CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : Mut = I559V

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2559I559VI739VnonsynAttGtt3029302912480-2482

Details of the mutation I559V within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt30293029All0.000579
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt27012701B.400.983971
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt6161B.600.968254
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt2828B0.003579
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt2525B.1.1.70.000022
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt1919AY.40.00003
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt1919B.1.617.20.000072
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt1717B.10.000156
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt1515AY.9.20.000551
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt1414AY.250.000084
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt1111AY.1020.000292
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt1010B.1.10.000181
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt1010B.1.1.3060.004384
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt77B.1.1.5190.000278
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt66B.1.6210.000531
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt55AY.570.003281
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt44AY.390.000099
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt44B.1.5260.000094
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt33AY.1210.000406
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt33AY.430.000013
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt33B.1.4270.000151
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt33P.20.00056
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt22AY.1030.000012
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt22AY.1130.000285
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt22AY.290.000032
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt22AY.330.000134
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt22AY.4.50.000215
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt22AY.440.000012
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt22B.1.3960.001411
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt22B.1.4280.002041
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt22B.1.5250.000226
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt22B.30.001661
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt22B.40.004415
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11A.60.005128
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11AY.1060.000335
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11AY.200.000039
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11AY.270.000065
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11AY.30.00001
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11AY.340.000097
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11AY.470.000031
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11AY.7.10.000113
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11AY.740.000116
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11AY.750.000056
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11AY.920.000287
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11AY.950.000761
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11AY.960.002075
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11B.1.1.3690.000446
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11B.1.1.440.00241
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11B.1.220.001318
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11B.1.36.160.001425
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11B.1.4090.000781
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11B.1.5380.008065
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11B.1.5750.000303
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11P.10.000016
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11P.1.170.000162
ORF1ab/nsp2559I559VAttGtt11Q.80.000165