CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp15A1-B : Mut = M218del1

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1M6670del1delatGat-1061030.97169820272-20274
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1M6670del1delAtg-tg10620.018867920272-20274
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1M6670del1delAtG-tT10610.0094339620272-20274

Details of the mutation M218del1 within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1atGat-103106All0.00002
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1Atg-tg2106All0
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1AtG-tT1106All0
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1atGat-4343B.1.10.00078
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1atGat-1313B.400.004736
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1atGat-99B.10.000082
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1atGat-55B0.000639
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1atGat-55B.1.3910.005637
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1atGat-33B.1.1.2130.065217
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1atGat-22B.1.1.100.00223
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1atGat-22B.1.1.30.017391
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1atGat-12B.1.20.000009
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1AtG-tT12B.1.20.000009
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1atGat-22B.310.007463
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1atGat-11A.50.001923
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1Atg-tg11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1atGat-11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1atGat-11B.1.1.1640.005155
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1atGat-11B.1.1.2570.009709
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1atGat-11B.1.1.2790.001121
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1atGat-11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1atGat-11B.1.1.80.003584
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1atGat-11B.1.1.890.006061
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1atGat-11B.1.1050.009615
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1atGat-11B.1.1170.0125
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1atGat-11B.1.130.002375
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1atGat-11B.1.1570.002985
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1Atg-tg11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1atGat-11B.1.4000.000429
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1atGat-11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1atGat-11B.1.930.000934
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1atGat-11B.30.000831
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1atGat-11B.600.015873
ORF1ab/nsp15A1-B218M218del1atGat-11B.610.005747