CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : Mut = K219R

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2219K219RK399RnonsynaAgaGg185318500.9983811460-1462
ORF1ab/nsp2219K219RK399RnonsynaAGaGA185320.001079331460-1462
ORF1ab/nsp2219K219RK399RnonsynAAgCGg185310.0005396651460-1462

Details of the mutation K219R within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg18501853All0.000354
ORF1ab/nsp2219K219RaAGaGA21853All0
ORF1ab/nsp2219K219RAAgCGg11853All0
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg13001302B.1.1.70.001164
ORF1ab/nsp2219K219RAAgCGg11302B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp2219K219RaAGaGA11302B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg8585B.1.617.20.00032
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg5454B.1.1.2960.981818
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg5353B.1.10.000961
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg4242AY.40.000065
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg3838B.1.6210.003364
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg2828AY.250.000168
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg2828AY.430.000124
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg2525AY.440.000152
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg1617B.1.20.000141
ORF1ab/nsp2219K219RaAGaGA117B.1.20.000009
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg1515B.10.000137
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg1313AY.4.20.000282
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg1313B.1.4290.000306
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg1212AY.30.000119
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg1212AY.390.000297
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg1010B.1.5260.000235
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg66B.1.1770.000079
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg55AY.50.000103
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg55B.1.1.2320.009074
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg44AY.1030.000025
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg44AY.1200.000149
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg44AY.920.001149
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg44P.10.000063
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg33AY.9.20.00011
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg33C.360.002732
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg33C.370.000348
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg22AY.1020.000053
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg22AY.1190.000071
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg22AY.120.000632
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg22AY.160.000759
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg22AY.200.000078
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg22AY.260.000057
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg22AY.370.000632
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg22AY.46.40.000329
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg22B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg22B.1.177.500.00939
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg22B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg22B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg22B.1.4270.000101
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg22B.1.6230.001073
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg22B.1.6370.000146
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg22D.20.00015
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11A.20.000662
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11AT.10.005128
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11AY.1110.000183
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11AY.140.000088
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11AY.230.00007
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11AY.320.000532
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11AY.740.000116
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11AY.90.000068
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11AY.990.001049
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11B.1.1.1390.022727
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11B.1.1.2160.00089
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11B.1.1.3290.003846
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11B.1.110.30.000718
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11B.1.1110.001175
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11B.1.177.650.000665
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11B.1.177.70.000165
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11B.1.2370.004975
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11B.1.351.30.000876
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11B.1.3670.000792
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11B.1.3990.001934
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11D.50.004975
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11P.1.170.000162
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11P.1.70.000319
ORF1ab/nsp2219K219RaAgaGg11P.20.000187