CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp16 : Mut = N55N

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp1655N55NN6853NsynaaCaaT91049104120821-20823

Details of the mutation N55N within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT91049104All0.001741
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT18961896AY.440.01154
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT15841584B.1.1.70.001418
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT450450R.10.040504
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT340340B.1.1.4170.918919
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT316316B.1.617.20.00119
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT308308AY.430.001365
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT290290B.1.6340.993151
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT274274AY.40.000426
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT265265AY.340.025696
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT236236B.1.20.002078
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT217217AY.250.001305
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT215215AY.470.006688
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT210210B.1.1600.006549
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT149149B.1.4290.003506
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT138138P.10.002174
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT127127AY.290.002003
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT106106B.1.4740.201521
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT7878AY.1030.000484
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT7575B.10.000687
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT7070AY.30.000696
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT7070B.1.3510.002081
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT6060AY.4.20.001301
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT5353C.36.3.10.144022
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT5050B.1.6370.003654
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT4848AY.1180.003007
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT4747P.1.100.012665
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT4343AY.1210.005819
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT4343B.1.177.650.028609
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT4242AY.50.000867
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT3939B.1.1770.000514
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT3838AY.200.001477
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT3737AY.3.10.003155
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT3737B.1.10.000671
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT2828B.1.4270.001414
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT2626AY.1020.000689
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT2525AY.390.000618
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT2525B.1.1.3580.862069
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT2525B.1.1.5190.000993
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT2222AY.760.10628
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT2222B.1.5030.054726
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT2121B.1.1.370.00405
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT2121B.1.177.210.001606
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT2121B.1.6040.362069
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT2020AY.940.008853
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT1919AY.750.001064
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT1919B.1.2890.050532
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT1919B.1.5960.001656
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT1818AY.130.002898
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT1818AY.9.20.000661
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT1818B.1.351.20.005446
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT1818B.1.6280.006342
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT1717AY.740.001966
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT1616B.1.177.40.003377
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT1616B.1.2580.001065
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT1616B.6.21
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT1616P.1.140.000765
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT1515B.1.1.3370.053957
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT1515B.1.5260.000353
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT1414AY.330.000935
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT1414AY.540.001335
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT1313B.1.1.330.005471
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT1313B.1.3490.009292
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT1313B.1.36.360.007827
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT1212AY.350.002797
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT1212AY.420.000483
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT1111AY.99.20.001014
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT1111B.1.177.790.025761
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT1010AY.230.000697
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT1010B.1.1.2440.153846
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT1010B.1.3960.007057
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT99AY.450.001095
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT99B.1.1.3170.003705
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT99B.1.1.3720.006198
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT99B.1.177.600.001966
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT99B.1.258.170.000936
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT99B.1.360.001313
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT99C.370.001045
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT88AY.1000.000368
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT88AY.1170.000676
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT88AY.1190.000282
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT88AY.46.30.00747
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT88B.1.1.2840.000859
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT88B.1.6210.000708
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT88B.1.690.285714
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT88P.20.001493
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT88Q.10.001011
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT77AY.46.60.000505
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT77AY.90.000473
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT77AY.98.10.000339
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT77B.1.2650.008895
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT77B.1.5250.000792
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT77B.1.617.10.000903
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT77D.20.000525
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT66B.1.36.290.003104
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT66B.1.5880.00546
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT55AY.110.006693
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT55AY.260.000142
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT55AY.270.000324
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT55AY.610.000524
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT55AY.620.002179
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT55B.1.1.2140.000277
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT55B.1.1.2770.003794
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT55B.1.1.390.002548
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT55B.1.2210.000355
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT55B.1.2430.000348
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT55C.160.005302
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT44AY.1060.00134
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT44AY.150.008889
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT44AY.39.10.000158
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT44AY.460.000416
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT44AY.75.10.000721
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT44B.1.1.2070.004728
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT44B.1.258.40.013793
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT44B.1.3690.001141
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT44B.1.3750.003279
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT44B.1.4250.011976
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT44B.400.001457
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT33AY.1080.003308
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT33AY.240.001293
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT33AY.29.10.000662
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT33AY.4.50.000322
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT33AY.850.001282
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT33B.1.1.2220.000612
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT33B.1.1.700.001023
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT33B.1.177.690.004451
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT33B.1.214.20.001799
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT33B.1.2340.000396
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT33B.1.243.10.066667
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT33B.1.4110.011111
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT33B.1.5640.001278
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT33P.1.70.000958
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT33Q.30.000435
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22A0.000774
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22A.10.000564
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22A.2.50.000998
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22AE.80.000978
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22AU.20.004843
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22AY.10.000791
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22AY.1110.000366
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22AY.120.000632
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22AY.140.000176
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22AY.160.000759
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22AY.23.10.000835
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22AY.4.10.001475
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22AY.46.40.000329
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22AY.46.50.000397
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22AY.590.001059
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22AY.60.000082
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22AY.7.10.000225
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22AY.980.000158
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22B0.000256
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22B.1.1.2160.001781
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22B.1.1.2200.003717
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22B.1.1.3350.025974
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22B.1.1.4340.000697
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22B.1.1.4640.002946
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22B.1.1.4860.003155
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22B.1.177.860.000367
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22B.1.2980.004228
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22B.1.3400.008584
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22B.1.36.80.002
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22B.1.4000.000858
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22B.1.4040.002604
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22B.1.6250.004706
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22C.360.001821
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22C.36.30.001134
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22C.37.10.005236
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22P.1.150.000465
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT22P.1.20.002312
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT110.055556
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11A.190.009434
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11A.2.20.001689
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11A.270.001656
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AD.20.000219
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AY.1090.00074
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AY.116.10.000311
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AY.190.00114
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AY.300.000396
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AY.4.30.000842
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AY.410.000294
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AY.46.10.001027
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AY.500.000799
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AY.550.000917
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AY.570.000656
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AY.600.000938
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AY.690.000187
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AY.700.000209
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AY.710.000475
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AY.730.000665
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AY.790.001211
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AY.830.001724
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AY.840.000437
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AY.870.000833
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AY.890.004902
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AY.910.00073
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AY.960.002075
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11AZ.20.000821
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.1.1980.001468
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.1.2090.008929
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.1.2190.005
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.1.2260.005814
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.1.2320.001815
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.1.2740.005051
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.1.2800.003086
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.1.2940.001266
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.1.3550.015385
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.1.3710.010417
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.1.4160.000905
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.1.4200.001006
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.1.4330.001425
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.1.540.003021
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.1570.002985
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.177.160.000664
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.177.180.00116
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.177.440.000519
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.177.470.012987
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.177.520.001757
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.177.70.000165
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.177.850.005435
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.177.870.000728
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.2100.002132
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.2360.002053
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.258.110.000396
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.258.30.001675
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.30.002618
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.3020.013333
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.3610.001289
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.3670.000792
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.380.032258
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.3980.002976
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.3990.001934
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.4150.014286
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.4280.00102
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.4450.011765
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.4480.002625
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.4680.005714
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.5000.052632
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.5240.001406
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.5610.000397
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.5750.000303
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.6190.000871
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.1.6200.000946
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.520.010101
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11B.550.00295
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11C.10.002392
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11C.180.002591
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11C.350.000774
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11L.10.001905
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11P.1.120.000484
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11P.1.160.000374
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11P.1.60.001946
ORF1ab/nsp1655N55NaaCaaT11Q.80.000165