CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : Mut = L611L

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2611L611LL791LsynctCctT175616330.9299542636-2638
ORF1ab/nsp2611L611LL791LsynctCctA17561110.06321182636-2638
ORF1ab/nsp2611L611LL791LsynctCctG1756120.006833712636-2638

Details of the mutation L611L within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT16331756All0.000312
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA1111756All0.000021
ORF1ab/nsp2611L611LctCctG121756All0.000002
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT263263AY.390.006499
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT216216AY.290.003407
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT181194B.1.1.70.000162
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA13194B.1.1.70.000012
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT154154B.1.1.591
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT8992AY.40.000139
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA392AY.40.000005
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT6174AY.50.00126
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA1374AY.50.000268
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT7474P.10.001166
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT6971B.1.617.20.00026
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA271B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT4141B.1.1770.00054
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT3738AY.98.10.001792
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA138AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT3435AY.1030.000211
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA135AY.1030.000006
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT2631B.10.000238
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA531B.10.000046
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT3031B.1.10.000544
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA131B.1.10.000018
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT2730AY.430.00012
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA330AY.430.000013
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT2628B.1.20.000229
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA228B.1.20.000018
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT1820AY.440.00011
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA220AY.440.000012
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT1519AY.250.00009
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA419AY.250.000024
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT815B.1.2210.000568
ORF1ab/nsp2611L611LctCctG715B.1.2210.000497
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA1213B.1.2430.000835
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT113B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT1212B.1.5160.023483
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT1011AY.1190.000353
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA111AY.1190.000035
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA1111AY.39.10.000436
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT1111B.1.1.1860.037801
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT1010B.1.177.240.012953
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA810B.1.2580.000532
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT210B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT99AY.370.002845
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT99B.1.5960.000784
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT88AY.230.000558
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT77AY.1000.000322
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT77AY.330.000467
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT77B.1.1.5190.000278
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT67B.1.3510.000178
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA17B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT66AY.4.20.00013
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT56AY.590.002648
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA16AY.590.00053
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT66B.1.1.280.001867
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT66B.1.258.190.042553
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT56B.1.4290.000118
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA16B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT55AY.1020.000133
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT55AY.200.000194
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT55AY.340.000485
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT55B.1.177.210.000382
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT55B.1.258.170.00052
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA55B.1.36.250.011038
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT55B.1.5260.000118
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT55P.1.170.000809
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT44AY.30.00004
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT44B.1.1.1410.008048
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT44B.1.1.2840.00043
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT44B.1.3690.001141
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA23A0.000774
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT13A0.000387
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT33AY.1200.000112
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT23AY.420.00008
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA13AY.420.00004
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT33AY.46.60.000217
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT23AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA13AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT33AY.99.20.000276
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT23B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA13B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT33B.1.3110.000824
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT33C.350.002322
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT22AY.270.000129
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT22AY.4.2.10.000298
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT12AY.450.000122
ORF1ab/nsp2611L611LctCctG12AY.450.000122
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT22AY.470.000062
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT22AY.60.000082
ORF1ab/nsp2611L611LctCctG22AY.730.001331
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT22AY.810.003984
ORF1ab/nsp2611L611LctCctG22AY.850.000854
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT22AY.880.001768
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT12AY.90.000068
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA12AY.90.000068
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT22B.1.1.500.001358
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA22B.1.1.700.000682
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT22B.1.1390.001466
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT22B.1.5250.000226
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT22B.1.6090.000959
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT22B.1.6200.001892
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA22C.36.30.001134
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT22R.10.00018
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11AY.1150.005208
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11AY.130.000161
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11AY.140.000088
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11AY.360.000148
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11AY.4.10.000737
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11AY.400.000964
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA11AY.520.000814
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11AY.610.000105
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA11AY.680.000274
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA11AY.700.000209
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA11AY.740.000116
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11AY.790.001211
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11AY.900.000684
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11AY.930.000273
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11AY.980.000079
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA11B0.000128
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11B.1.1.100.001115
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11B.1.1.1660.033333
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11B.1.1.3170.000412
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11B.1.1.3890.006061
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11B.1.1.4200.001006
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA11B.1.1570.002985
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11B.1.177.820.000477
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11B.1.2010.005682
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11B.1.258.110.000396
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA11B.1.3010.005917
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA11B.1.3360.002439
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11B.1.351.20.000303
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11B.1.36.180.00042
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA11B.1.4560.003268
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11B.1.4690.00361
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11B.1.4990.00105
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11B.1.5640.000426
ORF1ab/nsp2611L611LctCctA11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11B.40.002208
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11C.300.001727
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11C.370.000116
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11P.1.160.000374
ORF1ab/nsp2611L611LctCctT11Q.10.000126