CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : CodonNum = 265

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2265G265VG445VnonsyngGtgTt3149314911598-1600
ORF1ab/nsp2265G265SG445SnonsynGgtAgt138113790.9985521598-1600
ORF1ab/nsp2265G265SG445SnonsynGGtTCt138110.0007241131598-1600
ORF1ab/nsp2265G265SG445SnonsynGGTTCC138110.0007241131598-1600
ORF1ab/nsp2265G265delG445deldelGGT---1109110911598-1600
ORF1ab/nsp2265G265CG445CnonsynGgtTgt36936911598-1600
ORF1ab/nsp2265G265DG445DnonsyngGtgAt24024011598-1600
ORF1ab/nsp2265G265GG445GsynggTggC100890.891598-1600
ORF1ab/nsp2265G265GG445GsynggTggG10060.061598-1600
ORF1ab/nsp2265G265GG445GsynggTggA10050.051598-1600
ORF1ab/nsp2265G265RG445RnonsynGgtCgt17130.7647061598-1600
ORF1ab/nsp2265G265RG445RnonsynGgTAgG1740.2352941598-1600
ORF1ab/nsp2265G265AG445AnonsyngGtgCt320.6666671598-1600
ORF1ab/nsp2265G265del1G445del1delGGT-NN310.3333331598-1600
ORF1ab/nsp2265G265AG445AnonsyngGTgCC310.3333331598-1600
ORF1ab/nsp2265G265del1G445del1delGgt-gt310.3333331598-1600
ORF1ab/nsp2265G265del1G445del1delggTgg-310.3333331598-1600
ORF1ab/nsp2265G265FG445FnonsynGGtTTt2211598-1600
ORF1ab/nsp2265G265WG445WnonsynGgTTgG2211598-1600
ORF1ab/nsp2265G265del2G445del2delGGT--N210.51598-1600
ORF1ab/nsp2265G265del2G445del2delGGTA--210.51598-1600
ORF1ab/nsp2265G265NG445NnonsynGGTAAC210.51598-1600
ORF1ab/nsp2265G265NG445NnonsynGGtAAt210.51598-1600
ORF1ab/nsp2265G265TG445TnonsynGGtACt210.51598-1600
ORF1ab/nsp2265G265YG445YnonsynGGTTAC210.51598-1600
ORF1ab/nsp2265G265YG445YnonsynGGtTAt210.51598-1600
ORF1ab/nsp2265G265TG445TnonsynGGTACC210.51598-1600
ORF1ab/nsp2265G265PG445PnonsynGGtCCt1111598-1600
ORF1ab/nsp2265G265HG445HnonsynGGTCAC1111598-1600
ORF1ab/nsp2265G265KG445KnonsynGGTAAA1111598-1600

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt31493149All0.000602
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt13791381All0.000264
ORF1ab/nsp2265G265SGGtTCt11381All0
ORF1ab/nsp2265G265SGGTTCC11381All0
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11091109All0.000212
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt716716B.1.1.70.000641
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt462462AY.40.000719
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt381381B.1.1.70.000341
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt369369All0.000071
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt291291AY.440.001771
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt240240All0.000046
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt238238AY.40.00037
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---208208B.1.1.1910.990476
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt190190AY.1030.00118
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt186186B.1.617.20.0007
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---164164B.1.5731
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---160160B.1.1.70.000143
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt116116B.1.20.001021
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt106106B.1.1.70.000095
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt102102AY.260.002888
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---101101AY.40.000157
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC89100All0.000017
ORF1ab/nsp2265G265GggTggG6100All0.000001
ORF1ab/nsp2265G265GggTggA5100All0.000001
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt9090AY.430.000399
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt8383AY.250.000499
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt8282B.1.10.001488
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---7777AY.1030.000478
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt6666AY.1030.00041
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt5656B.1.6210.004957
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt5555B.1.617.20.000207
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt5353B.1.1.700.018076
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---4949AN.10.98
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt4949AY.1200.001822
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt4848B.10.00044
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt4848P.10.000756
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt4646B.1.36.170.022727
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt4242B.1.5200.913043
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt4141B.1.4270.00207
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt3838AY.40.000059
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt3838N.50.067138
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt3434AY.7.20.019016
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---3434B.1.10.000617
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt3434B.1.1950.170854
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt3333B.1.1.5190.00131
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt3232AY.30.000318
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---3131AY.250.000186
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt3131AY.440.000189
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt3131B.1.1.70.000028
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt3030AY.270.001942
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt3030AY.430.000133
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt2929AY.1210.003924
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---2626B.1.1.700.008868
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt2626B.1.177.770.018882
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt2626B.1.5750.007888
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt2525B.1.36.250.055188
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt2222B.1.4290.000518
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt2222B.1.617.20.000083
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt2121AY.98.10.001017
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---2020B.10.000183
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt2020B.1.3200.024907
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt2020B.1.360.002918
ORF1ab/nsp2265G265RGgtCgt1317All0.000002
ORF1ab/nsp2265G265RGgTAgG417All0.000001
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt1717AY.430.000075
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt1717B.1.1.3050.065637
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC1616AY.1170.001352
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt1616AY.39.10.000634
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt1616AY.40.000025
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt1616B.1.2430.001113
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt1515AY.200.000583
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt1515B.1.1600.000468
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt1414AY.390.000346
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---1414B.1.36.180.005882
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt1313AY.1020.000345
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt1313AY.200.000505
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt1313AY.4.20.000282
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt1313AY.9.20.000477
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt1313B.10.000119
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt1313B.1.5260.000306
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt1212AY.330.000801
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt1212AY.610.001257
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt1212B.10.00011
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt1212B.1.36.80.012
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---1212P.10.000189
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt1012P.10.000158
ORF1ab/nsp2265G265SGGTTCC112P.10.000016
ORF1ab/nsp2265G265SGGtTCt112P.10.000016
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt1111AY.120.2.10.005481
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---1111AY.430.000049
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt1111B.1.1.2140.00061
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---1111B.1.617.20.000041
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt1111C.370.001277
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt1010AY.250.00006
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt1010AY.540.000953
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC1010B.1.20.000088
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt1010B.1.6370.000731
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt99AY.330.000601
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt99AY.540.000858
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt99AY.7.10.001014
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---99B.1.1600.000281
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt99B.1.1770.000119
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---99B.1.20.000079
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt99B.1.36.290.004656
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt99B.1.4290.000212
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt88AY.30.00008
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt88AY.420.000322
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt88AY.440.000049
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt88AY.99.20.000737
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt88B.10.000073
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt88B.1.3510.000238
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt88B.1.617.20.00003
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt88B.1.6210.000708
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt88P.20.001493
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt77AY.1020.000186
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt77AY.1030.000043
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt77AY.116.10.00218
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt77AY.250.000042
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt77AY.30.00007
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC77AY.40.000011
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---77AY.4.50.000752
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt77AY.590.003708
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---77B.1.1.170.116667
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt77B.1.1.2160.006233
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt77B.1.3570.066667
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt77B.1.5250.000792
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt66AY.1190.000212
ORF1ab/nsp2265G265GggTggA36AY.250.000018
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC36AY.250.000018
ORF1ab/nsp2265G265RGgtCgt66AY.40.000009
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt66AY.420.000241
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt66AY.420.000241
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---66B.1.1.3740.014252
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt66B.1.1600.000187
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---66B.1.1770.000079
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt66B.1.2220.010152
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt66B.1.2580.000399
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC66B.1.5260.000141
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt66Q.80.000989
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt55AY.1020.000133
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt55AY.16.10.00235
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt55AY.250.00003
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt55AY.290.000079
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt55AY.4.2.10.000745
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---55AY.440.00003
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---55AY.5.30.001687
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt55AY.60.000206
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt55B.1.10.000091
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---55B.1.1.3180.001509
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---55B.1.1.370.000964
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---55B.1.1.5190.000199
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt55B.1.177.40.001055
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt55B.1.20.000044
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---55B.1.2210.000355
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---55B.1.2340.00066
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC55B.1.3510.000149
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC55B.1.360.00073
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt55B.1.36.180.002101
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---55B.1.36.380.00821
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt55B.1.466.20.001956
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt55B.1.5230.012255
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt44AY.1170.000338
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt44AY.1180.000251
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC44AY.120.10.001284
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt44AY.23.10.001669
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt44AY.260.000113
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt44AY.30.00004
ORF1ab/nsp2265G265RGgtCgt44AY.3.10.000341
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---44AY.330.000267
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt44AY.390.000099
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---44AY.4.2.10.000596
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt44AY.50.000083
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---44AY.9.10.000335
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---44AY.9.20.000147
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt44B.1.10.000073
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---44B.1.1.330.001684
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt44B.1.177.190.005722
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt44B.1.20.000035
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt44B.1.36.290.002069
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt44B.1.36.80.004
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---44B.1.5260.000094
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt44C.360.003643
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt44P.1.140.000191
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt44P.1.170.000647
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt33AE.10.034091
ORF1ab/nsp2265G265AgGtgCt23All0
ORF1ab/nsp2265G265AgGTgCC13All0
ORF1ab/nsp2265G265del1ggTgg-13All0
ORF1ab/nsp2265G265del1GGT-NN13All0
ORF1ab/nsp2265G265del1Ggt-gt13All0
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt33AY.1000.000138
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt33AY.1000.000138
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC23AY.1030.000012
ORF1ab/nsp2265G265GggTggA13AY.1030.000006
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt33AY.1090.002219
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt33AY.1190.000106
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---33AY.1200.000112
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt33AY.130.000483
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt33AY.4.20.000065
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt33AY.430.000013
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC33AY.440.000018
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt33AY.450.000365
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt33AY.470.000093
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt33AY.50.000062
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt33AY.520.002443
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---33AY.70.000588
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt33AY.750.000168
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt33AY.800.003386
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt33B.1.10.000054
ORF1ab/nsp2265G265GggTggG23B.1.10.000036
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC13B.1.10.000018
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---33B.1.1.1940.014851
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt33B.1.1.2360.02069
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---33B.1.1.3480.002389
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt33B.1.1.4320.003797
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt33B.1.1.5060.111111
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt33B.1.1.5190.000119
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt33B.1.1.5190.000119
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt33B.1.1770.00004
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt33B.1.258.40.010345
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt33B.1.3360.007317
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt33B.1.3510.000089
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt33B.1.36.190.027778
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC33B.1.6210.000266
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt33B.1.6270.006061
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt33C.360.002732
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt33D.20.000225
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt33P.1.100.000808
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt33Q.10.000379
ORF1ab/nsp2265G265GggTggG220.111111
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22A.10.000564
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22A.20.001324
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---22A.50.003846
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt22AD.20.000438
ORF1ab/nsp2265G265WGgTTgG22All0
ORF1ab/nsp2265G265FGGtTTt22All0
ORF1ab/nsp2265G265TGGtACt12All0
ORF1ab/nsp2265G265YGGtTAt12All0
ORF1ab/nsp2265G265del2GGTA--12All0
ORF1ab/nsp2265G265YGGTTAC12All0
ORF1ab/nsp2265G265del2GGT--N12All0
ORF1ab/nsp2265G265TGGTACC12All0
ORF1ab/nsp2265G265NGGtAAt12All0
ORF1ab/nsp2265G265NGGTAAC12All0
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt22AY.100.00106
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt22AY.1010.000981
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt22AY.1030.000012
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt22AY.1070.000932
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt22AY.1180.000125
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---22AY.1180.000125
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22AY.1200.000074
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---22AY.120.20.002571
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt22AY.140.000176
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt22AY.210.003795
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt22AY.290.000032
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22AY.290.000032
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---22AY.290.000032
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC22AY.30.00002
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---22AY.30.00002
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---22AY.390.000049
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt22AY.4.50.000215
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---22AY.420.00008
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt22AY.450.000243
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt22AY.460.000208
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt22AY.46.10.002053
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt22AY.46.40.000329
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt22AY.5.30.000675
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22AY.550.001835
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22AY.870.001665
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC22AY.90.000135
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt22AY.9.10.000167
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---22AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22B.1.1.1280.014184
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt22B.1.1.1330.016949
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt22B.1.1.280.000622
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---22B.1.1.2840.000215
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt22B.1.1.3540.008772
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt22B.1.1.3560.017094
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt22B.1.1.4640.002946
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt22B.1.1.570.022989
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC22B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt22B.1.1280.001271
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22B.1.1490.006849
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt22B.1.177.420.001789
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---22B.1.2060.001631
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22B.1.2210.000142
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt22B.1.2340.000264
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---22B.1.2370.00995
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---22B.1.2430.000139
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt22B.1.3110.000549
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---22B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt22B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---22B.1.351.20.000605
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt22B.1.36.80.002
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---22B.1.36.80.002
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22B.1.3610.002577
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---22B.1.3690.00057
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22B.1.4290.000047
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---22B.1.5200.043478
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22B.1.5230.004902
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt22B.1.5600.009259
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC22B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt22B.1.6230.001073
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt22B.1.6250.004706
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt22B.60.00182
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22C.170.111111
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22C.370.000232
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22D.20.00015
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---22N.60.014184
ORF1ab/nsp2265G265YGGTTAC12P.10.000016
ORF1ab/nsp2265G265NGGTAAC12P.10.000016
ORF1ab/nsp2265G265YGGtTAt12P.10.000016
ORF1ab/nsp2265G265NGGtAAt12P.10.000016
ORF1ab/nsp2265G265TGGTACC12P.10.000016
ORF1ab/nsp2265G265TGGtACt12P.10.000016
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22P.1.170.000324
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt22P.1.80.009569
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---22P.20.000373
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt22Q.30.00029
ORF1ab/nsp2265G265RGgTAgG110.055556
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt110.055556
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt110.055556
ORF1ab/nsp2265G265WGgTTgG110.055556
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11A0.000387
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11A0.000387
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11A0.000387
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt11A0.000387
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11A.2.5.10.004808
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11A.23.10.000704
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt11A.23.10.000704
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11AE.80.000489
ORF1ab/nsp2265G265PGGtCCt11All0
ORF1ab/nsp2265G265HGGTCAC11All0
ORF1ab/nsp2265G265KGGTAAA11All0
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11AT.10.005128
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt11AY.10.000396
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11AY.1050.000643
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11AY.1060.000335
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC11AY.1060.000335
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.1110.000183
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11AY.116.10.000311
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.120.000316
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.130.000161
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11AY.160.00038
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11AY.20.000356
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.200.000039
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11AY.230.00007
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.230.00007
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt11AY.230.00007
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt11AY.260.000028
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.260.000028
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11AY.270.000065
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt11AY.290.000016
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11AY.320.000532
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11AY.330.000067
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.340.000097
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11AY.340.000097
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11AY.360.000148
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11AY.360.000148
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11AY.370.000316
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11AY.390.000025
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11AY.39.20.001541
ORF1ab/nsp2265G265AgGtgCt11AY.40.000002
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11AY.4.30.000842
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11AY.400.000964
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.420.00004
ORF1ab/nsp2265G265RGgTAgG11AY.440.000006
ORF1ab/nsp2265G265AgGtgCt11AY.440.000006
ORF1ab/nsp2265G265HGGTCAC11AY.440.000006
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.460.000104
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.46.30.000934
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt11AY.470.000031
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt11AY.50.000021
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.520.000814
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11AY.570.000656
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11AY.60.000041
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC11AY.60.000041
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt11AY.610.000105
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11AY.610.000105
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11AY.620.000436
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11AY.650.000533
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.660.00107
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11AY.670.000464
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.70.000196
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11AY.710.000475
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11AY.710.000475
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt11AY.740.000116
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11AY.750.000056
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11AY.80.000606
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11AY.840.000437
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11AY.840.000437
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11AY.870.000833
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11AY.880.000884
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11AY.90.000068
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11AY.90.000068
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11AY.930.000273
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11AY.960.002075
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11AY.980.000079
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B0.000128
ORF1ab/nsp2265G265RGgtCgt11B.10.000009
ORF1ab/nsp2265G265del1ggTgg-11B.10.000009
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC11B.10.000009
ORF1ab/nsp2265G265WGgTTgG11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp2265G265RGgTAgG11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp2265G265GggTggA11B.1.1.1940.00495
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11B.1.1.2000.007463
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp2265G265RGgtCgt11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11B.1.1.2160.00089
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.1.2200.001859
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC11B.1.1.2200.001859
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11B.1.1.2300.009174
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.1.2490.071429
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.1.2880.001916
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.1.2970.002237
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.1.3010.001179
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt11B.1.1.3030.002762
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC11B.1.1.3110.000358
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11B.1.1.3260.001761
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11B.1.1.3350.012987
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.1.3690.000446
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp2265G265del1Ggt-gt11B.1.1.3720.000689
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11B.1.1.3740.002375
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.1.3810.04
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.1.3970.002252
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.1.3980.003226
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt11B.1.1.4110.014706
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11B.1.1.4480.002033
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.1.4620.008621
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.1.4860.001577
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11B.1.1.510.001718
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11B.1.1.5260.003546
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11B.1.1.540.003021
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp2265G265del2GGT--N11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp2265G265AgGTgCC11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp2265G265PGGtCCt11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp2265G265FGGtTTt11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.1.80.003584
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.1.990.02381
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11B.1.110.30.000718
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.1150.021739
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.1390.000733
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11B.1.160.160.000929
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.160.260.002421
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.1700.00431
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11B.1.1730.026316
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11B.1.177.120.000152
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.177.180.00116
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.177.230.003236
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.177.230.003236
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.177.330.001645
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.177.350.000691
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt11B.1.177.450.000381
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt11B.1.177.530.002392
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11B.1.177.560.000668
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.177.600.000218
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt11B.1.177.70.000165
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.177.830.001481
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.1990.004132
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp2265G265del1GGT-NN11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.2140.003663
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.214.20.0006
ORF1ab/nsp2265G265GggTggG11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp2265G265RGgTAgG11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11B.1.221.10.002907
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp2265G265RGgtCgt11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp2265G265GggTggG11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.3490.000715
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.351.30.000876
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.36.100.004785
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11B.1.36.160.001425
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.36.220.001208
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11B.1.36.310.001751
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.36.310.001751
ORF1ab/nsp2265G265KGGTAAA11B.1.36.350.002604
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.3670.000792
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.3870.04
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.3880.090909
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11B.1.4090.000781
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt11B.1.4090.000781
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp2265G265FGGtTTt11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt11B.1.4280.00102
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11B.1.4360.001029
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11B.1.438.10.000107
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.4560.003268
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11B.1.4590.004082
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.4620.007246
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.4710.002732
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.5380.008065
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.5510.00129
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11B.1.5600.00463
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11B.1.5610.000397
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.5880.00091
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp2265G265del2GGTA--11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.6190.000871
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.619.10.000641
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.6280.000352
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.1.6340.003425
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11B.1.6360.006711
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.3.10.001658
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11B.310.003731
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.370.028571
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11B.390.002331
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC11B.400.000364
ORF1ab/nsp2265G265SGgtAgt11B.400.000364
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11C.37.10.002618
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC11D.20.000075
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11D.20.000075
ORF1ab/nsp2265G265DgGtgAt11P.10.000016
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC11P.10.000016
ORF1ab/nsp2265G265GggTggC11P.1.100.000269
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11P.1.120.000484
ORF1ab/nsp2265G265CGgtTgt11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp2265G265delGGT---11Q.10.000126
ORF1ab/nsp2265G265VgGtgTt11R.10.00009