CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp16 : CodonNum = 128 & Codon = Gtt

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp16128I128VI6926VnonsynAttGtt651651121040-21042

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt651651All0.000125
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt131131AY.40.000204
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt119119B.1.1.70.000107
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt5858B.1.617.20.000218
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt4444AY.1030.000273
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt3737AY.440.000225
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt1616B.1.160.280.046784
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt1616B.1.5260.000376
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt1515AY.1200.000558
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt1515B.1.10.000272
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt1212AY.430.000053
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt1212AY.46.50.002381
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt1111AY.250.000066
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt1111B.1.1.5190.000437
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt1111B.1.1040.04059
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt1010AY.98.10.000484
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt1010B.1.2210.00071
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt99B.1.177.810.001704
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt88B.1.20.00007
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt66P.10.000095
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt55AY.270.000324
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt55AY.420.000201
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt55B.1.1.3040.014045
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt55B.1.4290.000118
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt44AY.30.00004
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt44AY.750.000224
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt44B.10.000037
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt44B.1.1.330.001684
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt33AY.1040.005952
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt33AY.290.000047
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt33AY.4.50.000322
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt33B.1.617.10.000387
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt22AY.330.000134
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt22AY.39.10.000079
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt22AY.460.000208
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt22AY.50.000041
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt22AY.630.000774
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt22AY.99.20.000184
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt22B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt22P.20.000373
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11AW.10.003049
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11AY.120.10.000321
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11AY.200.000039
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11AY.360.000148
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11AY.390.000025
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11AY.4.40.000409
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11AY.470.000031
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11AY.640.000595
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11AY.850.000427
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11AY.870.000833
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11AY.980.000079
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11B0.000128
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11B.1.1.1610.003534
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11B.1.177.120.000152
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11B.1.2790.000514
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11B.1.36.380.001642
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11B.1.4590.004082
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11B.1.4700.001404
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11B.1.5750.000303
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11B.1.5760.000907
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11B.1.6280.000352
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11B.6.60.000889
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11C.370.000116
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11L.30.003546
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11N.90.005952
ORF1ab/nsp16128I128VAttGtt11Q.10.000126