CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : Mut = D409G

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2409D409GD589GnonsyngAtgGt342134190.9994152030-2032
ORF1ab/nsp2409D409GD589GnonsyngATgGC342110.0002923122030-2032
ORF1ab/nsp2409D409GD589GnonsyngATgGG342110.0002923122030-2032

Details of the mutation D409G within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt34193421All0.000654
ORF1ab/nsp2409D409GgATgGC13421All0
ORF1ab/nsp2409D409GgATgGG13421All0
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt17881789B.1.1.3170.736105
ORF1ab/nsp2409D409GgATgGC11789B.1.1.3170.000412
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt745745AY.40.00116
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt275276B.1.1.70.000246
ORF1ab/nsp2409D409GgATgGG1276B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt245245B.10.002244
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt6363AS.20.984375
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt5959B.1.10.00107
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt4141B.1.617.20.000154
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt1818AY.440.00011
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt1616AY.430.000071
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt99AY.250.000054
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt99B.1.3610.011598
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt88B.1.20.00007
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt77B.1.1.1610.024735
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt77B.1.36.170.003458
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt66AY.340.000582
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt66B.1.4290.000141
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt66P.10.000095
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt55AY.1030.000031
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt55AY.1190.000177
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt55B.1.1770.000066
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt44AY.3.10.000341
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt33AY.1020.00008
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt33AY.390.000074
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt33AY.75.10.000541
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt33AY.90.000203
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt33B.1.1.5190.000119
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt33B.1.177.70.000495
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt33B.1.2430.000209
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt33B.1.4080.01107
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt33B.1.466.20.001174
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt22AE.20.117647
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt22AY.300.000791
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt22AY.330.000134
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt22AY.34.10.00102
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt22AY.420.00008
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt22AY.70.000392
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt22AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt22B.1.1.3700.025316
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt22B.1.1.5210.010695
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt22B.1.4200.020833
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt22B.1.4270.000101
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt22Q.80.00033
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11A.2.50.000499
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11AY.1070.000466
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11AY.1090.00074
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11AY.290.000016
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11AY.30.00001
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11AY.46.50.000198
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11AY.60.000041
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11AY.750.000056
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11AY.770.001127
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11B.1.1.100.001115
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11B.1.1.1590.004673
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11B.1.1.1760.000439
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11B.1.1.1980.001468
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11B.1.1.2910.000742
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11B.1.1.3260.001761
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11B.1.1.3470.018182
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11B.1.1.3980.003226
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11B.1.177.600.000218
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11B.1.3240.001605
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11B.1.4170.028571
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11B.1.5580.004566
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11B.1.5640.000426
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11B.1.6280.000352
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11C.36.10.004149
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11N.50.001767
ORF1ab/nsp2409D409GgAtgGt11Q.10.000126