CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : Mut = I479V

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2479I479VI659VnonsynAttGtt56856812240-2242

Details of the mutation I479V within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt568568All0.000109
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt9292AY.170.754098
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt8383AY.90.00561
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt8080B.1.1.70.000072
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt7575AY.690.014
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt4747AY.40.000073
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt2626B.1.617.20.000098
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt2323AY.250.000138
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt2020AY.1030.000124
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt1010P.10.000158
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt77B.1.6370.000512
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt77C.370.000812
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt55AY.30.00005
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt55B.10.000046
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt55B.1.2580.000333
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt44B.1.20.000035
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt44B.1.3510.000119
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt44D.20.0003
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt33A.2.50.001497
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt33AY.1090.002219
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt33AY.230.000209
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt33AY.430.000013
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt33AY.460.000312
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt33AY.5.40.00083
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt33B.1.1.4160.002715
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt33B.1.1.5210.016043
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt22A.10.000564
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt22AY.130.000322
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt22AY.420.00008
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt22AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt22B.1.1.1700.002494
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt22B.1.4270.000101
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11A.50.001923
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11AY.100.00053
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11AY.260.000028
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11AY.290.000016
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11AY.320.000532
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11AY.330.000067
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11AY.390.000025
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11AY.440.000006
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11AY.470.000031
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11AY.50.000021
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11AY.540.000095
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11AY.550.000917
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11AY.650.000533
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11AY.750.000056
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11AY.980.000079
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11B.1.1.2160.00089
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11B.1.177.600.000218
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11B.280.003279
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11P.1.120.000484
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11P.20.000187
ORF1ab/nsp2479I479VAttGtt11Q.80.000165