CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : CodonNum = 265 & Codon = Agt

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2265G265SG445SnonsynGgtAgt138113790.9985521598-1600

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt13791381All0.000264
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt462462AY.40.000719
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt381381B.1.1.70.000341
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt190190AY.1030.00118
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt5555B.1.617.20.000207
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt3131AY.440.000189
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt3030AY.430.000133
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt1313B.10.000119
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt1212AY.330.000801
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt1212B.1.36.80.012
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt1012P.10.000158
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt88AY.30.00008
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt88P.20.001493
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt77AY.1020.000186
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt77B.1.3570.066667
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt66B.1.1600.000187
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt66Q.80.000989
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt55AY.250.00003
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt55B.1.177.40.001055
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt55B.1.20.000044
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt44AY.390.000099
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt44AY.50.000083
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt44B.1.10.000073
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt44B.1.36.290.002069
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt44C.360.003643
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt33AY.1190.000106
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt33AY.4.20.000065
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt33AY.800.003386
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt33B.1.1.5190.000119
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt33B.1.1770.00004
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt33B.1.258.40.010345
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt33B.1.3510.000089
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt33B.1.36.190.027778
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt33B.1.6270.006061
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22A.10.000564
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22A.20.001324
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22AY.1200.000074
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22AY.290.000032
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22AY.550.001835
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22AY.870.001665
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22B.1.1.1280.014184
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22B.1.1490.006849
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22B.1.2210.000142
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22B.1.3610.002577
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22B.1.4290.000047
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22B.1.5230.004902
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22C.170.111111
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22C.370.000232
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22D.20.00015
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22P.1.170.000324
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22P.1.80.009569
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt110.055556
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11A0.000387
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.1110.000183
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.120.000316
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.130.000161
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.200.000039
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.230.00007
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.260.000028
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.340.000097
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.420.00004
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.460.000104
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.46.30.000934
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.520.000814
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.660.00107
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.70.000196
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.1.2490.071429
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.1.3010.001179
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.1.3690.000446
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.1700.00431
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.177.180.00116
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.177.230.003236
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.1990.004132
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.2140.003663
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.3490.000715
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.4560.003268
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.5880.00091
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.619.10.000641
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.370.028571
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.400.000364