CoV-GLUE | Mutations | Mutation
Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):
ORF | CodonNum | Mut | ORF1abMut | MutType | RefCodon | MutCodon | AACount | CodonCount | CodonProp | Genome Position |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | G295G | syn | ggC | ggT | 5354 | 5319 | 0.993463 | 1148-1150 |
Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):
ORF | CodonNum | Mut | RefCodon | MutCodon | CodonCount | AACount | Lineage | LineageCodonProp |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 5319 | 5354 | All | 0.001017 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1001 | 1007 | B.1.1.7 | 0.000896 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 754 | 754 | P.1 | 0.011879 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 435 | 440 | AY.4 | 0.000677 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 272 | 274 | B.1.617.2 | 0.001024 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 261 | 262 | AY.43 | 0.001156 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 195 | 195 | B.1.1.255 | 0.590909 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 184 | 184 | B.1.1.204 | 0.559271 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 161 | 161 | AY.44 | 0.00098 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 127 | 127 | B.1.415.1 | 0.962121 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 112 | 114 | B.1.2 | 0.000986 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 87 | 87 | AY.103 | 0.00054 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 74 | 74 | B.1.36.18 | 0.031092 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 67 | 67 | AY.3 | 0.000666 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 62 | 65 | B.1.1 | 0.001125 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 58 | 60 | B.1 | 0.000531 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 56 | 56 | AY.26 | 0.001585 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 54 | 54 | B.1.595 | 0.014092 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 51 | 51 | B.1.177 | 0.000672 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 44 | 46 | AY.25 | 0.000265 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 41 | 41 | B.1.389 | 0.041082 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 40 | 40 | B.1.1.318 | 0.01207 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 38 | 38 | AY.98 | 0.003002 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 38 | 38 | B.1.177.82 | 0.018138 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 37 | 37 | B.1.1.70 | 0.012619 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 36 | 36 | AY.46 | 0.003747 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 35 | 35 | AY.29 | 0.000552 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 34 | 34 | AY.4.2 | 0.000737 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 31 | 31 | B.1.427 | 0.001565 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 25 | 26 | AY.39 | 0.000618 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 24 | 24 | B.1.160 | 0.000749 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 24 | 24 | B.1.243 | 0.00167 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 24 | 24 | B.1.351 | 0.000713 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 23 | 23 | B.1.592 | 0.92 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 22 | 22 | AY.118 | 0.001378 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 22 | 22 | AY.3.1 | 0.001876 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 21 | 21 | B.1.258 | 0.001397 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 20 | 20 | R.1 | 0.0018 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 17 | 17 | AY.102 | 0.000451 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 17 | 17 | AY.39.1 | 0.000673 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 17 | 17 | AY.47 | 0.000529 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 16 | 16 | B.1.526 | 0.000376 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 16 | 16 | P.1.12 | 0.007744 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 16 | 16 | P.1.14 | 0.000765 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 15 | 15 | AY.9.1 | 0.001256 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 15 | 15 | B.1.234 | 0.001979 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 15 | 15 | P.2 | 0.0028 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 13 | 13 | AY.42 | 0.000523 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 11 | 12 | AY.20 | 0.000428 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 12 | 12 | AY.75 | 0.000672 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 12 | 12 | B.1.429 | 0.000282 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 11 | 11 | B.1.438.1 | 0.00118 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 10 | 10 | A.23.1 | 0.007042 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 10 | 10 | AY.106 | 0.003349 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 10 | 10 | AY.114 | 0.002311 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 10 | 10 | B.1.1.519 | 0.000397 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 10 | 10 | B.1.298 | 0.021142 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 10 | 10 | B.1.617.1 | 0.00129 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 10 | 10 | P.1.2 | 0.011561 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 5 | 9 | AY.6 | 0.000206 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 9 | 9 | C.37 | 0.001045 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 8 | 8 | AY.10 | 0.00424 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 8 | 8 | AZ.1 | 0.006938 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 8 | 8 | B.1.637 | 0.000585 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 7 | 7 | AY.117 | 0.000592 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 7 | 7 | AY.23 | 0.000488 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 7 | 7 | AY.46.6 | 0.000505 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 7 | 7 | B.1.1.214 | 0.000388 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 7 | 7 | P.1.1 | 0.002224 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 7 | 7 | Q.8 | 0.001154 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 6 | 6 | A.2.5.3 | 0.061856 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 6 | 6 | AY.113 | 0.000854 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 6 | 6 | AY.120 | 0.000223 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 6 | 6 | AY.121 | 0.000812 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 6 | 6 | AY.27 | 0.000388 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 6 | 6 | AY.46.5 | 0.00119 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 6 | 6 | AY.99.2 | 0.000553 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 6 | 6 | B.1.1.50 | 0.004073 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 6 | 6 | B.1.36 | 0.000875 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 6 | 6 | B.1.450 | 0.068182 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 6 | 6 | B.1.596 | 0.000523 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 5 | 5 | AY.100 | 0.00023 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 5 | 5 | AY.105 | 0.003215 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 5 | 5 | AY.45 | 0.000608 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 5 | 5 | AY.5 | 0.000103 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 5 | 5 | B.1.1.231 | 0.01548 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 5 | 5 | B.1.1.306 | 0.002192 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 5 | 5 | B.1.126 | 0.006378 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 5 | 5 | B.1.146 | 0.021186 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 5 | 5 | B.1.241 | 0.004058 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 5 | 5 | B.1.349 | 0.003574 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 5 | 5 | B.1.409 | 0.003906 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 5 | 5 | B.1.595.4 | 0.036496 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 5 | 5 | B.1.621 | 0.000443 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 4 | 4 | A.2.5 | 0.001996 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 4 | 4 | AY.108 | 0.00441 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 4 | 4 | AY.9 | 0.00027 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 4 | 4 | B | 0.000511 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 4 | 4 | B.1.1.317 | 0.001647 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 4 | 4 | B.1.1.37 | 0.000771 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 4 | 4 | B.1.1.398 | 0.012903 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 4 | 4 | B.1.177.44 | 0.002076 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 4 | 4 | B.1.466.2 | 0.001565 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 3 | 3 | AY.116 | 0.00086 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 3 | 3 | AY.119 | 0.000106 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 3 | 3 | AY.16.1 | 0.00141 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 3 | 3 | AY.30 | 0.001187 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 3 | 3 | AY.33 | 0.0002 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 3 | AY.4.5 | 0.000215 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 3 | 3 | AY.79 | 0.003632 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 3 | 3 | B.1.1.216 | 0.002671 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 3 | 3 | B.1.1.220 | 0.005576 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 3 | 3 | B.1.1.28 | 0.000934 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 3 | 3 | B.1.1.311 | 0.001074 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 3 | 3 | B.1.177.21 | 0.000229 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 3 | 3 | B.1.177.86 | 0.00055 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 3 | 3 | B.1.311 | 0.000824 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 3 | 3 | B.1.36.1 | 0.003421 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 3 | 3 | B.1.396 | 0.002117 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 3 | 3 | B.1.400 | 0.001287 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 3 | 3 | B.1.404 | 0.003906 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 3 | 3 | P.1.15 | 0.000697 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 3 | 3 | P.1.17 | 0.000485 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | A.27 | 0.003311 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 2 | AE.8 | 0.000489 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | AY.34 | 0.000194 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | AY.4.2.1 | 0.000298 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | AY.41 | 0.000588 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | AY.5.4 | 0.000553 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | AY.54 | 0.000191 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | AY.59 | 0.001059 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | AY.7.2 | 0.001119 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | AY.89 | 0.009804 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | AY.9.2 | 0.000073 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | AY.99 | 0.002099 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.1.284 | 0.000215 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.1.39 | 0.001019 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.1.406 | 0.012987 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.177.81 | 0.000379 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.189 | 0.008584 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.221.1 | 0.005814 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.240 | 0.000431 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.36.29 | 0.001035 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.369 | 0.00057 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.499 | 0.002101 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.525 | 0.000226 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.564 | 0.000852 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 2 | B.1.599 | 0.00365 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.612 | 0.005305 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.1.621.1 | 0.001012 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.11 | 0.010256 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | B.40 | 0.000729 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | C.16 | 0.002121 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | C.36.3 | 0.001134 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | N.5 | 0.003534 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 2 | 2 | P.1.16 | 0.000748 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | A | 0.000387 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | A.21 | 0.00277 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.107 | 0.000466 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.110 | 0.000113 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.111 | 0.000183 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.14 | 0.000088 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.16 | 0.00038 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.19 | 0.00114 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.24 | 0.000431 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.29.1 | 0.000221 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.35 | 0.000233 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.38 | 0.000499 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.39.1.1 | 0.000725 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.5.3 | 0.000337 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.55 | 0.000917 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.57 | 0.000656 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.61 | 0.000105 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.64 | 0.000595 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.68 | 0.000274 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.70 | 0.000209 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.71 | 0.000475 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.72 | 0.001361 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.85 | 0.000427 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.91 | 0.00073 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.92 | 0.000287 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | AY.93 | 0.000273 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.1 | 0.000327 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.101 | 0.01 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.133 | 0.008475 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.163 | 0.007634 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.189 | 0.001513 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.241 | 0.00207 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.263 | 0.001558 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.286 | 0.002899 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.304 | 0.002809 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.320 | 0.018182 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.333 | 0.001076 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.348 | 0.000796 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.374 | 0.002375 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.392 | 0.052632 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.397 | 0.002252 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.416 | 0.000905 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.420 | 0.001006 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.434 | 0.000349 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.448 | 0.002033 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.1.99 | 0.02381 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.147 | 0.000756 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.160.29 | 0.004219 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.160.30 | 0.002976 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.170 | 0.00431 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.177.10 | 0.000878 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.177.12 | 0.000152 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.177.4 | 0.000211 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.177.7 | 0.000165 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.177.8 | 0.000752 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.201 | 0.005682 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.221 | 0.000071 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.258.9 | 0.005 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.332 | 0.003497 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.336 | 0.002439 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.346 | 0.001311 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.350 | 0.002933 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.408 | 0.00369 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.428.3 | 0.012821 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.441 | 0.009615 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.474 | 0.001901 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.480 | 0.002488 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.511 | 0.034483 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.517 | 0.000427 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.549 | 0.007194 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.554 | 0.004405 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.568 | 0.001111 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.619 | 0.000871 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.625 | 0.002353 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.1.88.1 | 0.004808 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | B.45 | 0.003831 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | C.1 | 0.002392 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | C.13 | 0.025641 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | D.2 | 0.000075 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | K.1 | 0.02381 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | P.1.10 | 0.000269 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | P.1.6 | 0.001946 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | P.4 | 0.003802 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | Q.1 | 0.000126 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | Q.3 | 0.000145 |
ORF1ab/nsp2 | 115 | G115G | ggC | ggT | 1 | 1 | Q.7 | 0.001111 |
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CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk
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