CoV-GLUE Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : CodonNum = 419

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORF	CodonNum	Mut	ORF1abMut	MutType	RefCodon	MutCodon	AACount	CodonCount	CodonProp	Genome Position
ORF1ab/nsp2	419	A419V	A599V	nonsyn	gCc	gTc	39321	39291	0.999237	2060-2062
ORF1ab/nsp2	419	A419V	A599V	nonsyn	gCC	gTT	39321	29	0.000737519	2060-2062
ORF1ab/nsp2	419	A419V	A599V	nonsyn	gCC	gTA	39321	1	0.0000254317	2060-2062
ORF1ab/nsp2	419	A419A	A599A	syn	gcC	gcT	9566	9244	0.966339	2060-2062
ORF1ab/nsp2	419	A419A	A599A	syn	gcC	gcA	9566	298	0.031152	2060-2062
ORF1ab/nsp2	419	A419A	A599A	syn	gcC	gcG	9566	24	0.00250889	2060-2062
ORF1ab/nsp2	419	A419T	A599T	nonsyn	Gcc	Acc	230	230	1	2060-2062
ORF1ab/nsp2	419	A419S	A599S	nonsyn	Gcc	Tcc	69	68	0.985507	2060-2062
ORF1ab/nsp2	419	A419S	A599S	nonsyn	GCc	AGc	69	1	0.0144928	2060-2062
ORF1ab/nsp2	419	A419del	A599del	del	GCC	---	41	41	1	2060-2062
ORF1ab/nsp2	419	A419D	A599D	nonsyn	gCc	gAc	12	12	1	2060-2062
ORF1ab/nsp2	419	A419F	A599F	nonsyn	GCc	TTc	12	12	1	2060-2062
ORF1ab/nsp2	419	A419P	A599P	nonsyn	Gcc	Ccc	9	9	1	2060-2062
ORF1ab/nsp2	419	A419del1	A599del1	del	gCc	g-c	2	2	1	2060-2062

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORF	CodonNum	Mut	RefCodon	MutCodon	CodonCount	AACount	Lineage	LineageCodonProp
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	39291	39321	All	0.007515
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCC	gTT	29	39321	All	0.000006
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCC	gTA	1	39321	All	0
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	23651	23668	AY.20	0.919199
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCC	gTT	17	23668	AY.20	0.000661
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	12002	12004	B.1.1.7	0.010744
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCC	gTT	2	12004	B.1.1.7	0.000002
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	9244	9566	All	0.001768
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	298	9566	All	0.000057
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcG	24	9566	All	0.000005
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1211	1357	B.1.1.7	0.001084
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	137	1357	B.1.1.7	0.000123
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcG	9	1357	B.1.1.7	0.000008
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	799	799	B.1.1.170	0.996259
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	738	747	B.1.617.2	0.002779
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	9	747	B.1.617.2	0.000034
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	703	713	AY.4	0.001094
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	10	713	AY.4	0.000016
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	673	674	B.1.177.83	0.997037
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	1	674	B.1.177.83	0.001481
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	529	532	AY.4	0.000823
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCC	gTT	3	532	AY.4	0.000005
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	483	483	B.1.617.2	0.001819
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	361	361	AY.25	0.002171
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	306	315	AY.25	0.001841
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	9	315	AY.25	0.000054
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	304	304	AY.100	0.013986
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	298	299	P.1	0.004695
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcG	1	299	P.1	0.000016
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	243	289	B.1.177	0.0032
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	46	289	B.1.177	0.000606
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	230	230	All	0.000044
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	229	229	B.1.621	0.020271
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	227	227	AY.113	0.032322
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	156	198	AY.44	0.00095
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	41	198	AY.44	0.00025
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcG	1	198	AY.44	0.000006
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	194	196	AY.43	0.00086
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	2	196	AY.43	0.000009
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	191	192	B.1.2	0.001682
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	1	192	B.1.2	0.000009
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	179	179	B.1.243	0.012456
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	175	177	P.3	0.279107
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCC	gTT	2	177	P.3	0.00319
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	175	175	AY.98.1	0.008475
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	163	173	AY.103	0.001012
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcG	6	173	AY.103	0.000037
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	4	173	AY.103	0.000025
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	142	147	B.1	0.001301
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	5	147	B.1	0.000046
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	113	115	P.1	0.00178
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCC	gTT	2	115	P.1	0.000032
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	112	113	AY.39	0.002768
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	1	113	AY.39	0.000025
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	112	113	B.1.1	0.002032
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	1	113	B.1.1	0.000018
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	113	113	B.1.221	0.008027
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	108	108	AY.99.2	0.009953
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	92	92	B.1.160	0.002869
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	86	86	AY.43	0.000381
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	78	80	AY.44	0.000475
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCC	gTA	1	80	AY.44	0.000006
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCC	gTT	1	80	AY.44	0.000006
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	79	79	B.1.2	0.000696
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	76	78	AY.102	0.002015
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	2	78	AY.102	0.000053
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	76	77	AY.3	0.000756
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	1	77	AY.3	0.00001
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	74	74	AY.5	0.001528
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	74	74	B.1	0.000678
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	72	74	B.1.526	0.001692
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	2	74	B.1.526	0.000047
ORF1ab/nsp2	419	A419S	Gcc	Tcc	68	69	All	0.000013
ORF1ab/nsp2	419	A419S	GCc	AGc	1	69	All	0
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	68	69	B.1.1.1	0.022215
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	1	69	B.1.1.1	0.000327
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	66	66	B.1.160	0.002058
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	66	66	B.1.602	0.431373
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	65	65	B.1.1.519	0.002581
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	62	62	AY.9.2	0.002277
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	59	59	B.1.243	0.004105
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	56	56	AY.4	0.000087
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	53	53	B.1.1.222	0.010812
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	48	49	AY.103	0.000298
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCC	gTT	1	49	AY.103	0.000006
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	49	49	AY.26	0.001387
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	49	49	Q.8	0.00808
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	46	46	B.1.369	0.01312
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	43	43	B.1.1	0.00078
ORF1ab/nsp2	419	A419del	GCC	---	41	41	All	0.000008
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	40	40	B.1.1.7	0.000036
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	38	38	AY.119	0.001342
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	37	37	AY.47	0.001151
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	35	37	B.1.429	0.000824
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	2	37	B.1.429	0.000047
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	35	35	AY.119	0.001236
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	33	34	B.1.351	0.000981
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	1	34	B.1.351	0.00003
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	34	34	B.1.526	0.000799
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	33	33	B.1.526	0.000776
ORF1ab/nsp2	419	A419S	Gcc	Tcc	32	32	B.1.1.7	0.000029
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	31	31	AY.47	0.000964
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	31	31	AY.5	0.00064
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	31	31	B.1.1.157	0.028311
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	29	30	C.35	0.022446
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCC	gTT	1	30	C.35	0.000774
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	29	29	B.1.596	0.002527
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	28	28	AY.26	0.000793
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	27	27	AY.117	0.002282
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	27	27	AY.39.1	0.00107
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	27	27	B.1.177	0.000356
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	26	26	B.1.1.519	0.001032
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	26	26	B.1.177.6	0.025391
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	25	25	AY.45	0.003042
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	25	25	B.1.177.86	0.004586
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	24	24	AY.4.2.1	0.003576
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	24	24	B.1.1.434	0.008365
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	24	24	B.1.240	0.005174
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	24	24	B.1.385	0.255319
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	24	24	P.1.15	0.005576
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	23	23	B.1.525	0.002603
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	22	22	AY.69	0.004107
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	20	20	A.27	0.033113
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	20	20	AY.36	0.002964
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	20	20	AY.39.1	0.000792
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	20	20	B.1.416.1	0.03125
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	19	19	P.1.14	0.000908
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	19	19	Q.1	0.0024
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	18	18	AY.24	0.007759
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	18	18	AY.29	0.000284
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	18	18	AY.42	0.000724
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	18	18	B.1.1.4	0.053571
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	18	18	B.1.409	0.014063
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	17	17	AD.2	0.003722
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	17	17	P.1.11	0.173469
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	17	17	P.1.14	0.000813
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	16	16	AY.106	0.005358
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	16	16	B.1.1.222	0.003264
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	15	15	AZ.2	0.012315
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	15	15	B.1.1.37	0.002893
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	15	15	B.1.177.60	0.003277
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	15	15	B.1.177.86	0.002752
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	15	15	Q.1	0.001895
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	14	14	AY.121	0.001894
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	10	14	AY.4.2	0.000217
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcG	4	14	AY.4.2	0.000087
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	14	14	AY.46	0.001457
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	14	14	AY.92	0.004022
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	14	14	B.1.214.2	0.008393
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	13	13	AY.29	0.000205
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	13	13	AY.4.5	0.001397
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	13	13	B.1.1.50	0.008826
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	13	13	B.1.429	0.000306
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	13	13	B.1.596	0.001133
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	13	13	B.1.621	0.001151
ORF1ab/nsp2	419	A419F	GCc	TTc	12	12	All	0.000002
ORF1ab/nsp2	419	A419D	gCc	gAc	12	12	All	0.000002
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	12	12	AY.104	0.02381
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	12	12	AY.54	0.001144
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	12	12	AY.54	0.001144
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	12	12	AY.86	0.009959
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	10	12	B.1.1.10	0.011148
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	2	12	B.1.1.10	0.00223
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	12	12	B.1.258	0.000799
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	11	11	AY.117	0.00093
ORF1ab/nsp2	419	A419F	GCc	TTc	11	11	AY.20	0.000428
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	11	11	AY.60	0.010319
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	11	11	AY.75	0.000616
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	11	11	B.1.1.214	0.00061
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	11	11	B.1.1.306	0.004822
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	11	11	B.1.177.4	0.002322
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	11	11	B.1.36	0.001605
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	11	11	C.35	0.008514
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	9	10	AY.120	0.000335
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	1	10	AY.120	0.000037
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	10	10	B.1.221	0.00071
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	10	10	C.37	0.001161
ORF1ab/nsp2	419	A419P	Gcc	Ccc	9	9	All	0.000002
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	9	9	AY.23	0.000628
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	9	9	AY.34	0.000873
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	9	9	AY.64	0.005357
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	9	9	B.1.1.420	0.009054
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	9	9	B.1.177.81	0.001704
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	6	9	C.26	0.044118
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	3	9	C.26	0.022059
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	9	9	C.37	0.001045
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	8	9	Q.8	0.001319
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	1	9	Q.8	0.000165
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	8	8	AY.33	0.000534
ORF1ab/nsp2	419	A419S	Gcc	Tcc	8	8	AY.4	0.000012
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	8	8	AY.6	0.000329
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	8	8	AY.9.2	0.000294
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	8	8	AY.98	0.000632
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	8	8	B.1.351	0.000238
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	8	8	B.1.36.29	0.004139
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	7	7	AY.3.1	0.000597
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	7	7	AY.38	0.003495
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	6	7	AY.42	0.000241
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	1	7	AY.42	0.00004
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	7	7	AY.44	0.000043
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	7	7	AY.46.6	0.000505
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	7	7	B	0.000895
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	7	7	B.1.258.17	0.000728
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	7	7	B.1.36	0.001021
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	7	7	B.1.36.29	0.003621
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	7	7	B.1.427	0.000353
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	7	7	B.1.466.2	0.002739
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	7	7	B.1.575	0.002124
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	7	7	B.1.619.1	0.00449
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	7	7	B.1.637	0.000512
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	7	7	P.1	0.00011
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	6	6	A	0.002322
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	6	6	AE.8	0.002934
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	6	6	AY.111	0.001099
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	6	6	AY.118	0.000376
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	6	6	AY.13	0.000966
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	5	6	AY.23	0.000349
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	1	6	AY.23	0.00007
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	6	6	AY.36	0.000889
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	6	6	AY.57	0.003937
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	6	6	AY.6	0.000247
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	6	6	B.1.1.25	0.003411
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	6	6	B.1.1.28	0.001867
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	6	6	B.1.1.317	0.00247
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	6	6	B.1.609	0.002876
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	6	6	B.1.637	0.000438
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	6	6	C.36.2	0.206897
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	5	6	C.36.3	0.002836
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	1	6	C.36.3	0.000567
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	5	6	D.2	0.000375
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcG	1	6	D.2	0.000075
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	6	6	L.3	0.021277
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	6	6	P.1.12	0.002904
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	6	6	P.1.4	0.005859
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	6	6	P.2	0.00112
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	6	6	Q.3	0.00087
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	5	5	A.1	0.001409
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	5	5	AD.2	0.001095
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	5	5	AY.14	0.00044
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	5	5	AY.35	0.001165
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	5	5	AY.4.2	0.000108
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	5	5	AY.46	0.00052
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	5	5	AY.59	0.002648
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	5	5	AY.61	0.000524
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	4	5	AY.85	0.001709
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	1	5	AY.85	0.000427
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	5	5	AY.9.1	0.000419
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	4	5	B	0.000511
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	1	5	B	0.000128
ORF1ab/nsp2	419	A419del	GCC	---	5	5	B.1	0.000046
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	5	5	B.1.1.214	0.000277
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	5	5	B.1.1.322	0.04386
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	5	5	B.1.160.32	0.021459
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	5	5	B.1.177.54	0.003032
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	5	5	B.1.234	0.00066
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	5	5	B.1.241	0.004058
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	5	5	B.1.36.16	0.007123
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	5	5	B.1.427	0.000252
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	5	5	B.1.466.2	0.001956
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	5	5	B.1.617.1	0.000645
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	5	5	B.1.617.2	0.000019
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	5	5	B.40	0.001821
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	5	5	B.6	0.00455
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	5	5	Q.4	0.002274
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	4	4	A.2.5	0.001996
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	4	4	AY.110	0.000451
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	4	4	AY.120	0.000149
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	4	4	AY.16	0.001519
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	4	4	AY.24	0.001724
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	4	4	AY.33	0.000267
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	4	4	AY.33	0.000267
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	4	4	AY.41	0.001176
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	4	4	AY.72	0.005442
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	4	4	AY.75	0.000224
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	4	4	AY.81	0.007968
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	4	4	AY.9	0.00027
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	4	4	AY.99.2	0.000369
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	4	4	B.1.1.117	0.038835
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	4	4	B.1.1.161	0.014134
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	4	4	B.1.1.174	0.013514
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	4	4	B.1.1.217	0.014545
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	4	4	B.1.1.33	0.001684
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	4	4	B.1.1.354	0.017544
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	4	4	B.1.1.47	0.02139
ORF1ab/nsp2	419	A419del	GCC	---	4	4	B.1.1.7	0.000004
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	4	4	B.1.1.70	0.001364
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	4	4	B.1.177.45	0.001525
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	4	4	B.1.177.57	0.001124
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	4	4	B.1.258	0.000266
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	4	4	B.1.361	0.005155
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	4	4	B.1.389	0.004008
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	4	4	B.1.428	0.004082
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	4	4	B.1.435	0.045455
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	4	4	B.1.438.1	0.000429
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	4	4	B.1.576	0.003626
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	4	4	C.36	0.003643
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	4	4	P.2	0.000747
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	3	3	AY.100	0.000138
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	3	3	AY.102	0.00008
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	3	3	AY.103	0.000019
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	3	3	AY.105	0.001929
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	3	3	AY.107	0.001398
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	3	3	AY.118	0.000188
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	3	3	AY.120.1	0.000963
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	3	3	AY.120.2.1	0.001495
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	3	3	AY.27	0.000194
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	3	3	AY.3	0.00003
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	3	3	AY.3	0.00003
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	3	3	AY.39	0.000074
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	3	3	AY.43	0.000013
ORF1ab/nsp2	419	A419S	Gcc	Tcc	3	3	AY.44	0.000018
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	3	3	AY.45	0.000365
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	3	3	AY.5.3	0.001012
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	3	3	AY.56	0.004815
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	3	3	AY.7	0.000588
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	3	3	AY.70	0.000626
ORF1ab/nsp2	419	A419S	Gcc	Tcc	3	3	B.1	0.000027
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	3	3	B.1.1.113	0.020979
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	3	3	B.1.1.172	0.054545
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	3	3	B.1.1.189	0.004539
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	3	3	B.1.1.298	0.002586
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	3	3	B.1.1.317	0.001235
ORF1ab/nsp2	419	A419del	GCC	---	3	3	B.1.1.33	0.001263
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	3	3	B.1.1.397	0.006757
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	3	3	B.1.1.487	0.01676
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	3	3	B.1.111	0.003525
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	3	3	B.1.177.44	0.001557
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	3	3	B.1.177.55	0.006993
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	3	3	B.1.177.57	0.000843
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	3	3	B.1.177.60	0.000655
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	3	3	B.1.2	0.000026
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	3	3	B.1.234	0.000396
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	3	3	B.1.240	0.000647
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	3	3	B.1.336	0.007317
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	3	3	B.1.351.2	0.000908
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	3	3	B.1.36.18	0.001261
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	3	3	B.1.36.8	0.003
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	3	3	B.1.369	0.000856
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	3	3	B.1.438.1	0.000322
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	3	3	B.1.497	0.000944
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	3	3	B.1.523	0.007353
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	3	3	B.1.525	0.000339
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	3	3	B.1.628	0.001057
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	3	B.1.637	0.000146
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	1	3	B.1.637	0.000073
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	3	3	B.6	0.00273
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	3	3	D.2	0.000225
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	3	3	N.4	0.012766
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	3	3	P.1.15	0.000697
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	3	3	P.1.16	0.001122
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	A.2.5.2	0.003145
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	A.23.1	0.001408
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	A.27	0.003311
ORF1ab/nsp2	419	A419del1	gCc	g-c	2	2	All	0
ORF1ab/nsp2	419	A419S	Gcc	Tcc	2	2	AY.103	0.000012
ORF1ab/nsp2	419	A419D	gCc	gAc	2	2	AY.103	0.000012
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	AY.104	0.003968
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	AY.110	0.000225
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	2	2	AY.110	0.000225
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	AY.111	0.000366
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	AY.116	0.000574
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	2	2	AY.118	0.000125
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	2	2	AY.120	0.000074
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	2	2	AY.120.1	0.000642
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	AY.121	0.000271
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	2	2	AY.25	0.000012
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	2	2	AY.29	0.000032
ORF1ab/nsp2	419	A419S	Gcc	Tcc	2	2	AY.3	0.00002
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	AY.4.5	0.000215
ORF1ab/nsp2	419	A419D	gCc	gAc	2	2	AY.44	0.000012
ORF1ab/nsp2	419	A419S	Gcc	Tcc	2	2	AY.45	0.000243
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	AY.46.1	0.002053
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	AY.48	0.00093
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	AY.53	0.000575
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	AY.68	0.000547
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	AY.69	0.000373
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	AY.82	0.002714
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	AY.84	0.000875
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	AY.88	0.001768
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	AY.93	0.000546
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	AY.98	0.000158
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	2	2	AY.98.1	0.000097
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	AY.98.1	0.000097
ORF1ab/nsp2	419	A419D	gCc	gAc	2	2	B.1	0.000018
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	2	2	B.1	0.000018
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.1.1.189	0.003026
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.1.1.207	0.002364
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	B.1.1.216	0.001781
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.1.1.216	0.001781
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	B.1.1.28	0.000622
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	1	2	B.1.1.284	0.000107
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	2	B.1.1.284	0.000107
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.1.1.312	0.003824
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	B.1.1.33	0.000842
ORF1ab/nsp2	419	A419del	GCC	---	2	2	B.1.1.348	0.001592
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	B.1.1.37	0.000386
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.1.1.370	0.025316
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.1.1.39	0.001019
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.1.1.485	0.033333
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	B.1.1.83	0.00542
ORF1ab/nsp2	419	A419S	Gcc	Tcc	2	2	B.1.177	0.000026
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.1.177.37	0.054054
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	B.1.177.44	0.001038
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.1.177.7	0.00033
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.1.177.72	0.00678
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	B.1.177.76	0.004988
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.1.177.82	0.000955
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.1.199	0.008264
ORF1ab/nsp2	419	A419P	Gcc	Ccc	2	2	B.1.2	0.000018
ORF1ab/nsp2	419	A419S	Gcc	Tcc	2	2	B.1.2	0.000018
ORF1ab/nsp2	419	A419D	gCc	gAc	2	2	B.1.2	0.000018
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	B.1.214.2	0.001199
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.1.218	0.010309
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	2	2	B.1.258	0.000133
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	B.1.258.7	0.003824
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.1.311	0.000549
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	2	2	B.1.351	0.000059
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	B.1.351.2	0.000605
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.1.351.3	0.001753
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	B.1.36.1	0.002281
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.1.36.10	0.009569
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.1.36.26	0.005714
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.1.36.34	0.042553
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.1.36.39	0.004435
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	B.1.375	0.001639
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.1.396	0.001411
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.1.400	0.000858
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	B.1.413	0.008511
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.1.420	0.020833
ORF1ab/nsp2	419	A419del	GCC	---	2	2	B.1.424	0.016129
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	2	2	B.1.429	0.000047
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	B.1.456	0.006536
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.1.480	0.004975
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.1.517	0.000854
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.1.524	0.002813
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	B.1.551	0.002581
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	2	2	B.1.568	0.002222
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.1.574	0.004301
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.1.586	0.021978
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.1.588	0.00182
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	B.1.595	0.000522
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.1.597	0.009259
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	B.1.620	0.001892
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.1.621.1	0.001012
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	2	2	B.1.628	0.000705
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	B.3	0.001661
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	C.14	0.008658
ORF1ab/nsp2	419	A419del	GCC	---	2	2	N.6	0.014184
ORF1ab/nsp2	419	A419del	GCC	---	2	2	P.1	0.000032
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	P.1.10	0.000539
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	P.1.12	0.000968
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	P.1.2	0.002312
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	P.1.7	0.000639
ORF1ab/nsp2	419	A419del	GCC	---	2	2	P.2	0.000373
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	2	2	R.1	0.00018
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	2	2	R.1	0.00018
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	A.19	0.009434
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	A.2	0.000662
ORF1ab/nsp2	419	A419S	Gcc	Tcc	1	1	A.2.2	0.001689
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	A.2.5.2	0.001572
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	A.23.1	0.000704
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	AU.1	0.001266
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	AU.1	0.001266
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	AU.2	0.002421
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	AY.10	0.00053
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	1	1	AY.100	0.000046
ORF1ab/nsp2	419	A419del	GCC	---	1	1	AY.100	0.000046
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	1	1	AY.102	0.000027
ORF1ab/nsp2	419	A419del	GCC	---	1	1	AY.103	0.000006
ORF1ab/nsp2	419	A419S	Gcc	Tcc	1	1	AY.114	0.000231
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	AY.114	0.000231
ORF1ab/nsp2	419	A419S	Gcc	Tcc	1	1	AY.117	0.000085
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	AY.12	0.000316
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	AY.12	0.000316
ORF1ab/nsp2	419	A419del1	gCc	g-c	1	1	AY.120	0.000037
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	AY.120.1	0.000321
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	AY.120.2	0.001285
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	AY.14	0.000088
ORF1ab/nsp2	419	A419del	GCC	---	1	1	AY.16.1	0.00047
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	1	1	AY.16.1	0.00047
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	AY.18	0.010101
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	AY.22	0.002092
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	AY.23.1	0.000417
ORF1ab/nsp2	419	A419P	Gcc	Ccc	1	1	AY.25	0.000006
ORF1ab/nsp2	419	A419S	Gcc	Tcc	1	1	AY.26	0.000028
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	AY.27	0.000065
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	AY.29.1	0.000221
ORF1ab/nsp2	419	A419del	GCC	---	1	1	AY.3	0.00001
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	AY.30	0.000396
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	AY.34	0.000097
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	AY.38	0.000499
ORF1ab/nsp2	419	A419D	gCc	gAc	1	1	AY.39	0.000025
ORF1ab/nsp2	419	A419P	Gcc	Ccc	1	1	AY.39.1	0.00004
ORF1ab/nsp2	419	A419del	GCC	---	1	1	AY.4	0.000002
ORF1ab/nsp2	419	A419P	Gcc	Ccc	1	1	AY.4	0.000002
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	1	1	AY.4.2	0.000022
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	AY.4.3	0.000842
ORF1ab/nsp2	419	A419del	GCC	---	1	1	AY.4.5	0.000107
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	AY.40	0.000964
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	1	1	AY.42	0.00004
ORF1ab/nsp2	419	A419S	GCc	AGc	1	1	AY.43	0.000004
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	AY.46.2	0.000635
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	AY.46.2	0.000635
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	AY.46.3	0.000934
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	AY.46.6	0.000072
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	AY.5.3	0.000337
ORF1ab/nsp2	419	A419del	GCC	---	1	1	AY.5.3	0.000337
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	AY.5.4	0.000277
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	AY.5.4	0.000277
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	AY.51	0.000909
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	1	1	AY.52	0.000814
ORF1ab/nsp2	419	A419del	GCC	---	1	1	AY.54	0.000095
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	AY.55	0.000917
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	AY.58	0.000907
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	AY.58	0.000907
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	AY.59	0.00053
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	AY.61	0.000105
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	AY.68	0.000274
ORF1ab/nsp2	419	A419S	Gcc	Tcc	1	1	AY.7	0.000196
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	AY.7.1	0.000113
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	AY.7.1	0.000113
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	AY.70	0.000209
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	AY.71	0.000475
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	AY.71	0.000475
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	AY.74	0.000116
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	AY.75.1	0.00018
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	AY.78	0.001541
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcG	1	1	AY.79	0.001211
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	AY.82	0.001357
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	AY.83	0.001724
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	AY.87	0.000833
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	AY.9.1	0.000084
ORF1ab/nsp2	419	A419del	GCC	---	1	1	AY.9.2	0.000037
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	AY.91	0.00073
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	AY.92	0.000287
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	AY.93	0.000273
ORF1ab/nsp2	419	A419del	GCC	---	1	1	AY.93	0.000273
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	AY.94	0.000443
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	AY.95	0.000761
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	AY.95	0.000761
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	AY.99.1	0.001553
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	AZ.2	0.000821
ORF1ab/nsp2	419	A419D	gCc	gAc	1	1	B	0.000128
ORF1ab/nsp2	419	A419S	Gcc	Tcc	1	1	B	0.000128
ORF1ab/nsp2	419	A419P	Gcc	Ccc	1	1	B.1	0.000009
ORF1ab/nsp2	419	A419del	GCC	---	1	1	B.1.1	0.000018
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.1.1	0.000327
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.1.134	0.011364
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.1.141	0.002012
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.1.141	0.002012
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	1	1	B.1.1.153	0.001095
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.1.161	0.003534
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.1.174	0.003378
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.1.176	0.000439
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.1.186	0.003436
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.1.207	0.001182
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.1.220	0.001859
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	1	1	B.1.1.222	0.000204
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	1	1	B.1.1.253	0.002506
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.1.273	0.006757
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.1.280	0.003086
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.1.288	0.001916
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.1.304	0.002809
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.1.31	0.066667
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.1.311	0.000358
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.1.311	0.000358
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.1.316	0.000925
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.1.318	0.000302
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.1.322	0.008772
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.1.326	0.001761
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.1.333	0.001076
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.1.356	0.008547
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.1.368	0.003086
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.1.369	0.000446
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.1.369	0.000446
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.1.372	0.000689
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.1.373	0.02381
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.1.402	0.011111
ORF1ab/nsp2	419	A419del	GCC	---	1	1	B.1.1.416	0.000905
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.1.416	0.000905
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.1.420	0.001006
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.1.434	0.000349
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.1.44	0.00241
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.1.442	0.018519
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.1.45	0.014085
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.1.450	0.034483
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.1.464	0.001473
ORF1ab/nsp2	419	A419del1	gCc	g-c	1	1	B.1.1.47	0.005348
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.1.48	0.002874
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	1	1	B.1.1.519	0.00004
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.1.59	0.006494
ORF1ab/nsp2	419	A419D	gCc	gAc	1	1	B.1.1.7	0.000001
ORF1ab/nsp2	419	A419F	GCc	TTc	1	1	B.1.1.7	0.000001
ORF1ab/nsp2	419	A419P	Gcc	Ccc	1	1	B.1.1.7	0.000001
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.1.70	0.000341
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.1.71	0.006061
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.1.92	0.033333
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.1.95	0.019608
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.110.3	0.000718
ORF1ab/nsp2	419	A419S	Gcc	Tcc	1	1	B.1.111	0.001175
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.143	0.021277
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.149	0.003425
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.157	0.002985
ORF1ab/nsp2	419	A419S	Gcc	Tcc	1	1	B.1.160	0.000031
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.160.14	0.002119
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.160.30	0.002976
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcG	1	1	B.1.169	0.014925
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	1	1	B.1.177	0.000013
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.177.12	0.000152
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.177.15	0.000631
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	1	1	B.1.177.17	0.000821
ORF1ab/nsp2	419	A419del	GCC	---	1	1	B.1.177.18	0.00116
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.177.21	0.000076
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.177.21	0.000076
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.177.23	0.003236
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.177.32	0.00135
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.177.33	0.001645
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.177.34	0.052632
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.177.35	0.000691
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	1	1	B.1.177.4	0.000211
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.177.40	0.005155
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.177.43	0.001477
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.177.53	0.002392
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.177.54	0.000606
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.177.56	0.000668
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.177.56	0.000668
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.177.58	0.001332
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.177.6	0.000977
ORF1ab/nsp2	419	A419P	Gcc	Ccc	1	1	B.1.177.7	0.000165
ORF1ab/nsp2	419	A419D	gCc	gAc	1	1	B.1.177.73	0.000566
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.177.73	0.000566
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcA	1	1	B.1.177.73	0.000566
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.177.75	0.001041
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.177.76	0.002494
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.177.82	0.000477
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.177.9	0.001332
ORF1ab/nsp2	419	A419del	GCC	---	1	1	B.1.179	0.003759
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.189	0.004292
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.195	0.005025
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.214.1	0.02
ORF1ab/nsp2	419	A419S	Gcc	Tcc	1	1	B.1.221	0.000071
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.221.1	0.002907
ORF1ab/nsp2	419	A419del	GCC	---	1	1	B.1.234	0.000132
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.258.11	0.000396
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.258.14	0.00098
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.258.17	0.000104
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.258.3	0.001675
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.258.7	0.001912
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.260	0.003344
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.3	0.002618
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.320	0.001245
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.329	0.000608
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.349	0.000715
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.350	0.002933
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.36.22	0.001208
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.36.31	0.001751
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.366	0.004878
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.367	0.000792
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.397	0.004854
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.400	0.000429
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.416.1	0.001563
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.417	0.028571
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.426	0.001009
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	1	1	B.1.427	0.00005
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.428.3	0.012821
ORF1ab/nsp2	419	A419del	GCC	---	1	1	B.1.429	0.000024
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.445	0.011765
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.456	0.003268
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.466	0.023256
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.470	0.001404
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.471	0.002732
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.499	0.00105
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.523	0.002451
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.538	0.008065
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.540	0.009709
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.541	0.004425
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.560	0.00463
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.560	0.00463
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.561	0.000397
ORF1ab/nsp2	419	A419del	GCC	---	1	1	B.1.561	0.000397
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.564	0.000426
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.564	0.000426
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.565	0.00081
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.565	0.00081
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.568	0.001111
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.576	0.000907
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.577	0.000687
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	1	1	B.1.580	0.004065
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.587	0.001898
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.595	0.000261
ORF1ab/nsp2	419	A419S	Gcc	Tcc	1	1	B.1.595	0.000261
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	1	1	B.1.596	0.000087
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.597	0.00463
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.617.1	0.000129
ORF1ab/nsp2	419	A419S	Gcc	Tcc	1	1	B.1.617.2	0.000004
ORF1ab/nsp2	419	A419del	GCC	---	1	1	B.1.617.2	0.000004
ORF1ab/nsp2	419	A419P	Gcc	Ccc	1	1	B.1.617.2	0.000004
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.1.617.3	0.002985
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.625	0.002353
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.1.9	0.006173
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	B.23	0.002924
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.4.1	0.018868
ORF1ab/nsp2	419	A419del	GCC	---	1	1	B.57	0.015152
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	B.6.1	0.026316
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	C.18	0.002591
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	C.2	0.016129
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	C.23	0.005814
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	C.30	0.001727
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	C.36.3.1	0.002717
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	1	1	C.37	0.000116
ORF1ab/nsp2	419	A419S	Gcc	Tcc	1	1	D.2	0.000075
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	1	1	D.2	0.000075
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	1	1	P.1.12	0.000484
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	1	1	P.1.17	0.000162
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	1	1	P.1.2	0.001156
ORF1ab/nsp2	419	A419T	Gcc	Acc	1	1	P.2	0.000187
ORF1ab/nsp2	419	A419A	gcC	gcT	1	1	P.7	0.004367
ORF1ab/nsp2	419	A419V	gCc	gTc	1	1	Q.3	0.000145

CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk

CoV-GLUE uses sequence data from GISAID. GISAID data provided via this web application is subject to GISAID's Terms and Conditions.