CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : Mut = A385A

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2385A385AA565AsyngcCgcT307928420.9230271958-1960
ORF1ab/nsp2385A385AA565AsyngcCgcA30792270.07372521958-1960
ORF1ab/nsp2385A385AA565AsyngcCgcG3079100.003247811958-1960

Details of the mutation A385A within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT28423079All0.000544
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA2273079All0.000043
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcG103079All0.000002
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT393396AY.40.000612
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA2396AY.40.000003
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcG1396AY.40.000002
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT318342B.1.1.70.000285
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA18342B.1.1.70.000016
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcG6342B.1.1.70.000005
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT193301AY.1030.001198
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA108301AY.1030.000671
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT218218AY.1110.039927
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT165165B.1.1.1381
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT151152B.1.1.5190.005996
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA1152B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT140140B.1.20.001233
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT108111AY.250.00065
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA2111AY.250.000012
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcG1111AY.250.000006
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT6799AY.430.000297
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA3299AY.430.000142
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT6869AY.30.000676
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA169AY.30.00001
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT6868AY.1180.00426
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT5657B.1.1770.000737
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcG157B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT5354B.1.617.20.0002
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA154B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT5050B.1.5750.01517
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT4549P.10.000709
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA449P.10.000063
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT4748B.1.10.000853
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA148B.1.10.000018
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT4747B.1.1600.001466
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT4646AY.1020.00122
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT4444A.210.121884
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT3737P.1.140.001769
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT3636B.1.360.005252
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT3030B.1.2210.002131
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT2227B.10.000202
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA427B.10.000037
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcG127B.10.000009
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT2424AY.440.000146
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT2323AY.260.000651
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT1717B.1.1.460.074236
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT1616AY.410.004703
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT1616B.1.3670.012678
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA1115B.1.1.2140.00061
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT415B.1.1.2140.000222
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT1414AY.290.000221
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA1414AY.850.00598
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT1313B.1.4290.000306
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT1212B.1.3510.000357
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA811AY.460.000833
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT311AY.460.000312
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT1010AY.390.000247
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT910P.20.00168
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA110P.20.000187
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT99B.1.5250.001018
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT88AD.20.001752
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT88AY.50.000165
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT88B.1.1.2840.000859
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT77AY.1000.000322
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT67AY.470.000187
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA17AY.470.000031
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT77B.1.214.20.004197
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT56AY.3.10.000426
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA16AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT66AY.750.000336
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT56B.1.2430.000348
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA16B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT55AY.100.00265
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT45AY.200.000155
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA15AY.200.000039
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA35AY.230.000209
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT25AY.230.000139
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT45AY.330.000267
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA15AY.330.000067
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT55AY.46.10.005133
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT44AY.5.40.001107
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT44AY.980.000316
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT34B0.000383
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA14B0.000128
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT44B.1.1.4320.005063
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT44B.1.1.630.001543
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT44B.1.177.80.00301
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT44B.1.621.10.002023
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT44B.1.6370.000292
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT33AY.1170.000254
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT33AY.4.20.000065
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT33AY.570.001969
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT33AY.630.001161
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT33AY.840.001312
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT23AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA13AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT33AY.920.000862
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT33AY.98.10.000145
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT33AY.99.20.000276
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT33B.1.1.10.00098
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT33B.1.1.4090.008499
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT33B.1.1.5210.016043
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT33B.1.6210.000266
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT33C.370.000348
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT33Q.10.000379
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT12AY.1100.000113
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA12AY.1100.000113
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT22AY.1130.000285
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT22AY.1160.000574
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT22AY.140.000176
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT22AY.270.000129
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT22AY.4.10.001475
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT22AY.4.40.000818
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT22AY.46.60.000144
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT22AY.700.000417
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT22AY.770.002255
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT22AY.780.003082
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT22AY.870.001665
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT22AY.9.10.000167
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT22AY.910.001461
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT22B.1.1.2220.000408
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT22B.1.1.3170.000823
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT22B.1.1.3510.005587
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT22B.1.160.250.022222
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT22B.1.177.580.002663
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT22B.1.4270.000101
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT22B.1.4620.014493
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT22B.1.5260.000047
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA12B.1.5800.004065
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT12B.1.5800.004065
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT12B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA12B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT22C.360.001821
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT22D.20.00015
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT22P.1.10.000635
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT22P.1.150.000465
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11A0.000387
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11A.10.000282
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11AU.20.002421
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11AY.10.000396
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11AY.1080.001103
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11AY.120.20.001285
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11AY.20.000356
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11AY.240.000431
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11AY.320.000532
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11AY.360.000148
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11AY.39.20.001541
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11AY.420.00004
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11AY.450.000122
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11AY.480.000465
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA11AY.520.000814
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11AY.540.000095
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11AY.590.00053
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA11AY.60.000041
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11AY.70.000196
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11AY.7.20.000559
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11AY.880.000884
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11AY.90.000068
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11B.1.1.100.001115
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA11B.1.1.2160.00089
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA11B.1.1.2770.000759
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11B.1.1.2910.000742
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11B.1.1.3120.001912
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11B.1.1.3620.005618
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11B.1.1.4250.045455
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11B.1.1110.001175
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11B.1.1490.003425
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11B.1.177.530.002392
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11B.1.177.560.000668
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11B.1.2140.003663
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11B.1.2650.001271
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11B.1.2790.000514
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11B.1.36.180.00042
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11B.1.3710.001122
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA11B.1.428.30.012821
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcA11B.1.4590.004082
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11B.1.5090.000866
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11B.1.5760.000907
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11B.1.596.10.009346
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11B.1.6250.002353
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11B.290.003509
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11P.1.10.10.00813
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11P.1.20.001156
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11P.1.70.000319
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11P.30.001595
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11Q.80.000165
ORF1ab/nsp2385A385AgcCgcT11R.10.00009