CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : Mut = E460D

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2460E460DE640DnonsyngaGgaT338233500.9905382183-2185
ORF1ab/nsp2460E460DE640DnonsyngaGgaC3382320.009461862183-2185

Details of the mutation E460D within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT33503382All0.000641
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaC323382All0.000006
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT29762977AY.370.940582
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaC12977AY.370.000316
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT9797B.1.617.20.000365
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT5454AY.40.000084
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT4444B.1.1.70.000039
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaC2938AY.430.000128
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT938AY.430.00004
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT2222B.1.20.000194
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT1313B.1.6210.001151
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT1111AY.130.001771
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT1010AY.200.000389
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT88B.1.1770.000105
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT66A.2.5.20.009434
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT66AY.250.000036
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT55AY.1030.000031
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT55AY.4.20.000108
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT55AY.440.00003
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT44AY.450.000487
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT44B.10.000037
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT44B.1.10.000073
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT33AY.1170.000254
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT33AY.600.002814
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT33AY.610.000314
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT33B.1.1.2160.002671
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT33B.1.36.290.001552
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT33P.20.00056
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT120.055556
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaC120.055556
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT22AE.10.022727
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT22AY.260.000057
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT22AY.460.000208
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT22AY.650.001066
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT22B.1.360.000292
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT22B.1.4290.000047
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT22B.1.5260.000047
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT22P.10.000032
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11AU.20.002421
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11AY.230.00007
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11AY.30.00001
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11AY.540.000095
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11AY.620.000436
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11AY.710.000475
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11AY.740.000116
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11AY.930.000273
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11B0.000128
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11B.1.1.1280.007092
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11B.1.1.3110.000358
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11B.1.2060.000816
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11B.1.2840.013158
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11B.1.3050.002151
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11B.1.36.260.002857
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaC11B.1.3620.001541
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11B.1.4160.001269
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11B.1.4240.008065
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11B.1.80.001972
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11C.390.018868
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11D.20.000075
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11P.1.130.000898
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11P.1.170.000162
ORF1ab/nsp2460E460DgaGgaT11R.10.00009