CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp16 : Mut = M20I

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp1620M20IM6818InonsynatGatT14419143120.99257920716-20718
ORF1ab/nsp1620M20IM6818InonsynatGatA14419970.0067272320716-20718
ORF1ab/nsp1620M20IM6818InonsynatGatC14419100.00069352920716-20718

Details of the mutation M20I within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT1431214419All0.002737
ORF1ab/nsp1620M20IatGatA9714419All0.000019
ORF1ab/nsp1620M20IatGatC1014419All0.000002
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT1136111362AY.140.999912
ORF1ab/nsp1620M20IatGatA111362AY.140.000088
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT434440B.1.1.70.000389
ORF1ab/nsp1620M20IatGatA5440B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp1620M20IatGatC1440B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT351374B.1.617.20.001322
ORF1ab/nsp1620M20IatGatA23374B.1.617.20.000087
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT284287AY.40.000442
ORF1ab/nsp1620M20IatGatA3287AY.40.000005
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT184185B.1.2210.01307
ORF1ab/nsp1620M20IatGatC1185B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT172173AY.440.001047
ORF1ab/nsp1620M20IatGatA1173AY.440.000006
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT9191AY.540.008677
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT8484AY.250.000505
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT8080AY.190.09122
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT7980AY.430.00035
ORF1ab/nsp1620M20IatGatC180AY.430.000004
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT7373AY.380.036445
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT6767AY.50.001383
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT5759AY.1030.000354
ORF1ab/nsp1620M20IatGatA259AY.1030.000012
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT5454AY.260.001529
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT5050AY.980.00395
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT4040AY.330.002671
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT4040AY.640.02381
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT3434AY.130.005473
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT3134B.10.000284
ORF1ab/nsp1620M20IatGatC234B.10.000018
ORF1ab/nsp1620M20IatGatA134B.10.000009
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT3232B.1.4290.000753
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT2931B.1.10.000526
ORF1ab/nsp1620M20IatGatA231B.1.10.000036
ORF1ab/nsp1620M20IatGatA2828C.36.10.116183
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT2425AY.30.000239
ORF1ab/nsp1620M20IatGatA125AY.30.00001
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT2425B.1.177.40.005065
ORF1ab/nsp1620M20IatGatA125B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT2424AY.470.000747
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT2323B.1.360.003356
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT2222B.1.3510.000654
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT2121AY.620.00915
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT2020AY.200.000777
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT2020B.1.20.000176
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT2020P.10.000315
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT1717B.1.2340.002243
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT1717B.1.5260.0004
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT1015B.1.1770.000132
ORF1ab/nsp1620M20IatGatA415B.1.1770.000053
ORF1ab/nsp1620M20IatGatC115B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp1620M20IatGatA1114AY.1000.000506
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT314AY.1000.000138
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT1414AY.480.006512
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT1414AY.510.012727
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT1414AY.650.007463
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT1313AY.780.020031
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT1112AY.1180.000689
ORF1ab/nsp1620M20IatGatA112AY.1180.000063
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT1212B.1.4270.000606
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT1111AY.4.20.000239
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT1111AY.750.000616
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT1111AY.75.10.001983
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT99AY.1020.000239
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT99AY.120.10.002889
ORF1ab/nsp1620M20IatGatA59AY.390.000124
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT49AY.390.000099
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT99AY.46.60.00065
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT99AY.610.000943
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT99B.1.258.170.000936
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT88B.1.3690.002282
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT88B.1.5250.000905
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT77AY.340.000679
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT77AY.4.30.005892
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT67P.1.140.000287
ORF1ab/nsp1620M20IatGatC17P.1.140.000048
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT66AY.1170.000507
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT66AY.230.000418
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT66AY.490.019169
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT66AY.520.004886
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT66AY.680.001642
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT66AY.99.20.000553
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT66B.1.2430.000418
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT66P.1.120.002904
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT55AY.16.10.00235
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT45AY.420.000161
ORF1ab/nsp1620M20IatGatC15AY.420.00004
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT55AY.810.00996
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT44AY.1160.001147
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT44AY.1200.000149
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT44AY.500.003197
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT44AY.590.002119
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT44AY.770.00451
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT44AY.9.20.000147
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT44B.1.1.3060.001754
ORF1ab/nsp1620M20IatGatA24B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT24B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT44B.1.617.10.000516
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT44P.1.100.001078
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT33A.23.10.002113
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT33AY.1140.000693
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT33AY.1190.000106
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT33AY.160.001139
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT33AY.290.000047
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT33AY.450.000365
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT33AY.60.000123
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT33AY.660.003209
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT33AY.860.00249
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT33AY.870.002498
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT33B.1.1.2220.000612
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT33B.1.1.5190.000119
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT33B.1.1.700.001023
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT33B.1.2400.000647
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT33P.1.160.001122
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT33Q.80.000495
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT22AY.1210.000271
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT22AY.240.000862
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT12AY.270.000065
ORF1ab/nsp1620M20IatGatA12AY.270.000065
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT22AY.300.000791
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT22AY.4.2.10.000298
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT22AY.4.50.000215
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT12AY.460.000104
ORF1ab/nsp1620M20IatGatC12AY.460.000104
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT22AY.5.40.000553
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT22AY.550.001835
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT22AY.560.00321
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT22AY.580.001815
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT22AY.670.000929
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT22AY.710.00095
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT22AY.840.000875
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT22AY.850.000854
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT22AY.90.000135
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT22AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT22B0.000256
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT22B.1.1.330.000842
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT22B.1.1660.016949
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT22B.1.177.830.002963
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT22B.1.466.20.000782
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT22B.1.5960.000174
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT22C.370.000232
ORF1ab/nsp1620M20IatGatA110.055556
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11A.2.50.000499
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11A.2.5.20.001572
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11AY.100.00053
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11AY.1010.00049
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11AY.1060.000335
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11AY.120.000316
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11AY.120.20.001285
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11AY.210.001898
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11AY.23.10.000417
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11AY.320.000532
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11AY.400.000964
ORF1ab/nsp1620M20IatGatA11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11AY.630.000387
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11AY.70.000196
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11AY.700.000209
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11AY.720.001361
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11AY.730.000665
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11AY.740.000116
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11AY.900.000684
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11AY.910.00073
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11AY.91.10.004065
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11AY.920.000287
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11AY.930.000273
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11AY.950.000761
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11AY.990.001049
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11AY.99.10.001553
ORF1ab/nsp1620M20IatGatA11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11B.1.1.1480.008772
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11B.1.1.1620.029412
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11B.1.1.3160.000925
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11B.1.1.3260.001761
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11B.1.1.3310.011628
ORF1ab/nsp1620M20IatGatA11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11B.1.1.4340.000349
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11B.1.1.4870.005587
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11B.1.1.5180.006329
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11B.1.1.930.025641
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11B.1.160.160.000929
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11B.1.177.650.000665
ORF1ab/nsp1620M20IatGatC11B.1.177.770.000726
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11B.1.351.30.000876
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11B.1.3990.001934
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11B.1.4970.000315
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11B.1.5330.009615
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11B.1.619.10.000641
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11C.20.016129
ORF1ab/nsp1620M20IatGatA11N.40.004255
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11P.20.000187
ORF1ab/nsp1620M20IatGatT11Q.10.000126