CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : Mut = G339S

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2339G339SG519SnonsynGgtAgt536175361711820-1822

Details of the mutation G339S within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt5361753617All0.010255
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt99319931AY.1030.061662
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt68286828B.1.1.70.006113
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt50185018AY.40.00781
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt27572757AY.410.810406
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt26912691B.1.617.20.010133
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt20562056AY.7.10.231714
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt18741874AY.440.011407
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt18041804AY.620.786057
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt16231623AY.30.016143
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt14851485AY.430.006579
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt12841284AY.98.10.062185
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt12531253B.1.177.730.709513
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt11121112AY.460.115737
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt987987AY.250.005937
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt716716B.1.1770.009428
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt598598B.1.5260.014056
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt543543AY.390.013418
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt521521AY.240.224569
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt424424B.1.1.1890.641452
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt418418B.1.20.003681
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt380380B.1.1.2940.481013
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt339339AY.1020.008988
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt323323AY.750.018095
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt256256B.10.002345
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt255255AY.1200.009481
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt226226AY.4.20.004902
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt217217AY.50.004481
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt197197AV.10.994949
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt193193AY.260.005464
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt191191B.1.10.003465
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt184184P.20.034341
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt181181P.1.150.042054
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt164164AY.130.026401
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt160160AY.1170.013523
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt159159P.10.002505
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt153153AY.290.002413
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt149149AY.60.006128
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt136136B.1.4290.0032
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt132132AY.1000.006073
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt127127B.1.2340.016757
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt120120AY.1180.007518
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt120120AY.99.20.011059
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt120120B.1.1.1700.149626
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt111111AY.200.004314
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt110110A.23.10.077465
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt106106AY.1100.011945
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt106106AY.1190.003743
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt106106B.1.1.5190.004209
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt105105B.1.1.3170.043228
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt9797AY.330.006477
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt9797B.1.1.4340.03381
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt9090AY.360.013339
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt8888AY.420.00354
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt8181AY.610.008487
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt7979AY.46.60.005704
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt7676B.1.6210.006727
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt7373AY.470.002271
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt7373AY.9.20.002681
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt7272B.1.3510.00214
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt7070AY.230.004882
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt7070AY.90.004732
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt7070B.1.6370.005115
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt6969AY.160.026196
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt6969AY.340.006691
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt6565AY.140.005721
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt6565B.6.60.057778
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt6363AY.940.027888
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt6060AY.700.01251
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt5858B.1.1.2140.003217
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt5757AY.980.004503
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt5656AY.450.006814
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt5555AY.1140.012711
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt5353P.30.08453
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt5252AY.39.10.00206
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt5050B.1.360.007295
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt5050B.1.4320.561798
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt4949C.370.005687
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt4848B.1.1050.461538
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt4646AY.3.10.003922
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt4545AY.4.2.10.006704
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt4545AY.4.50.004837
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt4545B.1.1.280.014006
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt4141B.400.014936
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt4040AY.850.017087
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt3838B.1.177.150.023975
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt3737AY.1060.012391
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt3636AY.75.10.006491
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt3434AY.1130.004841
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt3434B0.004346
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt3434B.1.36.80.034
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt3333AY.270.002136
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt3333AY.5.30.011134
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt3232B.1.2580.00213
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt3131B.1.1.370.005979
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt3131B.1.1600.000967
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt3131B.1.4270.001565
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt3131B.1.5960.002701
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt2929AY.1160.008317
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt2828B.1.36.180.011765
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt2727AY.4.40.011047
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt2727AY.480.012558
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt2727B.1.2430.001879
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt2727B.1.5750.008192
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt2727Q.80.004453
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt2525AY.1210.003383
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt2525B.1.1.3180.007544
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt2525B.1.3690.007131
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt2525N.30.145349
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt2424AY.530.006901
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt2424B.1.3190.073171
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt2424B.1.6280.008457
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt2222AY.46.40.003619
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt2222AY.490.070288
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt2222B.1.1.2550.066667
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt2222P.1.120.010649
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt2020AY.370.006321
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt2020B.1.2210.001421
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt2020B.1.351.30.017528
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt2020B.1.466.20.007825
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1919AY.590.010064
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1818AY.46.20.011436
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1818AY.660.019251
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1818P.1.40.017578
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1717A.2.5.10.081731
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1717B.1.36.290.008795
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1616AY.116.10.004983
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1616B.1.1.10.005227
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1616B.1.177.70.002638
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1515AY.1090.011095
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1515AY.300.005936
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1515AY.34.10.007649
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1515B.1.1.500.010183
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1414AY.540.001335
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1414AY.740.001619
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1414B.1.1.3970.031532
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1414B.1.177.650.009315
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1414B.1.5250.001584
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1414P.1.100.003773
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1313AY.1010.006376
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1313AY.1050.00836
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1313B.1.1.3060.005699
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1313M.31
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1212AY.10.004749
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1212AY.5.20.029557
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1212AY.670.005571
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1212AY.820.016282
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1212B.1.2400.002587
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1212B.1.4090.009375
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1212C.160.012725
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1212Q.10.001516
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1111AY.690.002053
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1111AY.730.007319
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1111M.20.916667
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1111P.1.10.003494
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1010AY.16.10.004699
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1010AY.46.10.010267
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1010AY.920.002873
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1010B.1.1.1960.057143
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1010B.1.3110.002746
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt1010B.1.6200.009461
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt99AY.1070.004194
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt99AY.1110.001648
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt99AY.190.010262
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt99AY.510.008182
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt99AY.550.008257
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt99AY.680.002464
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt99B.1.214.30.064286
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt99B.1.221.10.026163
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt99B.1.258.110.003567
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt99B.1.258.170.000936
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt99B.1.3090.428571
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt99B.1.3610.011598
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt99B.1.4040.011719
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt99B.1.5090.007792
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt99B.1.617.10.001161
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt99P.40.034221
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt88AY.120.2.10.003986
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt88AY.380.003994
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt88AY.46.50.001587
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt88AY.560.012841
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt88B.1.1.2220.001632
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt88B.1.2410.006494
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt88P.1.140.000382
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt88P.1.70.002554
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt77A0.002709
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt77AY.1040.013889
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt77AY.120.20.008997
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt77AY.70.001372
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt77AY.840.003062
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt77B.1.1460.029661
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt77B.1.2790.003595
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt77P.1.60.013619
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt66AY.1080.006615
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt66AY.120.001896
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt66AY.20.002137
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt66AY.29.10.001323
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt66AY.5.40.00166
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt66AY.650.003198
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt66AY.710.00285
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt66AY.9.10.000502
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt66B.1.1.3540.026316
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt66B.1.177.520.010545
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt66B.1.177.830.008889
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt66B.1.2320.003224
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt66B.1.351.20.001815
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt66B.1.5950.001566
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt55A.2.50.002495
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt55A.270.008278
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt55AY.100.00265
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt55AY.220.01046
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt55AY.320.002662
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt55AY.600.00469
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt55B.1.1.1290.045872
ORF1ab/nsp2339G339SGgtAgt55B.1.1.330.002104
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