CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : CodonNum = 635

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2635L635LL815LsynctCctT852383120.9752432708-2710
ORF1ab/nsp2635L635LL815LsynctCctA85231350.01583952708-2710
ORF1ab/nsp2635L635LL815LsynctCctG8523760.008917052708-2710
ORF1ab/nsp2635L635FL815FnonsynCtcTtc8248230.9987862708-2710
ORF1ab/nsp2635L635FL815FnonsynCtCTtT82410.001213592708-2710
ORF1ab/nsp2635L635IL815InonsynCtcAtc13713712708-2710
ORF1ab/nsp2635L635delL815deldelCTC---646412708-2710
ORF1ab/nsp2635L635PL815PnonsyncTccCc12100.8333332708-2710
ORF1ab/nsp2635L635PL815PnonsyncTCcCT1210.08333332708-2710
ORF1ab/nsp2635L635PL815PnonsyncTCcCA1210.08333332708-2710
ORF1ab/nsp2635L635HL815HnonsyncTccAc111112708-2710
ORF1ab/nsp2635L635del1L815del1delCtc-tc940.4444442708-2710
ORF1ab/nsp2635L635del1L815del1delctCct-930.3333332708-2710
ORF1ab/nsp2635L635del1L815del1delcTCcC-910.1111112708-2710
ORF1ab/nsp2635L635del1L815del1delcTcc-c910.1111112708-2710
ORF1ab/nsp2635L635RL815RnonsyncTccGc3312708-2710
ORF1ab/nsp2635L635VL815VnonsynCtcGtc3312708-2710
ORF1ab/nsp2635L635TL815TnonsynCTcACc3312708-2710
ORF1ab/nsp2635L635del2L815del2delCTc--c1112708-2710
ORF1ab/nsp2635L635QL815QnonsyncTCcAA1112708-2710

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT83128523All0.00159
ORF1ab/nsp2635L635LctCctA1358523All0.000026
ORF1ab/nsp2635L635LctCctG768523All0.000015
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT36673685B.1.1.70.003283
ORF1ab/nsp2635L635LctCctA173685B.1.1.70.000015
ORF1ab/nsp2635L635LctCctG13685B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp2635L635FCtcTtc823824All0.000157
ORF1ab/nsp2635L635FCtCTtT1824All0
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT462493AY.40.000719
ORF1ab/nsp2635L635LctCctA30493AY.40.000047
ORF1ab/nsp2635L635LctCctG1493AY.40.000002
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT441441B.1.2580.029347
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT364364AY.50.007516
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT303303B.1.3510.009007
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT270278AY.430.001196
ORF1ab/nsp2635L635LctCctA8278AY.430.000035
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT133199B.1.617.20.000501
ORF1ab/nsp2635L635LctCctG61199B.1.617.20.00023
ORF1ab/nsp2635L635LctCctA5199B.1.617.20.000019
ORF1ab/nsp2635L635FCtcTtc166166AY.50.003428
ORF1ab/nsp2635L635ICtcAtc137137All0.000026
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT116117AY.30.001154
ORF1ab/nsp2635L635LctCctA1117AY.30.00001
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT113113B.1.20.000995
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT103103B.1.1.5190.00409
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT9497AY.250.000565
ORF1ab/nsp2635L635LctCctA297AY.250.000012
ORF1ab/nsp2635L635LctCctG197AY.250.000006
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT9396AY.1030.000577
ORF1ab/nsp2635L635LctCctA396AY.1030.000019
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT9394B.1.10.001687
ORF1ab/nsp2635L635LctCctG194B.1.10.000018
ORF1ab/nsp2635L635FCtcTtc9494B.1.617.20.000354
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT8789B.10.000797
ORF1ab/nsp2635L635LctCctA289B.10.000018
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT8080AY.1190.002825
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT7880AY.440.000475
ORF1ab/nsp2635L635LctCctA280AY.440.000012
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT8080B.1.6120.212202
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT7078B.1.1770.000922
ORF1ab/nsp2635L635LctCctA778B.1.1770.000092
ORF1ab/nsp2635L635LctCctG178B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT7378P.10.00115
ORF1ab/nsp2635L635LctCctA478P.10.000063
ORF1ab/nsp2635L635LctCctG178P.10.000016
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT7070AY.330.004674
ORF1ab/nsp2635L635FCtcTtc6767AY.440.000408
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT6767P.1.60.13035
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT6666AY.140.005809
ORF1ab/nsp2635L635ICtcAtc6565AY.40.000101
ORF1ab/nsp2635L635delCTC---6464All0.000012
ORF1ab/nsp2635L635FCtcTtc6161P.10.000961
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT5555AY.1210.007442
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT5455B.1.5260.001269
ORF1ab/nsp2635L635LctCctA155B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp2635L635FCtcTtc5252AY.250.000313
ORF1ab/nsp2635L635FCtcTtc4949B.1.1.70.000044
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT4747B.1.5090.040693
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT4446AY.200.00171
ORF1ab/nsp2635L635LctCctA246AY.200.000078
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT4545B.1.177.70.007418
ORF1ab/nsp2635L635FCtcTtc4444AY.430.000195
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT4343B.1.360.006274
ORF1ab/nsp2635L635FCtcTtc4141AY.40.000064
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT4141B.1.1.2140.002274
ORF1ab/nsp2635L635FCtcTtc3939AY.260.001104
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT3232B.1.6210.002833
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT2828P.1.70.00894
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT2626B.1.1.2410.05383
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT2525AY.5.40.006918
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT2525N.20.961538
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT2324B.1.5750.006978
ORF1ab/nsp2635L635LctCctA124B.1.5750.000303
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT2323B.1.2430.0016
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT2222AY.470.000684
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT2222B.1.5770.01512
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT2121B.1.1.4340.00732
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT2021B.1.1600.000624
ORF1ab/nsp2635L635LctCctA121B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT1820AY.1020.000477
ORF1ab/nsp2635L635LctCctA220AY.1020.000053
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT2020Q.10.002527
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT1919B.1.1.700.00648
ORF1ab/nsp2635L635FCtcTtc1818AY.30.000179
ORF1ab/nsp2635L635FCtcTtc1818AY.46.60.0013
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT1617AY.230.001116
ORF1ab/nsp2635L635LctCctA117AY.230.00007
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT1717AY.290.000268
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT1617B0.002045
ORF1ab/nsp2635L635LctCctA117B0.000128
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT1516AY.260.000425
ORF1ab/nsp2635L635LctCctA116AY.260.000028
ORF1ab/nsp2635L635ICtcAtc1616AY.460.001665
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT1515AY.930.004096
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT1515P.1.170.002426
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT1414B.1.1.280.004357
ORF1ab/nsp2635L635LctCctA913AY.1060.003014
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT413AY.1060.00134
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT1313AY.1130.001851
ORF1ab/nsp2635L635LctCctA1113AY.39.10.000436
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT213AY.39.10.000079
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT1313AY.99.20.001198
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT1313B.1.4290.000306
ORF1ab/nsp2635L635PcTccCc1012All0.000002
ORF1ab/nsp2635L635PcTCcCT112All0
ORF1ab/nsp2635L635PcTCcCA112All0
ORF1ab/nsp2635L635delCTC---1212B.10.00011
ORF1ab/nsp2635L635FCtcTtc1212B.1.258.170.001248
ORF1ab/nsp2635L635HcTccAc1111All0.000002
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT1111AY.116.10.003426
ORF1ab/nsp2635L635ICtcAtc1111AY.860.009129
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT1111B.1.1.3050.042471
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT1111P.1.160.004115
ORF1ab/nsp2635L635FCtcTtc1010AY.1030.000062
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT910AY.610.000943
ORF1ab/nsp2635L635LctCctA110AY.610.000105
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT1010B.1.1.250.005685
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT1010B.1.90.061728
ORF1ab/nsp2635L635del1Ctc-tc49All0.000001
ORF1ab/nsp2635L635del1ctCct-39All0.000001
ORF1ab/nsp2635L635del1cTCcC-19All0
ORF1ab/nsp2635L635del1cTcc-c19All0
ORF1ab/nsp2635L635LctCctA89AY.5.30.002699
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT19AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT99AY.880.007958
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT99B.1.1.3180.002716
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT99Q.20.005521
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT88A.2.50.003992
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT88AY.1000.000368
ORF1ab/nsp2635L635FCtcTtc88AY.1110.001465
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT78AY.390.000173
ORF1ab/nsp2635L635LctCctG18AY.390.000025
ORF1ab/nsp2635L635FCtcTtc88AY.4.20.000174
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT78AY.750.000392
ORF1ab/nsp2635L635LctCctG18AY.750.000056
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT88B.1.177.860.001468
ORF1ab/nsp2635L635FCtcTtc88B.1.20.00007
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT77AY.1200.00026
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT67AY.3.10.000512
ORF1ab/nsp2635L635LctCctA17AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT77AY.950.005327
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT67AY.98.10.000291
ORF1ab/nsp2635L635LctCctA17AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT77B.1.1.2180.053846
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT77B.1.1.2220.001428
ORF1ab/nsp2635L635FCtcTtc77B.1.1.5190.000278
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT77B.1.36.350.018229
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT77C.370.000812
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT77P.20.001306
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT77Q.80.001154
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT66AY.360.000889
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT66AY.46.60.000433
ORF1ab/nsp2635L635ICtcAtc66AY.750.000336
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT66AY.75.10.001082
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT66B.1.1.330.002525
ORF1ab/nsp2635L635delCTC---66B.1.1.70.000005
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT66B.1.2390.007326
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT66B.1.5880.00546
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT66B.1.6370.000438
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT66D.20.00045
ORF1ab/nsp2635L635ICtcAtc66P.10.000095
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT56P.1.140.000239
ORF1ab/nsp2635L635LctCctA16P.1.140.000048
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT66P.1.150.001394
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT66P.70.026201
ORF1ab/nsp2635L635FCtcTtc55AY.3.10.000426
ORF1ab/nsp2635L635FCtcTtc55AY.420.000201
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT55AY.450.000608
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT55AY.46.50.000992
ORF1ab/nsp2635L635FCtcTtc55B.10.000046
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT55B.1.1.1530.005476
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT55B.1.1.2430.020408
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT55B.1.1.3170.002058
ORF1ab/nsp2635L635ICtcAtc55B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT55B.1.3670.003962
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT55B.1.6280.001762
ORF1ab/nsp2635L635FCtcTtc55B.60.00455
ORF1ab/nsp2635L635delCTC---440.222222
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT34A0.001161
ORF1ab/nsp2635L635LctCctA14A0.000387
ORF1ab/nsp2635L635FCtcTtc44AE.80.001956
ORF1ab/nsp2635L635FCtcTtc44AY.1020.000106
ORF1ab/nsp2635L635FCtcTtc44AY.1190.000141
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT44AY.4.20.000087
ORF1ab/nsp2635L635FCtcTtc44AY.410.001176
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT44AY.460.000416
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT34AY.540.000286
ORF1ab/nsp2635L635LctCctA14AY.540.000095
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT44AY.7.10.000451
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT44AY.790.004843
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT34AY.9.20.00011
ORF1ab/nsp2635L635LctCctA14AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT44AY.980.000316
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT44B.1.1.1610.014134
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT44B.1.1.3890.024242
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT44B.1.1.4860.006309
ORF1ab/nsp2635L635LctCctT44B.1.1110.0047
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ORF1ab/nsp2635L635LctCctT44B.1.2400.000862
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