CoV-GLUEGenomeCountriesLineagesMutationsInsertionsDeletionsUpdated:

CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp16 : Mut = M270I

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp16270M270IM7068InonsynatGatT667263510.95188921466-21468
ORF1ab/nsp16270M270IM7068InonsynatGatA66723100.046462821466-21468
ORF1ab/nsp16270M270IM7068InonsynatGatC6672110.0016486821466-21468

Details of the mutation M270I within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT63516672All0.001215
ORF1ab/nsp16270M270IatGatA3106672All0.000059
ORF1ab/nsp16270M270IatGatC116672All0.000002
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT17681768B.1.177.440.917488
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11811188B.1.617.20.004447
ORF1ab/nsp16270M270IatGatA51188B.1.617.20.000019
ORF1ab/nsp16270M270IatGatC21188B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT613615AY.430.002716
ORF1ab/nsp16270M270IatGatA1615AY.430.000004
ORF1ab/nsp16270M270IatGatC1615AY.430.000004
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT244247AY.40.00038
ORF1ab/nsp16270M270IatGatA3247AY.40.000005
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT210210B.1.3050.451613
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT201202B.1.20.00177
ORF1ab/nsp16270M270IatGatC1202B.1.20.000009
ORF1ab/nsp16270M270IatGatA192192B.1.1.2050.713755
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT161161AY.660.172193
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT145148B.1.1.70.00013
ORF1ab/nsp16270M270IatGatA3148B.1.1.70.000003
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT124125AY.440.000755
ORF1ab/nsp16270M270IatGatA1125AY.440.000006
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT104114B.10.000953
ORF1ab/nsp16270M270IatGatA10114B.10.000092
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT113113AY.250.00068
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT113113B.1.1770.001488
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT8888B.1.1.5190.003495
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT8284AY.1210.011096
ORF1ab/nsp16270M270IatGatA284AY.1210.000271
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT7878S.10.386139
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT7475AY.1030.000459
ORF1ab/nsp16270M270IatGatC175AY.1030.000006
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT7070P.1.170.011323
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT6969AY.390.001705
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT6060B.1.3510.001784
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT5758AY.1020.001511
ORF1ab/nsp16270M270IatGatA158AY.1020.000027
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT5656P.10.000882
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT4646B.1.160.300.136905
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT4243B.1.10.000762
ORF1ab/nsp16270M270IatGatA143B.1.10.000018
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT3541AY.290.000552
ORF1ab/nsp16270M270IatGatA641AY.290.000095
ORF1ab/nsp16270M270IatGatA3233P.1.10.010165
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT133P.1.10.000318
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT3131C.10.074163
ORF1ab/nsp16270M270IatGatA2828AY.640.016667
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT2626AY.230.001813
ORF1ab/nsp16270M270IatGatA1426AY.30.000139
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT1226AY.30.000119
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT2323B.1.4290.000541
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT2020B.1.360.002918
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT1516AY.460.001561
ORF1ab/nsp16270M270IatGatA116AY.460.000104
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT1616B.1.4710.043716
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT1616B.1.4970.005036
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT1314B.1.5960.001133
ORF1ab/nsp16270M270IatGatC114B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT1313AY.1180.000814
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT1313AY.1190.000459
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT1313AY.120.004109
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT1313AY.200.000505
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT1212B.1.5260.000282
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT1111AY.9.20.000404
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT1111B.1.1600.000343
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT99B0.00115
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT99B.1.1.3480.007166
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT99B.1.617.10.001161
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT88AY.1200.000297
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT88AY.50.000165
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT88B.1.1.2800.024691
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT77AY.4.20.000152
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT77AY.450.000852
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT77AY.610.000733
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT77B.1.1.250.00398
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT67B.1.2340.000792
ORF1ab/nsp16270M270IatGatC17B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT77P.1.150.001626
ORF1ab/nsp16270M270IatGatA460.222222
ORF1ab/nsp16270M270IatGatC260.111111
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT66AY.1170.000507
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT66B.1.36.160.008547
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT66B.1.4700.008427
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT66Q.30.00087
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT55AY.420.000201
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT55AY.46.60.000361
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT55AY.5.40.001384
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT55AY.540.000477
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT55AY.780.007704
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT55B.1.1.2140.000277
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT55B.1.1.390.002548
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT55B.1.258.170.00052
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT55B.1.351.20.001513
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT55B.1.6370.000365
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT34B.1.2430.000209
ORF1ab/nsp16270M270IatGatA14B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT44B.1.2580.000266
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT33AY.1100.000338
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT33AY.1160.00086
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT33AY.120.2.10.001495
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT33AY.320.001597
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT33AY.590.001589
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT33AY.600.002814
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT33B.1.1.10.00098
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT33B.1.1.2220.000612
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT33B.1.1.3060.001315
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT33B.1.1.3180.000905
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT33B.1.1.470.016043
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT33B.1.2210.000213
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT33B.1.2350.007557
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT33B.1.5250.000339
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT33C.370.000348
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT23P.20.000373
ORF1ab/nsp16270M270IatGatC13P.20.000187
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22A0.000774
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22AY.1080.002205
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22AY.130.000322
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22AY.340.000194
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22AY.46.30.001867
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22AY.470.000062
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22AY.480.00093
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22AY.580.001815
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22AY.60.000082
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT12AY.650.000533
ORF1ab/nsp16270M270IatGatA12AY.650.000533
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22AY.7.10.000225
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22AY.840.000875
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22AY.920.000575
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22B.1.1.280.000622
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22B.1.1.2980.001724
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22B.1.1.330.000842
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT12B.1.1.3980.003226
ORF1ab/nsp16270M270IatGatA12B.1.1.3980.003226
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22B.1.1.500.001358
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22B.1.1570.00597
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22B.1.177.310.022989
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22B.1.177.730.001133
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22B.1.2400.000431
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22B.1.36.290.001035
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22B.1.4000.000858
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22B.1.4520.027397
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22B.1.5950.000522
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT12B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp16270M270IatGatA12B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22B.1.6210.000177
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22B.1.621.10.001012
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22B.1.6280.000705
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22B.1.6310.006734
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22B.400.000729
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22D.20.00015
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22N.50.003534
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22P.1.140.000096
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT22P.1.17.10.00175
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11A.50.001923
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11AD.20.000219
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11AY.100.00053
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11AY.1050.000643
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11AY.1060.000335
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11AY.1140.000231
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11AY.190.00114
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11AY.270.000065
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11AY.330.000067
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11AY.4.40.000409
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11AY.520.000814
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11AY.620.000436
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11AY.870.000833
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11AY.880.000884
ORF1ab/nsp16270M270IatGatC11AY.90.000068
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11AY.910.00073
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11AY.990.001049
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.1.100.001115
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.1.1350.004695
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.1.1570.000913
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.1.1890.001513
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.1.2160.00089
ORF1ab/nsp16270M270IatGatA11B.1.1.2180.007692
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.1.2310.003096
ORF1ab/nsp16270M270IatGatA11B.1.1.3050.003861
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.1.3430.020833
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.1.3890.006061
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.1.4040.015873
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.1.4320.001266
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.1.5210.005348
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.1.540.003021
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.1.570.011494
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.1.610.008772
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.1110.001175
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.160.250.011111
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.177.230.003236
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.177.430.001477
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.177.50.001242
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.177.600.000218
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.177.650.000665
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.177.750.001041
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.2360.002053
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.3010.005917
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.3490.000715
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.3710.001122
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.4160.001269
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.416.10.001563
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.438.10.000107
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.5170.000427
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.5330.009615
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.5460.003704
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.5640.000426
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.5650.00081
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.5770.000687
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11B.1.6300.005236
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11C.180.002591
ORF1ab/nsp16270M270IatGatT11Q.80.000165

CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk

CoV-GLUE uses sequence data from GISAID. GISAID data provided via this web application is subject to GISAID's Terms and Conditions.