CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp2 : CodonNum = 117 & Codon = aCg

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp2117M117TM297TnonsynaTgaCg3073060.9967431154-1156

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg306307All0.000059
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg134134N.50.236749
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg5151B.1.2210.003623
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg2020AY.430.000089
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg1717AY.40.000026
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg99B.10.000082
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg88B.1.1.70.000007
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg55B.1.2580.000333
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg55B.1.617.20.000019
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg44AY.260.000113
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg44AY.440.000024
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg33B.1.1.700.001023
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg22AY.4.20.000043
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg22AY.750.000112
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg22AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg22B0.000256
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg22B.1.1.1410.004024
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg22B.1.1.330.000842
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg22B.1.2430.000139
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg22B.1.575.10.004878
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg22P.10.000032
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg11AY.1010.00049
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg11AY.120.000316
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg11AY.200.000039
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg11AY.230.00007
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg11AY.290.000016
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg11AY.30.00001
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg11AY.340.000097
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg11AY.350.000233
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg11AY.390.000025
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg11AY.46.50.000198
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg11AY.500.000799
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg11AY.610.000105
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg11B.1.1.3260.001761
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg11B.1.1.50.008333
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg11B.1.1040.00369
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg11B.1.221.40.004167
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg11B.310.003731
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg11C.300.001727
ORF1ab/nsp2117M117TaTgaCg11P.1.140.000048