CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp16 : Mut = S33S

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp1633S33SS6831SsynagTagC7587570.99868120755-20757
ORF1ab/nsp1633S33SS6831SsynAGTTCG75810.0013192620755-20757

Details of the mutation S33S within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC757758All0.000145
ORF1ab/nsp1633S33SAGTTCG1758All0
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC465465B.1.1.70.000416
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC118118B.1.1.2430.481633
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC3737B.1.5270.137037
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC2121B.1.6210.001859
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC1818AY.40.000028
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC1313B.1.1.4640.019146
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC88B.1.10.000145
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC77B.1.617.20.000026
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC66B.1.20.000053
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC55AY.1030.000031
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC34AY.430.000013
ORF1ab/nsp1633S33SAGTTCG14AY.430.000004
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC44B.1.3510.000119
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC44B.1.5680.004444
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC33B.10.000027
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC33B.1.1.280.000934
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC33B.1.416.10.004687
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC22AY.34.10.00102
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC22AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC22B.1.4290.000047
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC22B.1.4620.014493
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC22B.1.780.017094
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC11AY.270.000065
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC11AY.290.000016
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC11AY.330.000067
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC11AY.390.000025
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC11AY.420.00004
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC11AY.50.000021
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC11AY.650.000533
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC11AY.980.000079
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC11B.1.1.1610.003534
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC11B.1.1.1920.002309
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC11B.1.1.3090.005848
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC11B.1.1.4320.001266
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC11B.1.1120.005181
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC11B.1.177.350.000691
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC11B.1.177.830.001481
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC11B.1.177.90.001332
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC11B.1.1790.003759
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC11B.1.36.220.001208
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC11B.1.3620.001541
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp1633S33SagTagC11C.370.000116