CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : Mut = G262G

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2262G262GG442GsynggTggC2802340.8357141589-1591
ORF1ab/nsp2262G262GG442GsynggTggG280410.1464291589-1591
ORF1ab/nsp2262G262GG442GsynggTggA28050.01785711589-1591

Details of the mutation G262G within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC234280All0.000045
ORF1ab/nsp2262G262GggTggG41280All0.000008
ORF1ab/nsp2262G262GggTggA5280All0.000001
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC4448B.10.000403
ORF1ab/nsp2262G262GggTggG348B.10.000027
ORF1ab/nsp2262G262GggTggA148B.10.000009
ORF1ab/nsp2262G262GggTggG2239B.1.1.70.00002
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC1739B.1.1.70.000015
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC2525C.400.694444
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC2121AY.40.000033
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC1717B.1.1.2280.051829
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC1415B.1.617.20.000053
ORF1ab/nsp2262G262GggTggG115B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC1313B.1.4290.000306
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC1212B.1.3110.003295
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC99AY.30.00009
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC88B.1.1.630.003086
ORF1ab/nsp2262G262GggTggG460.222222
ORF1ab/nsp2262G262GggTggA260.111111
ORF1ab/nsp2262G262GggTggG36B.1.2210.000213
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC26B.1.2210.000142
ORF1ab/nsp2262G262GggTggA16B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC44AY.260.000113
ORF1ab/nsp2262G262GggTggG34AY.430.000013
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC14AY.430.000004
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC44B.1.4270.000202
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC44B.1.5260.000094
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC33AY.1030.000019
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC33AY.250.000018
ORF1ab/nsp2262G262GggTggG33B.1.10.000054
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC33P.10.000047
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC22AL.10.025974
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC22AY.1210.000271
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC22AY.440.000012
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC22AY.470.000062
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC22AY.750.000112
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC12AY.90.000068
ORF1ab/nsp2262G262GggTggA12AY.90.000068
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC22B.1.2340.000264
ORF1ab/nsp2262G262GggTggG22B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC11A.2.50.000499
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC11AY.420.00004
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC11AY.590.00053
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC11AY.700.000209
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC11B.1.1.1530.001095
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC11B.1.36.160.001425
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC11B.1.4220.000812
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC11B.1.5510.00129
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC11B.600.015873
ORF1ab/nsp2262G262GggTggC11P.20.000187