CoV-GLUE | Mutations | Mutation
Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):
ORF | CodonNum | Mut | ORF1abMut | MutType | RefCodon | MutCodon | AACount | CodonCount | CodonProp | Genome Position |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | I473I | syn | atC | atT | 46912 | 46840 | 0.998465 | 1682-1684 |
Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):
ORF | CodonNum | Mut | RefCodon | MutCodon | CodonCount | AACount | Lineage | LineageCodonProp |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 46840 | 46912 | All | 0.008959 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 30692 | 30692 | AY.47 | 0.95468 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 4517 | 4519 | B.1.1.7 | 0.004044 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1448 | 1455 | B.1.617.2 | 0.005452 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1189 | 1191 | AY.4 | 0.001851 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1133 | 1133 | AY.39 | 0.027998 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 604 | 604 | B.1.258.16 | 0.988543 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 509 | 509 | B.1.2 | 0.004482 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 464 | 465 | B.1.177 | 0.00611 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 462 | 464 | AY.43 | 0.002047 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 258 | 261 | B.1 | 0.002363 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 244 | 246 | AY.25 | 0.001468 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 232 | 232 | AY.44 | 0.001412 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 231 | 231 | AY.103 | 0.001434 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 218 | 218 | B.1.618 | 0.879032 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 213 | 213 | P.1 | 0.003356 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 179 | 187 | AY.3 | 0.00178 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 168 | 168 | B.1.258.11 | 0.066587 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 149 | 152 | B.1.258 | 0.009915 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 136 | 136 | AY.42 | 0.005471 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 119 | 119 | B.1.160 | 0.003711 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 106 | 107 | AY.102 | 0.00281 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 107 | 107 | B.1.221 | 0.007601 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 99 | 99 | B.1.571 | 0.961165 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 94 | 94 | B.1.177.54 | 0.057004 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 83 | 83 | P.1.1 | 0.026366 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 80 | 80 | B.1.1.222 | 0.01632 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 80 | 80 | B.1.621 | 0.007082 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 77 | 77 | B.1.232 | 0.041376 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 77 | 77 | B.1.351 | 0.002289 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 76 | 76 | B.1.1.1 | 0.024828 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 73 | 73 | AY.9 | 0.004934 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 71 | 71 | AY.33 | 0.004741 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 70 | 71 | B.1.1 | 0.00127 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 68 | 69 | AY.75.1 | 0.012261 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 52 | 65 | AY.61 | 0.005448 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 63 | 63 | AY.119 | 0.002224 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 57 | 57 | B.1.526 | 0.00134 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 51 | 51 | B.1.429 | 0.0012 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 49 | 50 | AY.39.1 | 0.001941 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 46 | 46 | P.2 | 0.008585 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 45 | 45 | AY.5 | 0.000929 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 44 | 44 | B.1.525 | 0.004979 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 40 | 40 | AY.26 | 0.001132 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 39 | 39 | AY.29 | 0.000615 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 39 | 39 | C.37 | 0.004526 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 39 | 39 | P.1.14 | 0.001864 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 37 | 37 | AY.34 | 0.003588 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 37 | 37 | AY.75 | 0.002073 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 35 | 37 | B.1.1.519 | 0.00139 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 37 | 37 | B.1.243 | 0.002575 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 36 | 36 | AY.121 | 0.004871 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 34 | 34 | B.1.1.346 | 1 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 34 | 34 | B.1.427 | 0.001717 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 31 | 32 | AY.62 | 0.013508 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 30 | 30 | AY.120.1 | 0.009631 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 30 | 30 | AY.20 | 0.001166 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 30 | 30 | AY.65 | 0.015991 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 30 | 30 | B.1.1.434 | 0.010457 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 30 | 30 | B.1.1.61 | 0.263158 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 29 | 29 | R.1 | 0.00261 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 28 | 28 | AY.100 | 0.001288 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 27 | 27 | AY.120 | 0.001004 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 27 | 27 | Q.1 | 0.003411 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 26 | 26 | AY.14 | 0.002288 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 25 | 25 | AY.45 | 0.003042 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 24 | 24 | B.1.582 | 0.011776 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 23 | 23 | B.1.564 | 0.009796 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 20 | 21 | AY.98 | 0.00158 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 20 | 20 | B.1.1.28 | 0.006225 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 20 | 20 | B.1.36 | 0.002918 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 20 | 20 | B.1.524 | 0.028129 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 20 | 20 | C.16 | 0.021209 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 19 | 19 | B | 0.002428 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 19 | 19 | B.1.1.258 | 0.061889 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 19 | 19 | B.1.234 | 0.002507 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 17 | 17 | AY.117 | 0.001437 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 16 | 16 | AY.9.2 | 0.000588 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 15 | 16 | B.1.1.284 | 0.001611 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 16 | 16 | B.1.177.21 | 0.001224 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 16 | 16 | B.1.177.86 | 0.002935 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 15 | 15 | AY.4.2 | 0.000325 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 15 | 15 | AY.54 | 0.00143 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 14 | 14 | AY.38 | 0.00699 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 14 | 14 | AY.46.6 | 0.001011 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 14 | 14 | B.1.1.214 | 0.000776 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 14 | 14 | B.1.258.17 | 0.001456 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 14 | 14 | D.2 | 0.001051 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 13 | 14 | Q.8 | 0.002144 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 13 | 13 | AY.1 | 0.005144 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 11 | 13 | AY.46.4 | 0.00181 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 13 | 13 | B.1.240 | 0.002802 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 12 | 12 | AY.107 | 0.005592 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 12 | 12 | AY.74 | 0.001388 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 12 | 12 | B.1.1.521 | 0.064171 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 11 | 11 | AY.13 | 0.001771 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 11 | 11 | AY.36 | 0.00163 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 11 | 11 | B.1.311 | 0.00302 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 11 | 11 | B.1.596 | 0.000959 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 10 | 10 | A.2 | 0.006618 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 10 | 10 | AY.116 | 0.002868 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 10 | 10 | AY.23 | 0.000697 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 10 | 10 | B.1.623 | 0.005365 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 9 | 10 | B.1.637 | 0.000658 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 9 | 9 | AY.115 | 0.046875 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 9 | 9 | AY.99.2 | 0.000829 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 9 | 9 | B.1.1.192 | 0.020785 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 9 | 9 | B.1.1.317 | 0.003705 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 9 | 9 | B.1.36.29 | 0.004656 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 9 | 9 | B.1.466.2 | 0.003521 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 9 | 9 | B.1.565 | 0.007293 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 8 | 8 | A.27 | 0.013245 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 8 | 8 | AY.106 | 0.002679 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 8 | 8 | AY.110 | 0.000902 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 8 | 8 | AY.46 | 0.000833 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 8 | 8 | AY.5.3 | 0.002699 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 8 | 8 | AY.53 | 0.0023 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 8 | 8 | B.1.177.12 | 0.001214 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 8 | 8 | N.4 | 0.034043 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 7 | 7 | A.2.5 | 0.003493 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 7 | 7 | AD.2 | 0.001533 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 7 | 7 | AY.114 | 0.001618 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 7 | 7 | AY.118 | 0.000439 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 7 | 7 | AY.120.2 | 0.008997 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 7 | 7 | AY.48 | 0.003256 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 7 | 7 | AY.79 | 0.008475 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 7 | 7 | AY.9.1 | 0.000586 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 7 | 7 | AY.95 | 0.005327 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 7 | 7 | B.1.1.27 | 0.039548 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 7 | 7 | B.1.201 | 0.039773 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 7 | 7 | P.1.7 | 0.002235 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 6 | 6 | AY.3.1 | 0.000512 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 6 | 6 | AY.34.1 | 0.00306 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 6 | 6 | AY.5.4 | 0.00166 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 6 | 6 | AY.50 | 0.004796 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 6 | 6 | AY.59 | 0.003178 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 6 | 6 | AY.7.1 | 0.000676 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 6 | 6 | AY.71 | 0.00285 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 6 | 6 | B.1.1.230 | 0.055046 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 6 | 6 | B.1.1.318 | 0.001811 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 6 | 6 | C.35 | 0.004644 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 5 | 5 | AY.109 | 0.003698 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 5 | 5 | AY.35 | 0.001165 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 5 | 5 | AY.52 | 0.004072 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 5 | 5 | AY.7 | 0.00098 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 5 | 5 | AY.92 | 0.001436 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 5 | 5 | AZ.1 | 0.004337 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 5 | 5 | B.1.1.263 | 0.007788 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 5 | 5 | B.1.1.416 | 0.004525 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 5 | 5 | B.1.1.63 | 0.001929 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 5 | 5 | B.1.177.83 | 0.007407 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 5 | 5 | B.1.241 | 0.004058 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 5 | 5 | B.1.36.22 | 0.006039 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 5 | 5 | B.1.595 | 0.001305 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 4 | 5 | B.1.609 | 0.001918 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 5 | 5 | P.1.12 | 0.00242 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 5 | 5 | P.1.15 | 0.001162 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 5 | 5 | Q.3 | 0.000725 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 4 | 0.111111 | |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 4 | 4 | AY.16.1 | 0.00188 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 4 | 4 | AY.46.1 | 0.004107 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 4 | AY.55 | 0.001835 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 4 | 4 | AY.58 | 0.00363 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 4 | 4 | AY.93 | 0.001092 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 4 | 4 | B.1.1.326 | 0.007042 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 4 | 4 | B.1.1.344 | 0.043011 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 4 | 4 | B.1.1.39 | 0.002039 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 4 | 4 | B.1.177.4 | 0.000844 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 4 | 4 | B.1.210 | 0.008529 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 4 | 4 | B.1.218 | 0.020619 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 4 | 4 | B.1.265 | 0.005083 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 4 | 4 | B.1.336 | 0.009756 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 4 | 4 | B.1.36.19 | 0.037037 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 4 | 4 | B.1.369 | 0.001141 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 4 | B.1.400 | 0.000429 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 4 | 4 | B.1.459 | 0.016327 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 4 | 4 | B.1.517 | 0.001708 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 4 | 4 | B.1.561 | 0.001588 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 4 | 4 | B.1.621.1 | 0.002023 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 4 | 4 | C.23 | 0.023256 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 4 | 4 | Y.1 | 0.051282 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 3 | A | 0.000774 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | AY.24 | 0.001293 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | AY.27 | 0.000194 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | AY.29.1 | 0.000662 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | AY.4.2.1 | 0.000447 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | AY.40 | 0.002893 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | AY.46.2 | 0.001906 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | AY.6 | 0.000123 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | AY.67 | 0.001393 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | AY.7.2 | 0.001678 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | AY.84 | 0.001312 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | AY.99 | 0.003148 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | B.1.1.174 | 0.010135 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | B.1.1.269 | 0.00406 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | B.1.1.363 | 0.017964 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | B.1.1.369 | 0.001339 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | B.1.1.398 | 0.009677 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | B.1.1.48 | 0.008621 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | B.1.160.16 | 0.002788 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | B.1.177.16 | 0.001993 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | B.1.177.58 | 0.003995 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | B.1.177.81 | 0.000568 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | B.1.213 | 0.044776 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | B.1.222 | 0.005076 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | B.1.356 | 0.005181 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | B.1.36.1 | 0.003421 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | B.1.36.17 | 0.001482 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | B.1.36.38 | 0.004926 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | B.1.361 | 0.003866 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | B.1.425 | 0.008982 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | B.1.509 | 0.002597 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | B.31 | 0.011194 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | C.36.3 | 0.001702 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 3 | 3 | Q.4 | 0.001364 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | A.26 | 0.153846 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | AE.3 | 0.064516 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | AU.2 | 0.004843 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | AY.10 | 0.00106 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | AY.111 | 0.000366 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | AY.12 | 0.000632 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | AY.16 | 0.000759 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | AY.37 | 0.000632 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | AY.46.5 | 0.000397 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | AY.68 | 0.000547 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | AY.70 | 0.000417 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | AY.82 | 0.002714 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | AY.91 | 0.001461 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | AY.96 | 0.004149 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 2 | AY.98.1 | 0.000048 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | AZ.2 | 0.001642 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | AZ.6 | 0.016807 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.1.198 | 0.002937 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.1.265 | 0.006309 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.1.306 | 0.000877 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.1.316 | 0.00185 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.1.335 | 0.025974 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.1.348 | 0.001592 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.1.37 | 0.000386 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.1.397 | 0.004505 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.1.467 | 0.038462 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.1.50 | 0.001358 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.177.18 | 0.00232 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.177.30 | 0.005025 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.177.33 | 0.003289 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.177.35 | 0.001382 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.177.5 | 0.002484 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.177.52 | 0.003515 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.177.56 | 0.001335 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.177.7 | 0.00033 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.177.82 | 0.000955 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.189 | 0.008584 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.221.4 | 0.008333 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.326 | 0.015152 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.351.2 | 0.000605 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.36.18 | 0.00084 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.36.31 | 0.003503 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.36.8 | 0.002 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.393 | 0.057143 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.398 | 0.005952 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 2 | B.1.408 | 0.00369 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.422 | 0.001625 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.456 | 0.006536 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.466.1 | 0.014388 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.497 | 0.00063 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.501 | 0.014706 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.551 | 0.002581 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.575 | 0.000607 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.588 | 0.00182 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.600 | 0.011696 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.606 | 0.012048 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.628 | 0.000705 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | B.6.6 | 0.001778 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | C.1 | 0.004785 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | P.1.16 | 0.000748 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | P.1.4 | 0.001953 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | Q.7 | 0.002222 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 2 | 2 | W.3 | 0.010526 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | A.2.4 | 0.003367 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | A.2.5.3 | 0.010309 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | AE.5 | 0.018519 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | AE.8 | 0.000489 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | AM.4 | 0.003571 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | AT.1 | 0.005128 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | AU.1 | 0.001266 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | AU.3 | 0.00211 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | AY.101 | 0.00049 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | AY.105 | 0.000643 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | AY.108 | 0.001103 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | AY.113 | 0.000142 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | AY.23.1 | 0.000417 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | AY.28 | 0.00189 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | AY.30 | 0.000396 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | AY.32 | 0.000532 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | AY.39.2 | 0.001541 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | AY.4.4 | 0.000409 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | AY.4.5 | 0.000107 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | AY.41 | 0.000294 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | AY.56 | 0.001605 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | AY.57 | 0.000656 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | AY.60 | 0.000938 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | AY.63 | 0.000387 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | AY.64 | 0.000595 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | AY.69 | 0.000187 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | AY.72 | 0.001361 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | AY.8 | 0.000606 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | AY.80 | 0.001129 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | AY.85 | 0.000427 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | AY.88 | 0.000884 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | AY.94 | 0.000443 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.10 | 0.001115 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.117 | 0.009709 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.129 | 0.009174 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.141 | 0.002012 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.161 | 0.003534 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.163 | 0.007634 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.171 | 0.003676 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.176 | 0.000439 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.210 | 0.005714 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.216 | 0.00089 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.241 | 0.00207 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.257 | 0.009709 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.273 | 0.006757 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.274 | 0.005051 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.294 | 0.001266 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.301 | 0.001179 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.31 | 0.066667 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.324 | 0.052632 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.33 | 0.000421 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.337 | 0.003597 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.351 | 0.002793 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.372 | 0.000689 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.385 | 0.004464 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.402 | 0.011111 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.409 | 0.002833 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.411 | 0.014706 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.417 | 0.002703 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.432 | 0.001266 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.436 | 0.025641 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.486 | 0.001577 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.51 | 0.001718 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.523 | 0.001563 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.70 | 0.000341 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.111 | 0.001175 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.120 | 0.007692 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.160.13 | 0.027778 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.160.7 | 0.002079 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.177.10 | 0.000878 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.177.14 | 0.006098 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.177.15 | 0.000631 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.177.44 | 0.000519 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.177.51 | 0.004566 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.177.53 | 0.002392 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.177.57 | 0.000281 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.177.60 | 0.000218 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.177.69 | 0.001484 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.177.75 | 0.001041 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.177.77 | 0.000726 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.177.87 | 0.000728 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.178 | 0.02381 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.179 | 0.003759 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.206 | 0.000816 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.214 | 0.003663 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.215 | 0.009615 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.223 | 0.002778 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.225 | 0.015385 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.235 | 0.002519 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.239 | 0.001221 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.260 | 0.003344 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.313 | 0.006579 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.357 | 0.009524 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.36.26 | 0.002857 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.36.36 | 0.000602 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.36.39 | 0.002217 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.362 | 0.001541 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.371 | 0.001122 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.375 | 0.00082 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.377 | 0.004566 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.391 | 0.001127 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.396 | 0.000706 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.438.1 | 0.000107 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.453 | 0.003236 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.462 | 0.007246 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.474 | 0.001901 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.479 | 0.038462 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.507 | 0.011236 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.560 | 0.00463 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.568 | 0.001111 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.580 | 0.004065 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.581 | 0.009434 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.597 | 0.00463 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.617.1 | 0.000129 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.627 | 0.00202 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.630 | 0.005236 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.69 | 0.035714 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.9.5 | 0.005682 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.96 | 0.018868 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.4.6 | 0.016667 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | B.4.7 | 0.010101 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | C.18 | 0.002591 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | C.4 | 0.01 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | N.3 | 0.005814 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | P.1.17 | 0.000162 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | P.1.2 | 0.001156 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | P.7 | 0.004367 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | Q.2 | 0.000613 |
ORF1ab/nsp2 | 293 | I293I | atC | atT | 1 | 1 | U.2 | 0.008772 |
CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk
|