CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : Mut = G262S

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2262G262SG442SnonsynGgtAgt160015990.9993751589-1591
ORF1ab/nsp2262G262SG442SnonsynGgTAgC160010.0006251589-1591

Details of the mutation G262S within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt15991600All0.000306
ORF1ab/nsp2262G262SGgTAgC11600All0
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt221221AY.40.000344
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt180180B.1.1.70.000161
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt170170B.1.10.003084
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt145145AY.250.000872
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt144144B.1.2520.953642
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt6768B.1.617.20.000252
ORF1ab/nsp2262G262SGgTAgC168B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt3838AY.740.004395
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt3838B.10.000348
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt3434B.1.1.4490.772727
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt3131AY.46.40.0051
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt2828AY.1190.000989
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt2424AY.30.000239
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt2424B.1.258.170.002495
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt2121B.1.1770.000277
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt2020B.1.1.4340.006971
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt1919AY.430.000084
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt1818B.1.1.2140.000998
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt1818B.1.3510.000535
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt1717AY.9.20.000624
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt1717B.1.2340.002243
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt1616AY.230.001116
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt1616B.1.1.3480.012739
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt1313AY.1030.000081
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt1313AY.120.10.004173
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt1212AY.440.000073
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt1111B.1.5260.000259
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt1010AY.91.10.04065
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt1010B.1.5610.00397
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt99B.1.1.370.001736
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt99B.1.20.000079
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt99B.1.6190.00784
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt99P.1.40.008789
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt88B.1.1600.00025
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt88P.20.001493
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt77B.1.2430.000487
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt66AY.390.000148
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt66AY.750.000336
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt66B.1.6210.000531
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt55AY.1170.000423
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt55AY.200.000194
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt55AY.300.001979
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt55B.1.4290.000118
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt55B.150.087719
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt440.222222
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt44AY.260.000113
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt44AY.290.000063
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt44AY.460.000416
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt44AY.90.00027
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt44P.10.000063
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt33AY.1020.00008
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt33AY.1200.000112
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt33AY.160.001139
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt33AY.330.0002
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt33AY.60.000123
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt33B.1.1.330.001263
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt33B.1.2210.000213
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt33Q.30.000435
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt22AD.20.000438
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt22AY.1040.003968
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt22AY.320.001065
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt22AY.420.00008
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt22AY.50.000041
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt22AY.610.00021
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt22B.1.1.2200.003717
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt22B.1.1.250.001137
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt22B.1.1.2750.022472
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt22B.1.1.5140.076923
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt22B.1.1.530.027397
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt22B.1.36.180.00084
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt22B.1.617.10.000258
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt22P.1.140.000096
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt22R.10.00018
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11AE.80.000489
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11AY.1050.000643
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11AY.1060.000335
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11AY.120.000316
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11AY.240.000431
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11AY.340.000097
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11AY.350.000233
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11AY.360.000148
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11AY.470.000031
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11AY.540.000095
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11AY.7.20.000559
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11AY.980.000079
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11B.1.1.1340.011364
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11B.1.1.2770.000759
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11B.1.1.3330.001076
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11B.1.1.3510.002793
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11B.1.1.3710.010417
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11B.1.1.3880.045455
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11B.1.1.4190.007407
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11B.1.1.440.00241
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11B.1.1.500.000679
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11B.1.160.310.008065
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11B.1.177.520.001757
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11B.1.177.770.000726
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11B.1.2320.000537
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11B.1.258.90.005
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11B.1.351.50.0006
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11B.1.5170.000427
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11B.1.5870.001898
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11B.400.000364
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11C.370.000116
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11N.90.005952
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11P.1.70.000319
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11P.30.001595
ORF1ab/nsp2262G262SGgtAgt11P.70.004367