CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : CodonNum = 550 & Codon = ctT

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2550L550LL730LsynctCctT1017999360.9761272453-2455

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT993610179All0.0019
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT19382104B.1.1.70.001735
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT12971299B.1.617.20.004884
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT10731075AY.40.00167
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT823868P.10.012966
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT475475B.1.1.3120.908222
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT348348B.1.1.500.236253
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT204204B.1.1770.002686
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT200200AY.1020.005303
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT176176AY.1030.001093
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT170170B.1.20.001497
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT164164AY.750.009188
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT151151AY.440.000919
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT149149B.1.4290.003506
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT146148B.10.001337
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT119119B.1.5260.002797
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT9595AY.260.002689
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT8989B.1.3510.002646
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT8788B.1.10.001578
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT8486AY.250.000505
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT8185AY.30.000806
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT7779AY.430.000341
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT7474B.1.1.2140.004104
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT6464AY.50.001322
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT6262AY.1170.00524
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT5860AY.390.001433
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT5858A.2.50.028942
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT4343B.1.1.3180.012975
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT4141AY.1000.001886
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT3738B.1.1.5190.001469
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT3636AY.1100.004057
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT3334B.1.1600.001029
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT3334Q.10.004169
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT3133AY.230.002162
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT3333AY.450.004016
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT3333B.1.621.10.016692
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT3131AY.290.000489
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT3131R.20.449275
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT3030B.1.1.1210.072816
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT2828B.1.3490.020014
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT2727AY.420.001086
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT2727B.1.2210.001918
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT2424AY.70.004704
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT2424B.1.1.4830.923077
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT2424B.1.390.09375
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT2323P.20.004293
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT2222AY.1210.002977
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT2222B.1.5760.019946
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT2121B.1.258.170.002183
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT2121B.1.5750.006371
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT2020AY.1200.000744
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT2020AY.4.20.000434
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT2020B.1.4270.00101
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT2020C.370.002321
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT1919B.1.4430.088785
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT1717AY.1130.002421
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT1717B.60.015469
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT1616AY.98.10.000775
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT1616B.1.5960.001394
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT1414AY.470.000435
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT1414AY.610.001467
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT1414AY.9.10.001172
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT1414AY.980.001106
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT1414B.1.177.440.007265
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT1313AY.200.000505
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT1212AY.640.007143
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT1212B.1.360.001751
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT1212Q.80.001979
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT1111AY.1190.000388
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT1111AY.270.000712
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT1111B.1.2580.000732
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT1111B.1.3960.007763
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT1111B.1.4000.004719
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT1111B.1.617.10.001419
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT1010AY.1050.006431
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT910B0.00115
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT1010B.1.1.2220.00204
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT1010B.1.5610.00397
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT1010B.1.6210.000885
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT910P.1.120.004356
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT1010P.70.043668
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT1010R.10.0009
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT99AY.460.000937
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT99AY.46.20.005718
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT99AY.60.00037
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT99B.1.2430.000626
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT99D.20.000675
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT88AY.340.000776
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT88B.1.1.2840.000859
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT88B.1.1.3170.003294
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT88B.1.1.700.002729
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT88B.1.110.30.005747
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT88B.1.177.810.001515
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT88B.1.5170.003416
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT77AY.1180.000439
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT77AY.410.002058
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT77B.1.1.4640.010309
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT77B.1.2340.000924
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT67B.1.466.20.002347
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT66AY.46.60.000433
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT66AY.510.005455
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT56AY.90.000338
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT66AY.990.006296
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT66B.1.177.40.001266
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT66B.1.258.30.01005
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT66B.1.5250.000679
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT66B.1.5950.001566
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT56P.1.140.000239
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT55B.1.1.1530.005476
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT55B.1.1.630.001929
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT55B.1.177.210.000382
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT55B.1.3110.001373
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT55C.140.021645
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT55P.1.160.001871
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT44A.23.10.002817
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT44AY.1070.001864
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT44AY.39.10.000158
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT44AY.4.50.00043
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT44B.1.1.3440.043011
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT44B.1.1.390.002039
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT44B.1.1.4340.001394
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT44B.1.177.160.002658
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT44B.1.36.170.001976
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT44B.1.36.290.002069
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT44B.1.36.360.002408
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT44B.1.438.10.000429
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT44P.1.100.001078
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33AD.20.000657
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33AY.1080.003308
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33AY.140.000264
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33AY.16.10.00141
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33AY.330.0002
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33AY.360.000445
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT23AY.540.000191
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33AY.550.002752
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33AY.680.000821
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33AY.740.000347
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33AY.80.001818
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33AY.840.001312
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33AY.9.20.00011
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33AY.99.20.000276
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33B.1.1.2770.002276
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33B.1.1.3060.001315
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33B.1.1.3480.002389
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33B.1.1.370.000579
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33B.1.1.5180.018987
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33B.1.1.5240.0625
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33B.1.1240.023438
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33B.1.177.120.000455
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33B.1.177.540.001819
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33B.1.177.70.000495
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33B.1.2230.008333
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33B.1.2360.00616
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33B.1.2400.000647
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33B.1.258.200.047619
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33B.1.351.20.000908
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33B.1.3990.005803
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33B.1.4090.002344
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33B.1.5440.018072
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33B.1.5510.003871
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33B.30.002492
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33C.37.10.007853
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT33P.1.150.000697
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22A.20.001324
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22AY.1010.000981
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22AY.1090.001479
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22AY.1160.000574
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22AY.160.000759
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22AY.380.000999
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22AY.5.40.000553
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22AY.590.001059
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22AY.600.001876
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22AY.670.000929
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22AY.75.10.000361
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22AZ.30.00304
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22B.1.1.1370.025
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22B.1.1.2160.001781
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22B.1.1.280.000622
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22B.1.1.3160.00185
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22B.1.1.4320.002532
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22B.1.1.5230.003125
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT12B.1.1.5280.004808
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22B.1.1280.001271
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22B.1.1570.00597
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22B.1.160.160.001859
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22B.1.2790.001027
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22B.1.36.270.001527
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22B.1.4160.002538
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22B.1.4710.005464
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22B.1.5090.001732
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22B.1.5770.001375
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22B.1.6370.000146
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22B.40.004415
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22B.450.007663
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22C.36.3.10.005435
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT12P.1.10.000318
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22P.1.130.001797
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT22P.1.70.000639
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT11A0.000387
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT11A.10.000282
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT11AE.80.000489
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT11AY.10.000396
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT11AY.1040.001984
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT11AY.1060.000335
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT11AY.120.000316
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT11AY.120.10.000321
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT11AY.130.000161
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT11AY.170.008197
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT11AY.240.000431
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT11AY.300.000396
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT11AY.350.000233
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp2550L550LctCctT11AY.400.000964
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