CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : CodonNum = 16 & Codon = taT

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp216Y16YY196YsyntaCtaT310331031851-853

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT31033103All0.000593
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT10151015AY.1030.006302
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT251251B.1.1.70.000225
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT228228AY.110.305221
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT216216B.1.6180.870968
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT145145AY.440.000883
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT123123P.1.160.046016
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT113113AY.40.000176
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT106106B.1.6370.007746
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT8181B.1.5750.024575
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT7575B.1.617.20.000282
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT7474P.10.001166
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT4343B.1.5820.021099
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT4141B.1.1.3760.244048
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT3636B.1.20.000317
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT3333B.1.5260.000776
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT3030AY.430.000133
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT2626B.1.6210.002301
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT2424AY.250.000144
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT2323B.1.1.970.676471
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT2121AY.390.000519
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT2121B.1.5950.00548
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT1818B.1.1770.000237
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT1717AY.46.60.001228
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT1717B.1.10.000308
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT1616B.10.000147
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT1212AY.1180.000752
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT1111P.1.120.005324
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT99AP.10.013514
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT99AY.1170.000761
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT99AY.30.00009
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT99B.1.1.2840.000967
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT99B.1.177.120.001365
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT99B.1.3510.000268
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT99B.1.6090.004314
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT77B.400.00255
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT66AY.4.20.00013
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT66B.1.36.380.009852
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT66B.1.6260.034286
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT66P.1.140.000287
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT55AY.140.00044
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT55AY.200.000194
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT55AY.39.10.000198
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT55AY.60.000206
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT55B.1.1.330.002104
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT55B.1.177.600.001092
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT55B.1.4290.000118
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT55B.1.4700.007022
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT44AY.50.000083
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT44B.1.36.10.004561
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT44B.1.3950.028169
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT44B.1.5650.003241
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT44C.370.000464
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT33AY.1020.00008
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT33AY.260.000085
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT33AY.290.000047
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT33AY.470.000093
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT33AY.610.000314
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT33B.1.1600.000094
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT33B.1.2430.000209
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT33B.1.2650.003812
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT33B.1.36.290.001552
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT33B.1.36.350.007812
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT33P.1.20.003468
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT33P.20.00056
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT22A0.000774
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT22AY.1060.00067
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT22AY.1200.000074
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT22AY.330.000134
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT22AY.4.50.000215
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT22AY.46.20.001271
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT22AY.540.000191
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT22AY.880.001768
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT22AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT22B0.000256
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT22B.1.1.1760.000879
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT22B.1.1.280.000622
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT22B.1.177.750.002081
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT22B.1.36.70.008
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT22B.1.4160.002538
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT22B.1.416.10.003125
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT22B.1.4270.000101
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT22B.1.4800.004975
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT22B.1.5610.000794
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT22B.1.617.10.000258
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT22C.360.001821
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11A.2.50.000499
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11AD.20.000219
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11AY.100.00053
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11AY.1080.001103
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11AY.130.000161
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11AY.230.00007
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11AY.240.000431
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11AY.4.10.000737
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11AY.420.00004
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11AY.550.000917
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11AY.580.000907
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11AY.620.000436
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11AY.660.00107
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11AY.680.000274
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11AY.690.000187
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11AY.740.000116
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11AY.940.000443
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11AZ.30.00152
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11B.1.1.1180.010204
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11B.1.1.4860.001577
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11B.1.1420.002899
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11B.1.2100.002132
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11B.1.2180.005155
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11B.1.2600.003344
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11B.1.3910.001127
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11B.1.4030.003268
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11B.1.4060.006061
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11B.1.4250.002994
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11B.1.4590.004082
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11B.1.5090.000866
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11B.1.595.40.007299
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11B.230.002924
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11B.30.000831
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11B.3.10.001658
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11C.320.023256
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11C.350.000774
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11P.1.150.000232
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11Q.30.000145
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11Q.40.000455
ORF1ab/nsp216Y16YtaCtaT11Q.80.000165