CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : CodonNum = 339 & Codon = gAt

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2339G339DG519DnonsyngGtgAt40540511820-1822

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt405405All0.000077
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt9898AY.250.000589
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt6767B.1.1.70.00006
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt3636C.160.038176
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt1919B.1.1.4160.017195
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt1414AY.40.000022
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt1414B.1.6090.006711
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt1414B.1.617.20.000053
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt1111AY.430.000049
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt1111P.10.000173
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt99C.360.008197
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt88B.10.000073
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt88B.1.1770.000105
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt55AY.1000.00023
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt55AY.440.00003
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt55AY.60.000206
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt55B.1.1.4590.076923
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt55B.1.20.000044
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt44B.1.36.290.002069
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt44C.370.000464
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt33AY.30.00003
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt33B.1.10.000054
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt33B.1.160.260.007264
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt33B.1.4270.000151
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt33B.1.6210.000266
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt33B.1.6370.000219
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt22AY.1190.000071
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt22AY.470.000062
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt22AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt22B.1.5750.000607
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11AD.20.000219
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11AH.30.003802
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11AY.120.000316
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11AY.190.00114
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11AY.260.000028
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11AY.340.000097
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11AY.390.000025
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11AY.4.40.000409
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11AY.460.000104
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11AY.650.000533
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11AY.710.000475
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11AY.750.000056
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11AY.940.000443
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11B.1.1.3690.000446
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11B.1.1.3720.000689
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11B.1.1.5260.003546
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11B.1.160.270.015152
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11B.1.2600.003344
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11C.350.000774
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11D.20.000075
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11P.1.120.000484
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11P.1.70.000319
ORF1ab/nsp2339G339DgGtgAt11Y.10.012821