CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : Mut = M117V

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2117M117VM297VnonsynAtgGtg10097100950.9998021154-1156
ORF1ab/nsp2117M117VM297VnonsynAtGGtT1009710.00009903931154-1156
ORF1ab/nsp2117M117VM297VnonsynAtGGtC1009710.00009903931154-1156

Details of the mutation M117V within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg1009510097All0.001931
ORF1ab/nsp2117M117VAtGGtC110097All0
ORF1ab/nsp2117M117VAtGGtT110097All0
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg93099309B.1.438.10.998498
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg150150B.1.4380.980392
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg9494AY.40.000146
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg6666AY.160.025057
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg6464B.10.000586
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg5252B.1.438.21
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg4747B.1.438.41
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg3030B.1.1770.000395
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg2929AY.410.008524
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg2424B.1.617.20.00009
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg2020B.1.1.70.000018
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg1818P.10.000284
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg1313B.1.438.31
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg1212AY.1030.000075
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg1011AY.430.000044
ORF1ab/nsp2117M117VAtGGtC111AY.430.000004
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg1111AY.440.000067
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg1010B.1.20.000088
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg1010B.1.2430.000696
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg99B.1.4290.000212
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg88AY.30.00008
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg77AY.1180.000439
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg55AY.1020.000133
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg55AY.200.000194
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg55AY.290.000079
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg55B.1.3110.001373
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg44AY.260.000113
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg44B.1.2210.000284
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg44B.1.4270.000202
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg33AY.250.000018
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg33AY.390.000074
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg33B.1.1.630.001157
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg33B.1.2340.000396
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg33B.1.4680.017143
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg33B.1.5250.000339
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg33C.370.000348
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg22AY.1190.000071
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg22AY.340.000194
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg22AY.4.40.000818
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg22AY.710.00095
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg22AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp2117M117VAtGGtT12B.1.10.000018
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg12B.1.10.000018
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg22B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg22B.1.3670.001585
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg22B.1.466.20.000782
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg22B.1.5960.000174
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg22B.1.6370.000146
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg11A0.000387
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg11A.280.002646
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg11AY.140.000088
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg11AY.460.000104
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg11AY.470.000031
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg11AY.610.000105
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg11AY.690.000187
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg11AY.750.000056
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg11AY.90.000068
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg11AY.980.000079
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg11B.1.1.1940.00495
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg11B.1.1.3650.005587
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg11B.1.1.3670.055556
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg11B.1.1.4200.001006
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg11B.1.2270.047619
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg11B.1.351.20.000303
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg11B.1.3960.000706
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg11B.1.4390.005917
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg11B.1.5130.013889
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg11B.1.5610.000397
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg11B.1.6180.004032
ORF1ab/nsp2117M117VAtgGtg11P.1.140.000048