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg22B.1.1.3020.004149
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg22B.1.1.3710.020833
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg22B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg22B.1.5750.000607
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg22B.1.6180.008065
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11AD.2.10.045455
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11AY.1140.000231
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11AY.190.00114
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11AY.250.000006
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11AY.340.000097
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11AY.39.20.001541
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11AY.420.00004
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11AY.470.000031
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11AZ.50.003509
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11B.1.1.3110.000358
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11B.1.160.120.00641
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11B.1.2180.005155
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11B.1.3460.001311
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11B.1.3490.000715
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11B.1.351.20.000303
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11B.1.3910.001127
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11B.30.000831
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11C.370.000116
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11Q.10.000126
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11Q.30.000145
ORF1ab/nsp2405M405VAtgGtg11Q.80.000165