CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : CodonNum = 423

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2423G423SG603SnonsynGgtAgt79479412072-2074
ORF1ab/nsp2423G423GG603GsynggTggA4922430.4939022072-2074
ORF1ab/nsp2423G423GG603GsynggTggC4921830.3719512072-2074
ORF1ab/nsp2423G423GG603GsynggTggG492660.1341462072-2074
ORF1ab/nsp2423G423CG603CnonsynGgtTgt18618612072-2074
ORF1ab/nsp2423G423DG603DnonsyngGtgAt767612072-2074
ORF1ab/nsp2423G423delG603deldelGGT---383812072-2074
ORF1ab/nsp2423G423VG603VnonsyngGtgTt303012072-2074
ORF1ab/nsp2423G423AG603AnonsyngGtgCt1090.92072-2074
ORF1ab/nsp2423G423AG603AnonsyngGTgCG1010.12072-2074
ORF1ab/nsp2423G423RG603RnonsynGgtCgt320.6666672072-2074
ORF1ab/nsp2423G423RG603RnonsynGgTCgA310.3333332072-2074
ORF1ab/nsp2423G423KG603KnonsynGGTAAA1112072-2074

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt794794All0.000152
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt560560B.1.1.70.000501
ORF1ab/nsp2423G423GggTggA243492All0.000046
ORF1ab/nsp2423G423GggTggC183492All0.000035
ORF1ab/nsp2423G423GggTggG66492All0.000013
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt186186All0.000036
ORF1ab/nsp2423G423GggTggA126151B.1.1.70.000113
ORF1ab/nsp2423G423GggTggC24151B.1.1.70.000021
ORF1ab/nsp2423G423GggTggG1151B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp2423G423GggTggC105105AY.250.000632
ORF1ab/nsp2423G423GggTggA103103B.1.621.10.052099
ORF1ab/nsp2423G423DgGtgAt7676All0.000015
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt4242B.1.1.70.000038
ORF1ab/nsp2423G423delGGT---3838All0.000007
ORF1ab/nsp2423G423GggTggG2833AY.40.000044
ORF1ab/nsp2423G423GggTggC433AY.40.000006
ORF1ab/nsp2423G423GggTggA133AY.40.000002
ORF1ab/nsp2423G423VgGtgTt3030All0.000006
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt2929AY.40.000045
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt2424G.11
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt2323B.1.20.000203
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt2222B.1.4290.000518
ORF1ab/nsp2423G423GggTggC2121B.1.2790.010786
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt2121P.10.000331
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt2020AY.290.000315
ORF1ab/nsp2423G423GggTggG1717AY.4.50.001827
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt1717B.1.1600.00053
ORF1ab/nsp2423G423DgGtgAt1515AY.250.00009
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt1515B.1.1770.000198
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt1313AY.40.00002
ORF1ab/nsp2423G423DgGtgAt1313AY.40.00002
ORF1ab/nsp2423G423AgGtgCt910All0.000002
ORF1ab/nsp2423G423AgGTgCG110All0
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt1010AY.1030.000062
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt99B.1.5610.003573
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt99B.1.617.20.000034
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt88AY.430.000035
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt88P.1.170.001294
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt88R.10.00072
ORF1ab/nsp2423G423DgGtgAt77AY.1030.000043
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt77B.1.1.5190.000278
ORF1ab/nsp2423G423GggTggC36B.10.000027
ORF1ab/nsp2423G423GggTggA26B.10.000018
ORF1ab/nsp2423G423GggTggG16B.10.000009
ORF1ab/nsp2423G423VgGtgTt66B.1.1.70.000005
ORF1ab/nsp2423G423DgGtgAt66B.1.1.70.000005
ORF1ab/nsp2423G423DgGtgAt66P.10.000095
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt66P.10.000095
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt55AY.1030.000031
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt55AY.440.00003
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt55AY.440.00003
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt55B.10.000046
ORF1ab/nsp2423G423delGGT---55B.10.000046
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt55B.1.1.5190.000199
ORF1ab/nsp2423G423VgGtgTt44AY.1170.000338
ORF1ab/nsp2423G423VgGtgTt44AY.430.000018
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt44AY.530.00115
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt44AY.610.000419
ORF1ab/nsp2423G423GggTggC44AY.710.0019
ORF1ab/nsp2423G423GggTggG44AY.90.00027
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt44B.1.10.000073
ORF1ab/nsp2423G423GggTggG44B.1.1.5190.000159
ORF1ab/nsp2423G423delGGT---44B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp2423G423DgGtgAt44B.1.617.20.000015
ORF1ab/nsp2423G423RGgtCgt23All0
ORF1ab/nsp2423G423RGgTCgA13All0
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt33AY.250.000018
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt33AY.30.00003
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt33AY.30.00003
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt33AY.430.000013
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt33AY.46.60.000217
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt33AY.9.20.00011
ORF1ab/nsp2423G423AgGtgCt33B.10.000027
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt33B.1.10.000054
ORF1ab/nsp2423G423delGGT---33B.1.1.330.001263
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt33B.1.1.5230.004687
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt33B.1.177.100.002634
ORF1ab/nsp2423G423GggTggA23B.1.20.000018
ORF1ab/nsp2423G423GggTggG13B.1.20.000009
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt33B.1.5960.000261
ORF1ab/nsp2423G423GggTggC23B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp2423G423GggTggA13B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt22AY.1020.000053
ORF1ab/nsp2423G423DgGtgAt22AY.1020.000053
ORF1ab/nsp2423G423GggTggG22AY.1200.000074
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt22AY.260.000057
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt22AY.390.000049
ORF1ab/nsp2423G423RGgtCgt22AY.40.000003
ORF1ab/nsp2423G423GggTggC22AY.420.00008
ORF1ab/nsp2423G423GggTggC22AY.430.000009
ORF1ab/nsp2423G423DgGtgAt22AY.470.000062
ORF1ab/nsp2423G423GggTggG22AY.580.001815
ORF1ab/nsp2423G423GggTggG22AY.80.001212
ORF1ab/nsp2423G423AgGtgCt22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp2423G423GggTggA12B.1.10.000018
ORF1ab/nsp2423G423GggTggC12B.1.10.000018
ORF1ab/nsp2423G423GggTggC22B.1.1.2070.002364
ORF1ab/nsp2423G423delGGT---22B.1.1.3480.001592
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt22B.1.1.510.003436
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp2423G423DgGtgAt22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt22B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt22B.1.258.240.021505
ORF1ab/nsp2423G423DgGtgAt22B.1.4000.000858
ORF1ab/nsp2423G423delGGT---22B.1.4240.016129
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt22B.1.5260.000047
ORF1ab/nsp2423G423VgGtgTt22B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp2423G423GggTggA22B.1.6210.000177
ORF1ab/nsp2423G423delGGT---22N.60.014184
ORF1ab/nsp2423G423delGGT---22P.10.000032
ORF1ab/nsp2423G423DgGtgAt22P.1.120.000968
ORF1ab/nsp2423G423delGGT---22P.20.000373
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt110.055556
ORF1ab/nsp2423G423DgGtgAt11A.10.000282
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt11A.23.10.000704
ORF1ab/nsp2423G423KGGTAAA11All0
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt11AU.30.00211
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp2423G423delGGT---11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp2423G423VgGtgTt11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp2423G423VgGtgTt11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp2423G423delGGT---11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp2423G423GggTggC11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp2423G423DgGtgAt11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp2423G423VgGtgTt11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11AY.120.10.000321
ORF1ab/nsp2423G423GggTggG11AY.170.008197
ORF1ab/nsp2423G423GggTggC11AY.200.000039
ORF1ab/nsp2423G423GggTggA11AY.230.00007
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11AY.290.000016
ORF1ab/nsp2423G423delGGT---11AY.30.00001
ORF1ab/nsp2423G423DgGtgAt11AY.30.00001
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp2423G423GggTggC11AY.320.000532
ORF1ab/nsp2423G423GggTggC11AY.330.000067
ORF1ab/nsp2423G423DgGtgAt11AY.390.000025
ORF1ab/nsp2423G423delGGT---11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp2423G423DgGtgAt11AY.430.000004
ORF1ab/nsp2423G423VgGtgTt11AY.440.000006
ORF1ab/nsp2423G423DgGtgAt11AY.440.000006
ORF1ab/nsp2423G423GggTggC11AY.440.000006
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11AY.470.000031
ORF1ab/nsp2423G423DgGtgAt11AY.50.000021
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11AY.50.000021
ORF1ab/nsp2423G423delGGT---11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp2423G423DgGtgAt11AY.540.000095
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11AY.540.000095
ORF1ab/nsp2423G423delGGT---11AY.540.000095
ORF1ab/nsp2423G423DgGtgAt11AY.560.001605
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11AY.60.000041
ORF1ab/nsp2423G423DgGtgAt11AY.610.000105
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11AY.630.000387
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11AY.680.000274
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt11AY.690.000187
ORF1ab/nsp2423G423GggTggC11AY.740.000116
ORF1ab/nsp2423G423GggTggG11AY.870.000833
ORF1ab/nsp2423G423delGGT---11AY.930.000273
ORF1ab/nsp2423G423GggTggA11AY.980.000079
ORF1ab/nsp2423G423GggTggC11B0.000128
ORF1ab/nsp2423G423DgGtgAt11B.10.000009
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt11B.10.000009
ORF1ab/nsp2423G423delGGT---11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp2423G423VgGtgTt11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp2423G423GggTggA11B.1.1.1150.008929
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11B.1.1.170.016667
ORF1ab/nsp2423G423VgGtgTt11B.1.1.2200.001859
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11B.1.1.3020.002075
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt11B.1.1.3100.015152
ORF1ab/nsp2423G423GggTggG11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp2423G423delGGT---11B.1.1.4160.000905
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11B.1.1.4320.001266
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11B.1.1.4340.000349
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11B.1.1.4350.034483
ORF1ab/nsp2423G423VgGtgTt11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp2423G423AgGtgCt11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp2423G423VgGtgTt11B.1.1.80.003584
ORF1ab/nsp2423G423GggTggG11B.1.1280.000635
ORF1ab/nsp2423G423VgGtgTt11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11B.1.160.90.007194
ORF1ab/nsp2423G423AgGtgCt11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp2423G423DgGtgAt11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp2423G423GggTggC11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp2423G423VgGtgTt11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp2423G423GggTggC11B.1.177.100.000878
ORF1ab/nsp2423G423delGGT---11B.1.177.180.00116
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt11B.1.177.230.003236
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt11B.1.177.600.000218
ORF1ab/nsp2423G423delGGT---11B.1.1790.003759
ORF1ab/nsp2423G423AgGtgCt11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp2423G423RGgTCgA11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp2423G423delGGT---11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11B.1.2120.016667
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp2423G423delGGT---11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp2423G423GggTggA11B.1.3620.001541
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11B.1.3770.004566
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11B.1.4040.001302
ORF1ab/nsp2423G423GggTggC11B.1.4090.000781
ORF1ab/nsp2423G423KGGTAAA11B.1.4160.001269
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp2423G423VgGtgTt11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp2423G423delGGT---11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp2423G423GggTggC11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp2423G423AgGtgCt11B.1.4500.011364
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11B.1.4700.001404
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp2423G423delGGT---11B.1.5610.000397
ORF1ab/nsp2423G423DgGtgAt11B.1.5770.000687
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11B.1.5990.00365
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp2423G423DgGtgAt11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp2423G423AgGTgCG11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11B.1.621.10.000506
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11B.1.780.008547
ORF1ab/nsp2423G423delGGT---11B.570.015152
ORF1ab/nsp2423G423VgGtgTt11B.600.015873
ORF1ab/nsp2423G423GggTggC11C.370.000116
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt11C.370.000116
ORF1ab/nsp2423G423VgGtgTt11D.20.000075
ORF1ab/nsp2423G423GggTggC11D.20.000075
ORF1ab/nsp2423G423SGgtAgt11D.20.000075
ORF1ab/nsp2423G423CGgtTgt11P.1.100.000269
ORF1ab/nsp2423G423VgGtgTt11P.1.160.000374
ORF1ab/nsp2423G423DgGtgAt11P.20.000187
ORF1ab/nsp2423G423GggTggA11Q.10.000126