CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : Mut = F10L

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp210F10LF190LnonsynTtcCtc290427680.953168833-835
ORF1ab/nsp210F10LF190LnonsynttCttA29041180.0406336833-835
ORF1ab/nsp210F10LF190LnonsynttCttG2904100.00344353833-835
ORF1ab/nsp210F10LF190LnonsynTtCCtA290460.00206612833-835
ORF1ab/nsp210F10LF190LnonsynTtCCtT290420.000688705833-835

Details of the mutation F10L within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc27682904All0.000529
ORF1ab/nsp210F10LttCttA1182904All0.000023
ORF1ab/nsp210F10LttCttG102904All0.000002
ORF1ab/nsp210F10LTtCCtA62904All0.000001
ORF1ab/nsp210F10LTtCCtT22904All0
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc12581262B.10.011523
ORF1ab/nsp210F10LttCttA31262B.10.000027
ORF1ab/nsp210F10LTtCCtT11262B.10.000009
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc990990B.1.4260.998991
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc314314B.1.4250.94012
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc2340B.1.1.70.000021
ORF1ab/nsp210F10LttCttA1540B.1.1.70.000013
ORF1ab/nsp210F10LttCttG240B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp210F10LttCttA3235AY.430.000142
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc335AY.430.000013
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc3030B.1.5940.9375
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc2020AY.1030.000124
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc1919AY.1200.000706
ORF1ab/nsp210F10LttCttA1117AY.40.000017
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc617AY.40.000009
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc712B.1.20.000062
ORF1ab/nsp210F10LttCttA512B.1.20.000044
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc1011B.1.4270.000505
ORF1ab/nsp210F10LttCttA111B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc89B0.001022
ORF1ab/nsp210F10LttCttA19B0.000128
ORF1ab/nsp210F10LTtCCtA68AY.1190.000212
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc18AY.1190.000035
ORF1ab/nsp210F10LttCttA18AY.1190.000035
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc88B.1.3620.012327
ORF1ab/nsp210F10LttCttA48B.1.617.20.000015
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc48B.1.617.20.000015
ORF1ab/nsp210F10LttCttA66AY.260.00017
ORF1ab/nsp210F10LttCttG66B.1.5250.000679
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc66P.10.000095
ORF1ab/nsp210F10LttCttA45AY.250.000024
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc15AY.250.000006
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc55B.1.6210.000443
ORF1ab/nsp210F10LttCttA44AY.200.000155
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc34AY.50.000062
ORF1ab/nsp210F10LttCttA14AY.50.000021
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc44B.1.3670.00317
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc44B.1.5260.000094
ORF1ab/nsp210F10LttCttA33AY.440.000018
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc33B.1.3540.130435
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc33B.1.4460.06
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc33B.1.6320.020134
ORF1ab/nsp210F10LttCttA33Q.10.000379
ORF1ab/nsp210F10LTtCCtT120.055556
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc120.055556
ORF1ab/nsp210F10LttCttA22A.2.5.20.003145
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc22AY.1020.000053
ORF1ab/nsp210F10LttCttA22AY.290.000032
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc22AY.420.00008
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc12AY.610.000105
ORF1ab/nsp210F10LttCttA12AY.610.000105
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc22B.1.3020.026667
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc22B.1.3330.021053
ORF1ab/nsp210F10LttCttA22B.1.4040.002604
ORF1ab/nsp210F10LttCttA11A0.000387
ORF1ab/nsp210F10LttCttA11AY.1060.000335
ORF1ab/nsp210F10LttCttA11AY.1110.000183
ORF1ab/nsp210F10LttCttA11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp210F10LttCttA11AY.270.000065
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc11AY.30.00001
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp210F10LttCttA11AY.330.000067
ORF1ab/nsp210F10LttCttA11AY.350.000233
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc11AY.390.000025
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc11AY.46.10.001027
ORF1ab/nsp210F10LttCttA11AY.520.000814
ORF1ab/nsp210F10LttCttA11AY.530.000288
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc11AY.850.000427
ORF1ab/nsp210F10LttCttA11AY.90.000068
ORF1ab/nsp210F10LttCttA11AY.980.000079
ORF1ab/nsp210F10LttCttG11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp210F10LttCttA11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc11B.1.1.3350.012987
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc11B.1.1.4800.025
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc11B.1.1040.00369
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc11B.1.1100.004525
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc11B.1.177.440.000519
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc11B.1.177.540.000606
ORF1ab/nsp210F10LttCttA11B.1.177.600.000218
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc11B.1.177.620.001192
ORF1ab/nsp210F10LttCttA11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp210F10LttCttA11B.1.3010.005917
ORF1ab/nsp210F10LttCttG11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc11B.1.3490.000715
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc11B.1.3560.001727
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc11B.1.4280.00102
ORF1ab/nsp210F10LttCttA11B.1.438.10.000107
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc11B.1.4530.003236
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc11B.1.595.20.04
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp210F10LttCttA11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc11B.30.000831
ORF1ab/nsp210F10LTtcCtc11P.1.140.000048