CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : Mut = G548C

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2548G548CG728CnonsynGgcTgc407940770.999512447-2449
ORF1ab/nsp2548G548CG728CnonsynGgCTgT407920.0004903162447-2449

Details of the mutation G548C within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc40774079All0.00078
ORF1ab/nsp2548G548CGgCTgT24079All0
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc567567AY.40.000882
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc540540B.1.1.70.000483
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc484485B.1.1.700.165075
ORF1ab/nsp2548G548CGgCTgT1485B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc437438B.1.177.350.302004
ORF1ab/nsp2548G548CGgCTgT1438B.1.177.350.000691
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc316316AY.30.003143
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc149149B.1.617.20.000561
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc131131C.31
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc9898B.1.1.4320.124051
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc9191AY.1030.000565
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc8484B.10.000769
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc7575AY.1180.004699
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc6262AY.330.00414
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc6060P.10.000945
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc5858AY.50.001198
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc5555AY.430.000244
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc5555B.1.5950.014353
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc4343B.1.10.00078
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc4141B.1.5990.149635
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc3737B.1.20.000326
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc3636AY.250.000217
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc3636B.1.5880.032757
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc2727B.1.3510.000803
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc2222B.1.2210.001563
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc2020B.1.177.850.108696
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc2020B.1.3690.005705
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc1919AY.440.000116
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc1919AY.610.001991
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc1818B.1.4290.000424
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc1717A0.006579
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc1717AY.1020.000451
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc1717AY.980.001343
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc1313AY.1200.000483
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc1313AY.290.000205
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc1313AY.740.001503
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc1313B.1.2430.000905
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc1212AY.1190.000424
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc1212AY.390.000297
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc1212AY.99.20.001106
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc1212B.1.1770.000158
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc1111B.1.1.5190.000437
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc99AY.420.000362
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc99B.1.4270.000454
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc88P.1.140.000382
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc77AY.1000.000322
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc77AY.200.000272
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc77B.1.177.860.001284
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc77B.1.2580.000466
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc66AY.260.00017
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc66AY.39.10.000238
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc66AY.4.50.000645
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc66AZ.20.004926
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc66B.1.177.620.007151
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc66B.1.360.000875
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc66B.1.5260.000141
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc66P.20.00112
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc55AY.46.50.000992
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc55B.1.1.3070.012658
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc55B.1.6210.000443
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc44AY.1170.000338
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc44AY.230.000279
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc44B.1.1.630.001543
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc44B.1.3240.006421
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc44B.1.617.10.000516
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc44P.1.70.001277
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc33AY.240.001293
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc33AY.29.10.000662
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc33AY.460.000312
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc33AY.60.000123
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc33AY.840.001312
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc33AY.9.20.00011
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc33B.1.1.2140.000166
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc33B.1.1.280.000934
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc33B.1.1600.000094
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc33B.1.4130.012766
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc33B.1.5250.000339
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc33B.1.5750.00091
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc33B.1.5960.000261
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc33B.1.619.10.001924
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc33C.370.000348
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc22AP.10.003003
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc22AY.100.00106
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc22AY.1060.00067
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc22AY.1160.000574
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc22AY.1210.000271
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc22AY.160.000759
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc22AY.20.000712
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc22AY.23.10.000835
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc22AY.46.40.000329
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc22AY.470.000062
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc22AY.5.10.007519
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc22AY.5.30.000675
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc22AY.530.000575
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc22AY.750.000112
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc22B.1.1.1760.000879
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc22B.1.1.2220.000408
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc22B.1.1.2440.030769
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc22B.1.1.2770.001517
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc22B.1.1.2940.002532
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc22B.1.1.330.000842
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc22B.1.1.3540.008772
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc22B.1.177.420.001789
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc22B.1.3110.000549
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc22B.1.3990.003868
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc22B.1.438.10.000215
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc22B.1.6370.000146
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc22D.20.00015
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc22P.1.20.002312
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11A.10.000282
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11AL.10.012987
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11AV.10.005051
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11AY.1040.001984
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11AY.1050.000643
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11AY.120.000316
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11AY.220.002092
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11AY.270.000065
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11AY.300.000396
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11AY.310.018519
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11AY.340.000097
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11AY.450.000122
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11AY.550.000917
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11AY.590.00053
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11AY.650.000533
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11AY.680.000274
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11AY.690.000187
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11AY.710.000475
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11AY.80.000606
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11AY.920.000287
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11AY.990.001049
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B0.000128
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.1.1350.004695
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.1.2160.00089
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.1.2190.005
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.1.2410.00207
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.1.3260.001761
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.1.3310.011628
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.1.3690.000446
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.1.4340.000349
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.1.4480.002033
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.1.520.012195
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.1.890.006061
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.177.120.000152
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.177.450.000381
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.177.600.000218
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.177.630.002703
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.177.70.000165
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.2370.004975
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.36.100.004785
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.36.190.009259
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.4040.001302
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.415.10.007576
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.4160.001269
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.4250.002994
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.5300.007143
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.5610.000397
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.5680.001111
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.617.30.002985
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.6190.000871
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.1.6200.000946
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.40.002208
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11B.60.00091
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11N.50.001767
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11P.70.004367
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11Q.20.000613
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11Q.30.000145
ORF1ab/nsp2548G548CGgcTgc11R.10.00009