CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : CodonNum = 370

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2370R370CR550CnonsynCgcTgc3759375911913-1915
ORF1ab/nsp2370R370HR550HnonsyncGccAc1707170711913-1915
ORF1ab/nsp2370R370RR550RsyncgCcgT131210870.8285061913-1915
ORF1ab/nsp2370R370RR550RsyncgCcgA13122210.1684451913-1915
ORF1ab/nsp2370R370RR550RsyncgCcgG131240.003048781913-1915
ORF1ab/nsp2370R370SR550SnonsynCgcAgc5515490.996371913-1915
ORF1ab/nsp2370R370SR550SnonsynCGcTCc55110.001814881913-1915
ORF1ab/nsp2370R370SR550SnonsynCgCAgT55110.001814881913-1915
ORF1ab/nsp2370R370delR550deldelCGC---515111913-1915
ORF1ab/nsp2370R370LR550LnonsyncGccTc20180.91913-1915
ORF1ab/nsp2370R370LR550LnonsyncGCcTT2010.051913-1915
ORF1ab/nsp2370R370LR550LnonsynCGCTTA2010.051913-1915
ORF1ab/nsp2370R370GR550GnonsynCgcGgc7711913-1915
ORF1ab/nsp2370R370PR550PnonsyncGccCc3311913-1915
ORF1ab/nsp2370R370del2R550del2delCGc--c1111913-1915
ORF1ab/nsp2370R370del1R550del1delcGcc-c1111913-1915

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc37593759All0.000719
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc19351935B.1.2790.993837
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc17071707All0.000326
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT10871312All0.000208
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgA2211312All0.000042
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgG41312All0.000001
ORF1ab/nsp2370R370SCgcAgc549551All0.000105
ORF1ab/nsp2370R370SCGcTCc1551All0
ORF1ab/nsp2370R370SCgCAgT1551All0
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc359359B.1.1.70.000321
ORF1ab/nsp2370R370SCgcAgc335335AY.40.000521
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgA188269B.1.1.70.000168
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT79269B.1.1.70.000071
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgG2269B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc262262B.1.1.70.000235
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc211211AY.40.000328
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT174174AY.40.000271
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc174174B.1.6260.994286
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT167167AY.4.50.017951
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc152152B.1.20.001338
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc135135AY.40.00021
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc135135B.1.617.20.000508
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc134134AY.250.000806
ORF1ab/nsp2370R370SCgcAgc110110B.1.1.70.000098
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT101101P.10.001591
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc8888B.1.617.20.000331
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc8484P.10.001323
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc6767AY.1030.000416
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc6565B.10.000595
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc6262AY.430.000275
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc6060AY.440.000365
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc5757AY.430.000253
ORF1ab/nsp2370R370delCGC---5151All0.00001
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc5050AY.30.000497
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc4545AY.1030.000279
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc4545B.1.20.000396
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT3745B.1.20.000326
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgA845B.1.20.00007
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT4444AY.1030.000273
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT3939AY.30.000388
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc3939B.1.5250.004413
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT3539B.1.617.20.000132
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgA439B.1.617.20.000015
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT3537AY.440.000213
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgA237AY.440.000012
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc3535AY.50.000723
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc3333B.1.438.10.00354
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc3131AY.7.10.003494
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc3131B.10.000284
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc3131B.1.2210.002202
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc3131B.1.4290.000729
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc3030AY.250.00018
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc3030AY.4.20.000651
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc3030C.36.3.10.081522
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT2627AY.430.000115
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgA127AY.430.000004
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc2727AY.440.000164
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT2727B.1.5260.000635
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT2626B.1.1.3720.017906
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT2525AY.120.007901
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc2424AY.390.000593
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc2424B.1.4290.000565
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc2424B.1.5260.000564
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc2121P.10.000331
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc2121Q.30.003046
ORF1ab/nsp2370R370LcGccTc1820All0.000003
ORF1ab/nsp2370R370LcGCcTT120All0
ORF1ab/nsp2370R370LCGCTTA120All0
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc2020AY.99.20.001843
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc2020B.1.10.000363
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc1919AY.420.000764
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc1919B.1.1770.00025
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc1919B.1.36.90.061093
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT1818AY.880.015915
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc1818C.160.019088
ORF1ab/nsp2370R370SCgcAgc1717AY.1030.000106
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT1717AY.4.20.000369
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT1717B.1.1770.000224
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT1717B.1.2580.001131
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc1616B.1.5680.017778
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc1515AY.1020.000398
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc1515AY.950.011416
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc1414AY.260.000396
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc1414B.1.1.5190.000556
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc1414B.1.177.70.002308
ORF1ab/nsp2370R370SCgcAgc1313AY.250.000078
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT1313AY.50.000268
ORF1ab/nsp2370R370SCgcAgc1313B.1.617.20.000049
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc1313P.70.056769
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc1212B.1.6090.005753
ORF1ab/nsp2370R370SCgcAgc1111AY.1200.000409
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc1111AY.260.000311
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc1111AY.30.000109
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc1111AY.330.000735
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc1111AY.50.000227
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc1111B0.001406
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc1111B.1.5260.000259
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc1010AY.1020.000265
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT910AY.250.000054
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgG110AY.250.000006
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc1010AY.98.10.000484
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT910B.10.000082
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgA110B.10.000009
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc1010B.1.1.2220.00204
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc1010B.1.1.3370.035971
ORF1ab/nsp2370R370delCGC---1010B.1.1.70.000009
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc99AY.290.000142
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT99B.1.1600.000281
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT99B.1.177.100.007902
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc99B.1.177.860.001651
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc99B.1.6210.000797
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc88AY.1190.000282
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc88AY.290.000126
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc88AY.60.000329
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc88B.1.1770.000105
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc88B.1.3510.000238
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc88B.1.36.290.004139
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT88B.1.3990.015474
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc88B.1.6210.000708
ORF1ab/nsp2370R370GCgcGgc77All0.000001
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc77AY.1190.000247
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc77AY.390.000173
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc77AY.540.000667
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc77AY.840.003062
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc77AY.9.20.000257
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc77B.1.2410.005682
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc77B.1.6370.000512
ORF1ab/nsp2370R370SCgcAgc77P.10.00011
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT66AY.200.000233
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc66AY.230.000418
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc66AY.3.10.000512
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc66AY.5.30.002024
ORF1ab/nsp2370R370SCgcAgc66B.10.000055
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc66B.1.10.000109
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT66B.1.10.000109
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT46B.1.1.5190.000159
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgA26B.1.1.5190.000079
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc66B.1.1600.000187
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc66B.1.6310.020202
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc55AE.80.002445
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc55AY.140.00044
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT55AY.290.000079
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc55AY.610.000524
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc55B.1.1600.000156
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT55B.1.160.260.012107
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc55B.1.360.00073
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT55B.1.4290.000118
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc55B.1.6270.010101
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc55P.1.140.000239
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT44AY.1020.000106
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc44AY.190.004561
ORF1ab/nsp2370R370SCgcAgc34AY.390.000074
ORF1ab/nsp2370R370SCGcTCc14AY.390.000025
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc44AY.460.000416
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc44AY.9.10.000335
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc44AY.980.000316
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT44B.1.1.1760.001757
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc44B.1.1.3160.0037
ORF1ab/nsp2370R370delCGC---44B.1.1.330.001684
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc44B.1.1.700.001364
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc44B.1.177.80.00301
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc44B.1.258.170.000416
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT44B.1.3510.000119
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc44B.1.3510.000119
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc44B.1.4270.000202
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT24B.1.5960.000174
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgA24B.1.5960.000174
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc44B.1.6370.000292
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT44Q.10.000505
ORF1ab/nsp2370R370SCgcAgc44Q.80.00066
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc44R.10.00036
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc33A0.001161
ORF1ab/nsp2370R370PcGccCc33All0.000001
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc33AY.1000.000138
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc33AY.120.000948
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc33AY.120.000948
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc33AY.1200.000112
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgA33AY.140.000264
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT33AY.39.10.000119
ORF1ab/nsp2370R370GCgcGgc33AY.40.000005
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc33AY.420.000121
ORF1ab/nsp2370R370SCgcAgc33AY.440.000018
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc33AY.470.000093
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc33AY.590.001589
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc33AY.640.001786
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc33AY.7.10.000338
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc33AY.700.000626
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc33AY.740.000347
ORF1ab/nsp2370R370delCGC---33B.10.000027
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT33B.1.1.2160.002671
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc33B.1.1.2840.000322
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc33B.1.1.2940.003797
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc33B.1.1.3060.001315
ORF1ab/nsp2370R370delCGC---33B.1.1.3480.002389
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT33B.1.1.3970.006757
ORF1ab/nsp2370R370delCGC---33B.1.1770.00004
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT33B.1.177.410.0075
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT33B.1.177.450.001144
ORF1ab/nsp2370R370LcGccTc23B.1.20.000018
ORF1ab/nsp2370R370LcGCcTT13B.1.20.000009
ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc33B.1.36.80.003
ORF1ab/nsp2370R370RcgCcgT33B.1.438.10.000322
ORF1ab/nsp2370R370HcGccAc33B.1.5250.000339
ORF1ab/nsp2370R370SCgcAgc33B.1.5750.00091
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ORF1ab/nsp2370R370CCgcTgc33C.370.000348
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