CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : Mut = M405T

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2405M405TM585TnonsynaTgaCg28128112018-2020

Details of the mutation M405T within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg281281All0.000054
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg7676B.1.177.180.088167
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg4545XA1
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg3232B.1.5250.003621
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg1818B.1.1.70.000016
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg1515AY.9.10.001256
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg1010AY.250.00006
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg88B.1.617.20.00003
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg66C.360.005464
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg55AY.40.000008
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg44AY.4.20.000087
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg44B.1.10.000073
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg33AY.1030.000019
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg33AY.200.000117
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg33AY.430.000013
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg33AY.440.000018
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg33AY.50.000062
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg33B.1.177.440.001557
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg33B.1.2340.000396
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg22AY.30.00002
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg22AY.46.40.000329
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg22AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg22B.10.000018
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg22B.1.1.1530.002191
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg22B.1.6290.026667
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg22P.10.000032
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg11AY.1010.00049
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg11AY.230.00007
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg11AY.290.000016
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg11AY.390.000025
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg11AY.7.10.000113
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg11AY.700.000209
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg11AY.750.000056
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg11AY.920.000287
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg11B.1.1.2160.00089
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg11B.1.1.4340.000349
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg11B.1.5640.000426
ORF1ab/nsp2405M405TaTgaCg11B.1.5770.000687