CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : Mut = I21V

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp221I21VI201VnonsynAttGtt6616590.996974866-868
ORF1ab/nsp221I21VI201VnonsynAtTGtC66120.00302572866-868

Details of the mutation I21V within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt659661All0.000126
ORF1ab/nsp221I21VAtTGtC2661All0
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt479480B.1.1.5190.019022
ORF1ab/nsp221I21VAtTGtC1480B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt2828B.1.1.70.000025
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt2222AY.40.000034
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt2121AY.430.000093
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt1010B.1.617.20.000038
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt99B.1.10.000163
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt88AY.250.000048
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt77AY.30.00007
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt77B.1.4860.777778
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt55B.1.1.2220.00102
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt55B.1.1.280.001556
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt55B.1.177.150.003155
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt44AY.440.000024
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt44B.10.000037
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt33AY.98.10.000145
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt33Q.10.000379
ORF1ab/nsp221I21VAtTGtC120.055556
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt120.055556
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt22AY.1000.000092
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt22AY.1030.000012
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt22B.1.177.100.001756
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt22B.1.177.120.000303
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt11AY.200.000039
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt11AY.230.00007
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt11AY.260.000028
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt11AY.360.000148
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt11AY.390.000025
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt11AY.460.000104
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt11AY.470.000031
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt11AY.610.000105
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt11AY.860.00083
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt11AY.950.000761
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt11B.1.1.1750.076923
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt11B.1.1.2360.006897
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt11B.1.1.3260.001761
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt11B.1.177.240.001295
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt11B.1.2910.019231
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt11B.1.4680.005714
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt11B.1.5170.000427
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt11B.1.5580.004566
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt11B.1.5640.000426
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt11C.370.000116
ORF1ab/nsp221I21VAttGtt11P.1.150.000232