CoV-GLUE | Mutations | Mutation
Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):
ORF | CodonNum | Mut | ORF1abMut | MutType | RefCodon | MutCodon | AACount | CodonCount | CodonProp | Genome Position |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | G334G | syn | ggC | ggT | 87075 | 86857 | 0.997496 | 1265-1267 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | G334G | syn | ggC | ggA | 87075 | 196 | 0.00225093 | 1265-1267 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | G334G | syn | ggC | ggG | 87075 | 22 | 0.000252656 | 1265-1267 |
Details of the mutation G154G within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):
ORF | CodonNum | Mut | RefCodon | MutCodon | CodonCount | AACount | Lineage | LineageCodonProp |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 86857 | 87075 | All | 0.016612 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggA | 196 | 87075 | All | 0.000037 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggG | 22 | 87075 | All | 0.000004 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 28337 | 28350 | B.1.617.2 | 0.106701 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggG | 13 | 28350 | B.1.617.2 | 0.000049 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 11245 | 11245 | AY.14 | 0.989703 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 10052 | 10052 | AY.54 | 0.958429 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 5743 | 5743 | AY.13 | 0.924501 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 4204 | 4204 | AY.35 | 0.979725 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 3227 | 3227 | AY.53 | 0.927832 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2437 | 2437 | AY.30 | 0.964385 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2417 | 2417 | AY.16 | 0.917616 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1946 | 1946 | AY.48 | 0.905116 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1718 | 1718 | AY.16.1 | 0.807331 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1623 | 1623 | AY.8 | 0.983636 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1350 | 1350 | AY.99.2 | 0.124412 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1169 | 1169 | AY.50 | 0.934452 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1062 | 1062 | AY.51 | 0.965455 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 917 | 917 | AY.40 | 0.884282 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 838 | 838 | AY.52 | 0.68241 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 611 | 613 | B.1 | 0.005596 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggA | 2 | 613 | B.1 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 459 | 536 | B.1.1.7 | 0.000411 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggA | 75 | 536 | B.1.1.7 | 0.000067 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggG | 2 | 536 | B.1.1.7 | 0.000002 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 450 | 450 | AY.43 | 0.001994 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 448 | 448 | AY.15 | 0.995556 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 424 | 425 | AY.44 | 0.002581 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggA | 1 | 425 | AY.44 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 390 | 390 | AY.19 | 0.444698 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 273 | 273 | AY.49 | 0.872204 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 223 | 223 | AY.68 | 0.061046 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 217 | 217 | AY.120 | 0.008068 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 185 | 185 | AY.75 | 0.010364 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 155 | 155 | AY.103 | 0.000962 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 155 | 155 | AY.98 | 0.012244 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 147 | 151 | AY.4 | 0.000229 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggA | 4 | 151 | AY.4 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 143 | 143 | AY.65 | 0.076226 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 141 | 141 | AY.38 | 0.070394 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 134 | 134 | AY.62 | 0.058388 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 129 | 129 | AY.55 | 0.118349 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 128 | 128 | AY.108 | 0.141125 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 126 | 126 | AY.23 | 0.008788 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 122 | 122 | AY.9.2 | 0.004481 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 115 | 115 | AY.102 | 0.003049 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 112 | 112 | AY.59 | 0.059322 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 103 | 107 | AY.3 | 0.001024 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggA | 4 | 107 | AY.3 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggA | 102 | 104 | B.1.526 | 0.002397 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 104 | B.1.526 | 0.000047 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 103 | 103 | AY.39 | 0.002545 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 97 | 97 | AY.18 | 0.979798 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 90 | 90 | AY.17 | 0.737705 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 89 | 89 | AY.67 | 0.041318 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 88 | 88 | AY.75.1 | 0.015867 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 85 | 85 | AY.47 | 0.002644 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 75 | 77 | B.1.2 | 0.00066 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggA | 2 | 77 | B.1.2 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 76 | 76 | P.1.14 | 0.003633 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 72 | 74 | AY.20 | 0.002798 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggA | 2 | 74 | AY.20 | 0.000078 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 68 | 68 | AY.105 | 0.04373 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 65 | 65 | AY.36 | 0.009634 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 63 | 63 | AY.61 | 0.006601 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 60 | 60 | AY.37 | 0.018963 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 59 | 59 | AY.119 | 0.002083 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 59 | 59 | AY.25 | 0.000355 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 59 | 59 | AY.92 | 0.016949 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 55 | 55 | AY.56 | 0.088283 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 55 | 55 | AY.64 | 0.032738 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 54 | 55 | B | 0.006902 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggA | 1 | 55 | B | 0.000128 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 53 | 53 | AY.117 | 0.004479 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 53 | 53 | AY.26 | 0.0015 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 53 | 53 | AY.31 | 0.981481 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 51 | 51 | AY.34 | 0.004945 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 48 | 48 | AY.5.4 | 0.013282 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 47 | 47 | B.1.258 | 0.003128 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 47 | 47 | B.1.525 | 0.005319 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 44 | 44 | AY.10 | 0.023317 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 43 | 43 | AY.66 | 0.045989 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 42 | 42 | AY.29 | 0.000662 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 39 | 39 | C.37 | 0.004526 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 33 | 33 | AY.70 | 0.006881 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 33 | 33 | P.1 | 0.00052 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 28 | 28 | AY.116 | 0.00803 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 28 | 28 | AY.78 | 0.043143 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 28 | 28 | B.1.1.519 | 0.001112 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 27 | 27 | AY.45 | 0.003285 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 27 | 27 | B.1.1.304 | 0.075843 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 27 | 27 | B.1.427 | 0.001363 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 25 | 25 | AY.121 | 0.003383 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 25 | 25 | AY.33 | 0.001669 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 24 | 24 | AY.24 | 0.010345 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 24 | 24 | AY.58 | 0.021779 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 24 | 24 | AY.86 | 0.019917 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 23 | 23 | B.1.596 | 0.002004 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 22 | 22 | B.1.1 | 0.000399 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 14 | 20 | AY.100 | 0.000644 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggG | 6 | 20 | AY.100 | 0.000276 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 20 | 20 | AY.41 | 0.005879 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 20 | 20 | AY.77 | 0.022548 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 20 | 20 | B.1.177 | 0.000263 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 19 | 19 | AY.4.2 | 0.000412 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 19 | 19 | AY.4.2.1 | 0.002831 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 18 | 19 | AY.46 | 0.001873 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggA | 1 | 19 | AY.46 | 0.000104 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 18 | 18 | AY.73 | 0.011976 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 18 | 18 | B.1.400 | 0.007722 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 17 | 17 | AY.110 | 0.001916 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 16 | 16 | AY.28 | 0.030246 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 16 | 16 | AY.85 | 0.006835 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 15 | 15 | AY.42 | 0.000603 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 15 | 15 | AY.9.1 | 0.001256 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 15 | 15 | B.1.429 | 0.000353 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 15 | 15 | B.1.617.1 | 0.001934 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 14 | 14 | AY.74 | 0.001619 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 14 | 14 | AY.98.1 | 0.000678 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 14 | 14 | B.1.1.1 | 0.004574 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 13 | 14 | B.1.36.29 | 0.006725 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggA | 1 | 14 | B.1.36.29 | 0.000517 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 13 | 13 | AY.21 | 0.024668 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 13 | 13 | AY.57 | 0.00853 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 13 | 13 | AY.87 | 0.010824 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 13 | 13 | B.1.160 | 0.000405 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 13 | 13 | B.1.214 | 0.047619 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 12 | 12 | AY.118 | 0.000752 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 12 | 12 | AY.5 | 0.000248 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 12 | 12 | AY.9 | 0.000811 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 12 | 12 | B.1.577 | 0.008247 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 10 | 10 | AY.39.1 | 0.000396 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 10 | 10 | AY.7.1 | 0.001127 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 10 | 10 | AY.71 | 0.004751 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 10 | 10 | AY.84 | 0.004374 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 9 | 9 | AY.114 | 0.00208 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 9 | 9 | AY.46.2 | 0.005718 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 9 | 9 | B.1.351 | 0.000268 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 9 | 9 | R.1 | 0.00081 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 8 | 8 | AY.106 | 0.002679 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 8 | 8 | AY.88 | 0.007073 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 8 | 8 | AY.95 | 0.006088 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 8 | 8 | P.1.16 | 0.002993 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 7 | 7 | B.1.1.214 | 0.000388 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 7 | 7 | B.1.1.303 | 0.019337 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 7 | 7 | B.1.575 | 0.002124 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 6 | 6 | AY.109 | 0.004438 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 6 | 6 | AY.12 | 0.001896 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 6 | 6 | AY.93 | 0.001638 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 6 | 6 | AY.99.1 | 0.009317 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 6 | 6 | B.1.243 | 0.000418 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 6 | 6 | B.1.311 | 0.001647 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 6 | 6 | B.1.36.8 | 0.006 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 5 | 5 | A.27 | 0.008278 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 5 | 5 | AY.101 | 0.002452 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 5 | 5 | AY.120.2.1 | 0.002491 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 5 | 5 | AY.22 | 0.01046 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 5 | 5 | AY.32 | 0.002662 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 5 | 5 | AY.7.2 | 0.002796 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 5 | 5 | AY.81 | 0.00996 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 5 | 5 | B.1.1.397 | 0.011261 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 4 | 5 | B.1.221 | 0.000284 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggA | 1 | 5 | B.1.221 | 0.000071 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 5 | 5 | B.1.409 | 0.003906 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 5 | 5 | B.1.595 | 0.001305 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 4 | 4 | AY.4.5 | 0.00043 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 4 | 4 | B.1.177.54 | 0.002426 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 4 | 4 | B.1.177.56 | 0.00267 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 4 | 4 | B.1.177.73 | 0.002265 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 4 | 4 | B.1.265 | 0.005083 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 4 | 4 | B.1.36 | 0.000584 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 4 | 4 | B.1.438.1 | 0.000429 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 4 | 4 | B.1.459 | 0.016327 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 4 | 4 | B.1.466.2 | 0.001565 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 4 | 4 | B.1.619 | 0.003484 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 4 | 4 | Q.8 | 0.00066 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 3 | 3 | A.2.5 | 0.001497 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 3 | 3 | AY.104 | 0.005952 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 3 | 3 | AY.11 | 0.004016 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 3 | 3 | AY.120.1 | 0.000963 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 3 | 3 | AY.27 | 0.000194 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 3 | 3 | AY.46.6 | 0.000217 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 3 | 3 | AY.72 | 0.004082 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 3 | 3 | AY.91 | 0.002191 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 3 | 3 | B.1.1.213 | 0.065217 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 3 | 3 | B.1.1.33 | 0.001263 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 3 | 3 | B.1.1.37 | 0.000579 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 3 | 3 | B.1.177.4 | 0.000633 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 3 | 3 | B.1.240 | 0.000647 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 3 | 3 | B.1.241 | 0.002435 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 3 | 3 | D.2 | 0.000225 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 2 | 0.055556 | |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggG | 1 | 2 | 0.055556 | |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | A | 0.000774 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | AE.8 | 0.000978 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | AY.1 | 0.000791 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | AY.113 | 0.000285 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | AY.29.1 | 0.000441 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | AY.3.1 | 0.000171 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | AY.4.4 | 0.000818 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | AY.46.1 | 0.002053 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | AY.5.3 | 0.000675 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | AY.6 | 0.000082 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | AY.63 | 0.000774 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | AY.80 | 0.002257 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | AY.82 | 0.002714 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | AY.90 | 0.001369 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | AY.99 | 0.002099 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.1.204 | 0.006079 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.1.298 | 0.001724 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.1.337 | 0.007194 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.1.348 | 0.001592 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.1.385 | 0.008929 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.1.398 | 0.006452 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.1.70 | 0.000682 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.147 | 0.001512 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.153 | 0.037736 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.177.44 | 0.001038 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.367 | 0.001585 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.369 | 0.00057 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.575.1 | 0.004878 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.576 | 0.001813 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.580 | 0.00813 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.582 | 0.000981 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.621 | 0.000177 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | P.1.1 | 0.000635 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 2 | 2 | P.1.6 | 0.003891 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | A.3 | 0.002096 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | AD.1 | 0.004115 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | AV.1 | 0.005051 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.111 | 0.000183 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.120.2 | 0.001285 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.23.1 | 0.000417 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.60 | 0.000938 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.69 | 0.000187 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.7 | 0.000196 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.76 | 0.004831 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.83 | 0.001724 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.94 | 0.000443 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.96 | 0.002075 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.97 | 0.001701 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.10 | 0.001115 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.170 | 0.001247 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.236 | 0.006897 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.25 | 0.000569 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.28 | 0.000311 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.282 | 0.011628 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.294 | 0.001266 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.326 | 0.001761 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.378 | 0.007299 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.433 | 0.001425 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.46 | 0.004367 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.77 | 0.041667 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.110 | 0.004525 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.131 | 0.008772 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.157 | 0.002985 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.177.21 | 0.000076 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.177.53 | 0.002392 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.177.60 | 0.000218 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.177.86 | 0.000183 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.214.4 | 0.009091 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.234 | 0.000132 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.239 | 0.001221 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.260 | 0.003344 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.340 | 0.004292 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.36.7 | 0.004 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.366 | 0.004878 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.377 | 0.004566 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.396 | 0.000706 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.411 | 0.003704 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.470 | 0.001404 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.471 | 0.002732 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.499 | 0.00105 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.501 | 0.007353 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.505 | 0.004386 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.509 | 0.000866 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.530 | 0.007143 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.567 | 0.003333 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.621.1 | 0.000506 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.623 | 0.000536 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.631 | 0.003367 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.637 | 0.000073 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.84 | 0.020833 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.3 | 0.000831 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.4 | 0.002208 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | C.11 | 0.010638 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | C.14 | 0.004329 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | C.36 | 0.000911 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | P.1.10 | 0.000269 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | P.1.12 | 0.000484 |
ORF1ab/nsp2 | 154 | G154G | ggC | ggT | 1 | 1 | P.3 | 0.001595 |
CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk
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