CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : Mut = L550del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2550L550delL730deldelCTC---838312453-2455

Details of the mutation L550del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---8383All0.000016
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---1919B.1.1.70.000017
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---88B.10.000073
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---660.333333
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---55B.1.10.000091
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---44B.1.617.20.000015
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---33B.1.1.330.001263
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---22AY.40.000003
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---22AY.46.60.000144
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---22B.1.1.3480.001592
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---22B.1.4240.016129
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---22B.1.4290.000047
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---22N.60.014184
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---22P.10.000032
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---11AY.1080.001103
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---11AY.250.000006
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---11AY.30.00001
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---11AY.420.00004
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---11AY.430.000004
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---11AY.620.000436
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---11AY.840.000437
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---11AY.990.001049
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---11B.1.1.4160.000905
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---11B.1.1.4480.002033
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---11B.1.177.830.001481
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---11B.1.1790.003759
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---11B.1.36.180.00042
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---11B.1.5610.000397
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---11B.1.617.30.002985
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---11B.570.015152
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---11P.20.000187
ORF1ab/nsp2550L550delCTC---11Q.80.000165