CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : CodonNum = 418

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2418M418TM598TnonsynaTgaCg117311720.9991472057-2059
ORF1ab/nsp2418M418TM598TnonsynaTGaCA117310.0008525152057-2059
ORF1ab/nsp2418M418IM598InonsynatGatA5735120.8935432057-2059
ORF1ab/nsp2418M418IM598InonsynatGatT573590.1029672057-2059
ORF1ab/nsp2418M418IM598InonsynatGatC57320.00349042057-2059
ORF1ab/nsp2418M418VM598VnonsynAtgGtg39239212057-2059
ORF1ab/nsp2418M418KM598KnonsynaTgaAg494912057-2059
ORF1ab/nsp2418M418delM598deldelATG---414112057-2059
ORF1ab/nsp2418M418LM598LnonsynAtgCtg38320.8421052057-2059
ORF1ab/nsp2418M418LM598LnonsynAtgTtg3860.1578952057-2059
ORF1ab/nsp2418M418RM598RnonsynaTgaGg131312057-2059
ORF1ab/nsp2418M418AM598AnonsynATgGCg2212057-2059
ORF1ab/nsp2418M418NM598NnonsynaTGaAT1112057-2059

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg11721173All0.000224
ORF1ab/nsp2418M418TaTGaCA11173All0
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg898898AY.40.001398
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA512573All0.000098
ORF1ab/nsp2418M418IatGatT59573All0.000011
ORF1ab/nsp2418M418IatGatC2573All0
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg392392All0.000075
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA95105B.1.1.70.000085
ORF1ab/nsp2418M418IatGatT10105B.1.1.70.000009
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA100100B.1.5960.008714
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg9999AY.30.000985
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg9090AY.440.000548
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg7777B.1.617.20.00029
ORF1ab/nsp2418M418KaTgaAg4949All0.000009
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA4343P.10.000677
ORF1ab/nsp2418M418delATG---4141All0.000008
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg4040AY.40.000062
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg3939B.1.617.20.000147
ORF1ab/nsp2418M418LAtgCtg3238All0.000006
ORF1ab/nsp2418M418LAtgTtg638All0.000001
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA3737B.1.1.370.007136
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg3737B.1.1.70.000033
ORF1ab/nsp2418M418KaTgaAg3434K.10.809524
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA2033AY.40.000031
ORF1ab/nsp2418M418IatGatT1333AY.40.00002
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA2324B.1.617.20.000087
ORF1ab/nsp2418M418IatGatC124B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA1222B.10.00011
ORF1ab/nsp2418M418IatGatT922B.10.000082
ORF1ab/nsp2418M418IatGatC122B.10.000009
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA1820AY.250.000108
ORF1ab/nsp2418M418IatGatT220AY.250.000012
ORF1ab/nsp2418M418LAtgCtg1919AY.40.00003
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA1919AY.430.000084
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg1919AY.60.000781
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg1717AY.290.000268
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg1717AY.98.10.000823
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA1515AY.1020.000398
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg1515AY.1030.000093
ORF1ab/nsp2418M418RaTgaGg1313All0.000002
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA1212AY.1030.000075
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg1212B.1.20.000106
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA1112B.1.20.000097
ORF1ab/nsp2418M418IatGatT112B.1.20.000009
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg1111AY.250.000066
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA1111B.1.1.5190.000437
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg1010AY.1030.000062
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA910B.1.10.000163
ORF1ab/nsp2418M418IatGatT110B.1.10.000018
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg1010B.1.1.70.000009
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg1010B.1.258.170.00104
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg99B.1.1770.000119
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg88AY.260.000226
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg88B.1.177.190.011445
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA88B.1.6270.016162
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg77B.1.20.000062
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA77B.1.3240.011236
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA56AY.440.00003
ORF1ab/nsp2418M418IatGatT16AY.440.000006
ORF1ab/nsp2418M418IatGatT55A.20.003309
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg55AY.430.000022
ORF1ab/nsp2418M418delATG---55B.10.000046
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg55B.1.10.000091
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg55B.1.1.280.001556
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA55B.1.3990.009671
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA55P.1.70.001596
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA44AY.1060.00134
ORF1ab/nsp2418M418KaTgaAg44AY.30.00004
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA34AY.30.00003
ORF1ab/nsp2418M418IatGatT14AY.30.00001
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg44AY.4.20.000087
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg44AY.440.000024
ORF1ab/nsp2418M418RaTgaGg44B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp2418M418delATG---44B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp2418M418IatGatT33AY.290.000047
ORF1ab/nsp2418M418LAtgTtg33AY.370.000948
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg33AY.420.000121
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA33AY.740.000347
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg33B.1.10.000054
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg33B.1.1.250.001706
ORF1ab/nsp2418M418delATG---33B.1.1.330.001263
ORF1ab/nsp2418M418LAtgCtg33B.1.20.000026
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg33B.1.4270.000151
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg33B.1.5960.000261
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA23B.1.617.10.000258
ORF1ab/nsp2418M418IatGatT13B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA33B.270.046154
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg33D.20.000225
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg33P.10.000047
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg33P.1.140.000143
ORF1ab/nsp2418M418AATgGCg22All0
ORF1ab/nsp2418M418RaTgaGg22AY.100.00106
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg22AY.1070.000932
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg22AY.1190.000071
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg22AY.1200.000074
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg22AY.1200.000074
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg22AY.200.000078
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg22AY.250.000012
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg22AY.290.000032
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA22AY.310.037037
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg22AY.330.000134
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg22AY.390.000049
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg22AY.390.000049
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg22AY.39.10.000079
ORF1ab/nsp2418M418IatGatT12AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA12AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg22AY.430.000009
ORF1ab/nsp2418M418KaTgaAg22AY.440.000012
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA22AY.50.000041
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg22AY.590.001059
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg22AY.60.000082
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA22AY.610.00021
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg22AY.620.000871
ORF1ab/nsp2418M418KaTgaAg22B.10.000018
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg22B.10.000018
ORF1ab/nsp2418M418delATG---22B.1.1.3480.001592
ORF1ab/nsp2418M418KaTgaAg22B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg22B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg22B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp2418M418IatGatT22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg22B.1.177.40.000422
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg22B.1.177.540.001213
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg22B.1.2410.001623
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA22B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA12B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp2418M418IatGatT12B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp2418M418IatGatT12B.1.360.000146
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA12B.1.360.000146
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA22B.1.4130.008511
ORF1ab/nsp2418M418delATG---22B.1.4240.016129
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA12B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp2418M418IatGatT12B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg22B.1.4290.000047
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA22B.1.4290.000047
ORF1ab/nsp2418M418RaTgaGg22B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp2418M418delATG---22N.60.014184
ORF1ab/nsp2418M418delATG---22P.10.000032
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA22P.1.10.000635
ORF1ab/nsp2418M418delATG---22P.20.000373
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg11AD.20.000219
ORF1ab/nsp2418M418KaTgaAg11AE.50.018519
ORF1ab/nsp2418M418NaTGaAT11All0
ORF1ab/nsp2418M418delATG---11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp2418M418delATG---11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg11AY.1080.001103
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg11AY.1090.00074
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg11AY.120.2.10.000498
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp2418M418LAtgCtg11AY.140.000088
ORF1ab/nsp2418M418delATG---11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg11AY.230.00007
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA11AY.230.00007
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg11AY.260.000028
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg11AY.270.000065
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp2418M418RaTgaGg11AY.30.00001
ORF1ab/nsp2418M418delATG---11AY.30.00001
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA11AY.330.000067
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA11AY.350.000233
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg11AY.360.000148
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA11AY.390.000025
ORF1ab/nsp2418M418delATG---11AY.40.000002
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp2418M418delATG---11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg11AY.420.00004
ORF1ab/nsp2418M418LAtgCtg11AY.420.00004
ORF1ab/nsp2418M418RaTgaGg11AY.440.000006
ORF1ab/nsp2418M418LAtgCtg11AY.440.000006
ORF1ab/nsp2418M418KaTgaAg11AY.450.000122
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA11AY.46.30.000934
ORF1ab/nsp2418M418RaTgaGg11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp2418M418LAtgCtg11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp2418M418delATG---11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg11AY.520.000814
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA11AY.530.000288
ORF1ab/nsp2418M418delATG---11AY.540.000095
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA11AY.550.000917
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg11AY.610.000105
ORF1ab/nsp2418M418IatGatT11AY.710.000475
ORF1ab/nsp2418M418TaTGaCA11AY.790.001211
ORF1ab/nsp2418M418IatGatT11AY.80.000606
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp2418M418delATG---11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg11AY.920.000287
ORF1ab/nsp2418M418AATgGCg11AY.920.000287
ORF1ab/nsp2418M418delATG---11AY.930.000273
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA11AY.980.000079
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp2418M418LAtgCtg11B0.000128
ORF1ab/nsp2418M418LAtgCtg11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp2418M418delATG---11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp2418M418LAtgCtg11B.1.1.1710.003676
ORF1ab/nsp2418M418IatGatT11B.1.1.3050.003861
ORF1ab/nsp2418M418LAtgCtg11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg11B.1.1.4110.014706
ORF1ab/nsp2418M418delATG---11B.1.1.4160.000905
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg11B.1.1.4160.000905
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg11B.1.1.4480.002033
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg11B.1.1.5180.006329
ORF1ab/nsp2418M418LAtgCtg11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp2418M418LAtgCtg11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp2418M418NaTGaAT11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA11B.1.1280.000635
ORF1ab/nsp2418M418LAtgTtg11B.1.1580.02381
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp2418M418delATG---11B.1.177.180.00116
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg11B.1.177.560.000668
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA11B.1.177.60.000977
ORF1ab/nsp2418M418IatGatT11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA11B.1.177.860.000183
ORF1ab/nsp2418M418delATG---11B.1.1790.003759
ORF1ab/nsp2418M418KaTgaAg11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp2418M418RaTgaGg11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp2418M418delATG---11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp2418M418LAtgTtg11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp2418M418KaTgaAg11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg11B.1.3200.001245
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA11B.1.36.180.00042
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg11B.1.36.380.001642
ORF1ab/nsp2418M418IatGatT11B.1.3960.000706
ORF1ab/nsp2418M418AATgGCg11B.1.4160.001269
ORF1ab/nsp2418M418delATG---11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp2418M418delATG---11B.1.5610.000397
ORF1ab/nsp2418M418KaTgaAg11B.1.5750.000303
ORF1ab/nsp2418M418RaTgaGg11B.1.5750.000303
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg11B.1.5970.00463
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg11B.1.6050.005952
ORF1ab/nsp2418M418delATG---11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA11B.1.6200.000946
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp2418M418IatGatT11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg11B.1.88.10.004808
ORF1ab/nsp2418M418delATG---11B.570.015152
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg11C.370.000116
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg11D.20.000075
ORF1ab/nsp2418M418LAtgTtg11D.20.000075
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg11P.10.000016
ORF1ab/nsp2418M418TaTgaCg11P.1.100.000269
ORF1ab/nsp2418M418VAtgGtg11P.1.100.000269
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA11P.1.120.000484
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA11P.1.60.001946
ORF1ab/nsp2418M418IatGatA11Q.40.000455