CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : Mut = C177S

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2177C177SC357SnonsyntGttCt7064910.6954671334-1336
ORF1ab/nsp2177C177SC357SnonsynTgtAgt7062130.30171334-1336
ORF1ab/nsp2177C177SC357SnonsyntGTtCA70620.002832861334-1336

Details of the mutation C177S within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2177C177StGttCt491706All0.000094
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt213706All0.000041
ORF1ab/nsp2177C177StGTtCA2706All0
ORF1ab/nsp2177C177StGttCt424429AY.1030.002633
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt4429AY.1030.000025
ORF1ab/nsp2177C177StGTtCA1429AY.1030.000006
ORF1ab/nsp2177C177StGttCt2935AY.40.000045
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt635AY.40.000009
ORF1ab/nsp2177C177StGttCt1734B.1.617.20.000064
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt1734B.1.617.20.000064
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt2022B.1.1.70.000018
ORF1ab/nsp2177C177StGttCt222B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt1616B.10.000147
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt1515AY.440.000091
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt89B.1.20.00007
ORF1ab/nsp2177C177StGttCt19B.1.20.000009
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt89B.1.4970.002518
ORF1ab/nsp2177C177StGttCt19B.1.4970.000315
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt88B.1.10.000145
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt77AY.1000.000322
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt56AY.250.00003
ORF1ab/nsp2177C177StGttCt16AY.250.000006
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt66AY.690.00112
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt55AY.1020.000133
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt55B.1.2810.108696
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt55B.1.4160.006345
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt44AY.260.000113
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt44AY.30.00004
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt44B.1.5760.003626
ORF1ab/nsp2177C177StGttCt23AY.1190.000071
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt13AY.1190.000035
ORF1ab/nsp2177C177StGttCt33B.1.360.000438
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt33B.1.5260.000071
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt33B.1.619.10.001924
ORF1ab/nsp2177C177StGttCt12AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt12AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt22AY.430.000009
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt22AY.450.000243
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt22AY.470.000062
ORF1ab/nsp2177C177StGttCt12AY.50.000021
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt12AY.50.000021
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt22AY.590.001059
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt22B.1.1.2200.003717
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt22B.1.1.5190.000079
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt22B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp2177C177StGttCt12B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt12B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp2177C177StGttCt22B.1.177.730.001133
ORF1ab/nsp2177C177StGttCt22B.1.2350.005038
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt22B.1.2400.000431
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt22B.1.3690.00057
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt22B.1.4290.000047
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt22B.1.4800.004975
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt22B.1.5250.000226
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt22B.1.5960.000174
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt22Q.30.00029
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt11A.2.50.000499
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt11A.210.00277
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp2177C177StGttCt11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp2177C177StGttCt11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp2177C177StGTtCA11AY.20.000356
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt11AY.200.000039
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt11AY.540.000095
ORF1ab/nsp2177C177StGttCt11AY.60.000041
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt11AY.780.001541
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt11AY.840.000437
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt11AY.910.00073
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt11B.1.1.4860.001577
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt11B.1.2390.001221
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt11B.1.3960.000706
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt11B.1.4000.000429
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt11B.1.4460.02
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt11B.1.4590.004082
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt11B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt11B.1.4680.005714
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt11B.1.5300.007143
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt11B.1.595.10.005848
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt11B.1.621.10.000506
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt11B.1.6300.005236
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt11C.370.000116
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt11P.10.000016
ORF1ab/nsp2177C177StGttCt11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt11P.1.160.000374
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt11P.1.170.000162
ORF1ab/nsp2177C177STgtAgt11R.10.00009