CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : CodonNum = 266 & Codon = ---

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2266L266delL446deldelCTT---1102110211601-1603

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11021102All0.000211
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---208208B.1.1.1910.990476
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---164164B.1.1.70.000147
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---164164B.1.5731
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---101101AY.40.000157
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---7777AY.1030.000478
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---4949AN.10.98
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---3434B.1.10.000617
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---3030AY.250.00018
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---2121B.10.000192
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---1414B.1.36.180.005882
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---1212P.10.000189
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---1111AY.430.000049
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---1111B.1.617.20.000041
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---1010AY.440.000061
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---1010B.1.1600.000312
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---1010B.1.20.000088
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---88B.1.1.5190.000318
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---77AY.4.50.000752
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---77B.1.1.170.116667
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---66B.1.1.3740.014252
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---66B.1.1770.000079
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---55AY.5.30.001687
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---55B.1.1.3180.001509
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---55B.1.1.370.000964
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---55B.1.2210.000355
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---55B.1.2340.00066
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---55B.1.36.380.00821
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---44AY.290.000063
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---44AY.330.000267
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---44AY.4.2.10.000596
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---44AY.9.10.000335
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---44AY.9.20.000147
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---44B.1.1.330.001684
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---44B.1.5260.000094
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---33A.50.005769
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---33AY.1200.000112
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---33AY.70.000588
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---33B.1.1.1940.014851
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---33B.1.1.3480.002389
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---22A0.000774
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---22AY.1180.000125
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---22AY.120.20.002571
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---22AY.30.00002
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---22AY.390.000049
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---22AY.420.00008
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---22AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---22B.1.1.2840.000215
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---22B.1.2060.001631
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---22B.1.2370.00995
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---22B.1.2430.000139
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---22B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---22B.1.351.20.000605
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---22B.1.36.80.002
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---22B.1.3690.00057
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---22B.1.5200.043478
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---22N.60.014184
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---22P.20.000373
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11AY.1050.000643
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11AY.116.10.000311
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11AY.60.000041
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11AY.710.000475
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11AY.850.000427
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11AY.90.000068
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11AY.980.000079
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11B.1.1.2000.007463
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11B.1.1.2160.00089
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11B.1.1.3350.012987
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11B.1.1.4480.002033
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11B.1.1.510.001718
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11B.1.1.540.003021
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11B.1.110.30.000718
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11B.1.160.160.000929
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11B.1.1730.026316
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11B.1.177.120.000152
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11B.1.177.560.000668
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11B.1.221.10.002907
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11B.1.36.160.001425
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11B.1.36.310.001751
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11B.1.3710.001122
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11B.1.4090.000781
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11B.1.438.10.000107
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11B.1.5600.00463
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11B.1.5610.000397
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp2266L266delCTT---11Q.10.000126