CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp16 : Mut = M270L

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp16270M270LM7068LnonsynAtgTtg2021900.94059421466-21468
ORF1ab/nsp16270M270LM7068LnonsynAtgCtg20270.034653521466-21468
ORF1ab/nsp16270M270LM7068LnonsynAtGTtA20220.0099009921466-21468
ORF1ab/nsp16270M270LM7068LnonsynAtGCtA20210.0049504921466-21468
ORF1ab/nsp16270M270LM7068LnonsynAtGCtT20210.0049504921466-21468
ORF1ab/nsp16270M270LM7068LnonsynAtGCtC20210.0049504921466-21468

Details of the mutation M270L within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg190202All0.000036
ORF1ab/nsp16270M270LAtgCtg7202All0.000001
ORF1ab/nsp16270M270LAtGTtA2202All0
ORF1ab/nsp16270M270LAtGCtA1202All0
ORF1ab/nsp16270M270LAtGCtT1202All0
ORF1ab/nsp16270M270LAtGCtC1202All0
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg4747B.1.1770.000619
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg1920B.1.1.70.000017
ORF1ab/nsp16270M270LAtgCtg120B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg1717AY.460.001769
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg1212B.1.10.000218
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg1111B.1.177.750.011446
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg88AY.46.10.008214
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg77B.1.1.3010.008255
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg67B.1.20.000053
ORF1ab/nsp16270M270LAtgCtg17B.1.20.000009
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg56B.10.000046
ORF1ab/nsp16270M270LAtGCtA16B.10.000009
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg66B.1.2580.000399
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg55B.1.177.530.011962
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg55B.1.258.140.004902
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg45B.1.617.20.000015
ORF1ab/nsp16270M270LAtgCtg15B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp16270M270LAtGTtA240.111111
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg240.111111
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg34AY.430.000013
ORF1ab/nsp16270M270LAtGCtC14AY.430.000004
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg33AY.620.001307
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg33B.1.1600.000094
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg22AY.390.000049
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg22AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg22B.610.011494
ORF1ab/nsp16270M270LAtgCtg22P.70.008734
ORF1ab/nsp16270M270LAtGCtT11AY.200.000039
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg11AY.23.10.000417
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg11AY.30.00001
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg11AY.370.000316
ORF1ab/nsp16270M270LAtgCtg11AY.40.000002
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg11AY.4.40.000409
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg11AY.420.00004
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg11AY.440.000006
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp16270M270LAtgCtg11AY.980.000079
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg11B.1.160.300.002976
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg11B.1.177.100.000878
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg11B.1.177.440.000519
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg11B.1.177.520.001757
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg11B.1.177.550.002331
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg11B.1.177.830.001481
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg11B.1.177.880.012346
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg11B.1.36.10.00114
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg11B.1.4160.001269
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg11B.400.000364
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg11C.180.002591
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg11D.20.000075
ORF1ab/nsp16270M270LAtgTtg11P.10.000016