CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp16 : CodonNum = 118

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp16118V118VV6916VsyngtAgtC11739170.78175621010-21012
ORF1ab/nsp16118V118VV6916VsyngtAgtG11732470.21057121010-21012
ORF1ab/nsp16118V118VV6916VsyngtAgtT117390.0076726321010-21012
ORF1ab/nsp16118V118LV6916LnonsynGtaTta113511340.99911921010-21012
ORF1ab/nsp16118V118LV6916LnonsynGtaCta113510.00088105721010-21012
ORF1ab/nsp16118V118IV6916InonsynGtaAta221221121010-21012
ORF1ab/nsp16118V118delV6916deldelGTA---5050121010-21012
ORF1ab/nsp16118V118FV6916FnonsynGtATtT1060.621010-21012
ORF1ab/nsp16118V118FV6916FnonsynGtATtC1040.421010-21012
ORF1ab/nsp16118V118AV6916AnonsyngTagCa99121010-21012
ORF1ab/nsp16118V118GV6916GnonsyngTagGa740.57142921010-21012
ORF1ab/nsp16118V118GV6916GnonsyngTAgGT730.42857121010-21012
ORF1ab/nsp16118V118CV6916CnonsynGTATGT33121010-21012
ORF1ab/nsp16118V118XV6916XnonsynGTaTGa33121010-21012
ORF1ab/nsp16118V118del1V6916del1delGta-ta310.33333321010-21012
ORF1ab/nsp16118V118del1V6916del1delgTag-a310.33333321010-21012
ORF1ab/nsp16118V118del1V6916del1delgtAgt-310.33333321010-21012
ORF1ab/nsp16118V118del2V6916del2delgTAg--11121010-21012

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtC9171173All0.000175
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG2471173All0.000047
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtT91173All0.000002
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11341135All0.000217
ORF1ab/nsp16118V118LGtaCta11135All0
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtC9121015B.1.1.70.000816
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG1031015B.1.1.70.000092
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta221221All0.000042
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta204204B.1.1.70.000183
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta203203AY.330.013556
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta102102B.1.617.20.000384
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta9191AY.750.005098
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG5959AY.1060.019759
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta5353AY.40.000082
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta5353AY.430.000235
ORF1ab/nsp16118V118delGTA---5050All0.00001
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta4747B.1.5620.87037
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta4646B.1.20.000405
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta2929AY.1030.00018
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta2424AY.1130.003417
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta2020AY.440.000122
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta2020B.1.1.70.000018
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta1818AY.40.000028
ORF1ab/nsp16118V118delGTA---1717B.1.1.70.000015
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta1616AY.1180.001002
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta1616B.1.36.80.016
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta1616B.1.4290.000376
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta1515AY.430.000066
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta1515AY.440.000091
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta1515B.10.000137
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta1414AY.1020.000371
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta1414AY.1200.000521
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta1314AY.250.000078
ORF1ab/nsp16118V118LGtaCta114AY.250.000006
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta1313B.10.000119
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG1212B.1.5960.001046
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta1111AY.230.000767
ORF1ab/nsp16118V118FGtATtT610All0.000001
ORF1ab/nsp16118V118FGtATtC410All0.000001
ORF1ab/nsp16118V118AgTagCa99All0.000002
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta99AY.1030.000056
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta99AY.390.000222
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta99AY.46.50.001786
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG99B.1.6050.053571
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta99P.10.000142
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta88B.1.10.000145
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtT570.277778
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG270.111111
ORF1ab/nsp16118V118GgTagGa47All0.000001
ORF1ab/nsp16118V118GgTAgGT37All0.000001
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta77AY.420.000282
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta77AY.50.000145
ORF1ab/nsp16118V118FGtATtT660.333333
ORF1ab/nsp16118V118GgTAgGT360.166667
ORF1ab/nsp16118V118GgTagGa360.166667
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta66AY.1190.000212
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG66AY.39.10.000238
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta66AY.46.60.000433
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta66AY.590.003178
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta66AY.98.10.000291
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta66B.1.617.10.000774
ORF1ab/nsp16118V118delGTA---55AY.250.00003
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta55AY.250.00003
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG55AY.250.00003
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG55AY.4.20.000108
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta55AY.470.000156
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta55AY.610.000524
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta55AY.90.000338
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta55B.1.1770.000066
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta55B.1.2340.00066
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta440.222222
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta44AY.420.000161
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta44AY.46.40.000658
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta44B.1.1.1530.004381
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta44B.1.1.250.002274
ORF1ab/nsp16118V118FGtATtC44B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta44B.1.1600.000125
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta44B.1.3490.002859
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG44B.1.4090.003125
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta44B.1.617.20.000015
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta44C.370.000464
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG44P.1.20.004624
ORF1ab/nsp16118V118XGTaTGa330.166667
ORF1ab/nsp16118V118CGTATGT330.166667
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta33A.2.50.001497
ORF1ab/nsp16118V118XGTaTGa33All0.000001
ORF1ab/nsp16118V118CGTATGT33All0.000001
ORF1ab/nsp16118V118del1gtAgt-13All0
ORF1ab/nsp16118V118del1gTag-a13All0
ORF1ab/nsp16118V118del1Gta-ta13All0
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta33AY.1070.001398
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta33AY.200.000117
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta33AY.200.000117
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta33AY.230.000209
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta33AY.390.000074
ORF1ab/nsp16118V118delGTA---33AY.40.000005
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG33AY.40.000005
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG23AY.430.000009
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtC13AY.430.000004
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta33AY.570.001969
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta33AY.980.000237
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG33B.1.10.000054
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta33B.1.1.2840.000322
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta33B.1.1.5190.000119
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG33B.1.2580.0002
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta33B.1.2580.0002
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG23B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtT13B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp16118V118delGTA---33P.1.150.000697
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtC33Q.10.000379
ORF1ab/nsp16118V118delGTA---220.111111
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG22A0.000774
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta22AY.1020.000053
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG22AY.1180.000125
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta22AY.1200.000074
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta22AY.30.00002
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta22AY.30.00002
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG22AY.360.000296
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta22AY.39.10.000079
ORF1ab/nsp16118V118delGTA---22AY.4.50.000215
ORF1ab/nsp16118V118delGTA---22AY.430.000009
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta22AY.450.000243
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta22AY.46.60.000144
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta22AY.470.000062
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta22AY.60.000082
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta22AY.650.001066
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta22AY.690.000373
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta22AY.750.000112
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta22AY.800.002257
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta22AY.950.001522
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtT12B.10.000009
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG12B.10.000009
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta22B.1.1.2940.002532
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG22B.1.177.600.000437
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta22B.1.2210.000142
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta22B.1.3110.000549
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta22B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta22B.1.3750.001639
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta22B.1.3960.001411
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta22B.1.4290.000047
ORF1ab/nsp16118V118delGTA---22B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta22P.10.000032
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta22Q.10.000253
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11A.10.000282
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtC11A.20.000662
ORF1ab/nsp16118V118AgTagCa11A.2.40.003367
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11A.23.10.000704
ORF1ab/nsp16118V118delGTA---11AD.20.000219
ORF1ab/nsp16118V118del2gTAg--11All0
ORF1ab/nsp16118V118del1gtAgt-11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp16118V118AgTagCa11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11AY.1080.001103
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp16118V118delGTA---11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp16118V118AgTagCa11AY.130.000161
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11AY.130.000161
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11AY.240.000431
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta11AY.270.000065
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta11AY.290.000016
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp16118V118delGTA---11AY.330.000067
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11AY.340.000097
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11AY.350.000233
ORF1ab/nsp16118V118delGTA---11AY.360.000148
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG11AY.390.000025
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11AY.4.40.000409
ORF1ab/nsp16118V118AgTagCa11AY.440.000006
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta11AY.50.000021
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtT11AY.50.000021
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11AY.520.000814
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11AY.540.000095
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta11AY.70.000196
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11AY.710.000475
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG11AY.740.000116
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11AY.840.000437
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11AY.860.00083
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11AY.900.000684
ORF1ab/nsp16118V118delGTA---11B.10.000009
ORF1ab/nsp16118V118AgTagCa11B.10.000009
ORF1ab/nsp16118V118del1Gta-ta11B.10.000009
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp16118V118AgTagCa11B.1.1.3720.000689
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11B.1.1.500.000679
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp16118V118del1gTag-a11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp16118V118AgTagCa11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp16118V118delGTA---11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp16118V118AgTagCa11B.1.160.120.00641
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11B.1.160.300.002976
ORF1ab/nsp16118V118del2gTAg--11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11B.1.177.440.000519
ORF1ab/nsp16118V118delGTA---11B.1.177.620.001192
ORF1ab/nsp16118V118delGTA---11B.1.177.70.000165
ORF1ab/nsp16118V118GgTagGa11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp16118V118delGTA---11B.1.177.90.001332
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtT11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp16118V118delGTA---11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG11B.1.3260.007576
ORF1ab/nsp16118V118AgTagCa11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp16118V118delGTA---11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11B.1.3610.001289
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11B.1.4220.000812
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11B.1.4530.003236
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11B.1.4560.003268
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11B.1.4990.00105
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11B.1.5030.002488
ORF1ab/nsp16118V118delGTA---11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp16118V118delGTA---11B.1.6200.000946
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11B.400.000364
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11C.10.002392
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11C.20.016129
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta11D.20.000075
ORF1ab/nsp16118V118LGtaTta11P.1.17.10.000875
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta11Q.10.000126
ORF1ab/nsp16118V118delGTA---11Q.20.000613
ORF1ab/nsp16118V118IGtaAta11R.10.00009
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG11R.10.00009
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG11U.10.012821
ORF1ab/nsp16118V118VgtAgtG11W.40.001351