CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : Mut = M404V

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2404M404VM584VnonsynAtgGtg2297229712015-2017

Details of the mutation M404V within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg22972297All0.000439
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg843843AY.40.001312
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg243243B.1.1.70.000218
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg118118B.1.617.20.000444
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg101101B.1.1.3800.990196
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg7676AY.430.000337
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg6363AY.30.000627
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg5151B.1.4270.002575
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg5050AY.250.000301
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg4444B.1.1600.001372
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg4343AY.440.000262
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg3838B.10.000348
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg3636AY.470.00112
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg2828AY.1030.000174
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg2727P.10.000425
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg2424AY.98.10.001162
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg2323AY.260.000651
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg2222B.1.4290.000518
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg2121AY.750.001176
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg2020B.1.20.000176
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg1717AY.20.006054
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg1616AY.1110.00293
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg1616B.1.1770.000211
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg1515B.1.10.000272
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg1515B.1.1.3480.011943
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg1414AY.50.000289
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg1212B.1.3110.003295
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg1212B.1.3960.008469
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg1111AY.390.000272
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg1010AY.1020.000265
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg1010AY.890.04902
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg99B.1.1.5190.000357
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg99B.1.214.30.064286
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg99B.1.5870.017078
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg88AY.290.000126
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg88P.1.120.003872
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg77AY.930.001912
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg77B.1.2580.000466
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg77B.1.3510.000208
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg77B.1.5260.000165
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg66AY.1000.000276
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg66AY.1190.000212
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg66AY.200.000233
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg66B.1.2430.000418
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg55AY.4.20.000108
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg55AY.450.000608
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg55AY.510.004545
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg55AY.610.000524
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg55AY.9.20.000184
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg44AY.34.10.00204
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg44B.1.360.000584
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg33AY.1160.00086
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg33AY.1200.000112
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg33AY.4.50.000322
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg33AY.640.001786
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg33AY.90.000203
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg33AY.980.000237
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg33B.1.1.3060.001315
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg33B.1.177.320.004049
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg33B.1.4000.001287
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg33B.1.5250.000339
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg33B.1.6210.000266
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg33B.1.6370.000219
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg33D.20.000225
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg22AY.1050.001286
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg22AY.1170.000169
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg22AY.1180.000125
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg22AY.1210.000271
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg22AY.130.000322
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg22AY.230.000139
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg22AY.270.000129
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg22AY.330.000134
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg22AY.590.001059
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg22AY.850.000854
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg22AY.9.10.000167
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg22AY.99.20.000184
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg22B.1.1.1760.000879
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg22B.1.1.2220.000408
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg22B.1.1.4320.002532
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg22B.1.1.510.003436
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg22B.1.1.700.000682
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg22B.1.177.520.003515
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg22B.1.177.620.002384
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg22B.1.2210.000142
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg22B.1.36.290.001035
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg22B.1.5820.000981
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg22B.1.6090.000959
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg22R.10.00018
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11A.23.10.000704
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11AB.10.008197
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11AY.240.000431
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11AY.300.000396
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11AY.380.000499
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11AY.4.40.000409
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11AY.400.000964
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11AY.420.00004
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11AY.460.000104
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11AY.520.000814
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11AY.540.000095
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11AY.60.000041
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11AY.670.000464
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11AY.680.000274
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11AY.7.10.000113
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11AY.710.000475
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11AY.740.000116
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.1.130.035714
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.1.3110.000358
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.1.3280.016949
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.1.3550.015385
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.1.4040.015873
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.1.440.00241
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.1260.001276
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.177.820.000477
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.2120.016667
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.3380.008621
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.36.210.00216
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.36.280.005747
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.36.380.001642
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.3670.000792
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.3750.00082
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.4040.001302
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.4110.003704
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.4970.000315
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.4990.00105
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.5800.004065
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.5910.010638
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.5990.00365
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.6120.002653
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.1.930.000934
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11B.120.00641
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11P.1.10.000318
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11P.1.100.000269
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11P.1.150.000232
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11P.1.70.000319
ORF1ab/nsp2404M404VAtgGtg11P.20.000187